中国农业科学 ›› 2004, Vol. 37 ›› Issue (03): 322-322 .

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基因组水平上水稻受体激酶基因家族的生物信息学分析

@孙学辉$中国农业科学院生物技术研究所!北京100081 @路铁刚$中国农业科学院生物技术研究所!北京100081 @贾士荣$中国农业科学院生物技术研究所!北京100081 @黄大昉$中国农业科学院生物技术研究所!北京100081   

  • 出版日期:2004-03-20 发布日期:2004-03-20

  • Online:2004-03-20 Published:2004-03-20

摘要: 对已完成全序列分析的籼稻(北京基因组信息中心,BGI)和接近完成全序列分析的粳稻(国际水稻基因组测序计划,IRGSP)的蛋白质数据库进行两步HMM(hidden markov model)模式匹配搜寻,在基因组水平上分别获得籼稻和粳稻受体激酶5个基因家族的成员序列共643和701个,对粳稻受体激酶进行了详细的生物信息学分析。对粳稻和籼稻的同源比较分析表明,受体激酶基因存在非常强的保守性,但不同基因在基因组水平上可能存在不同水平的扩增。对Swissprot数据库的同源分析表明,这些基因是植物特有的受体激酶。搜

关键词: 水稻, 生物信息学, 受体激酶, 基因家族, EST

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