中国农业科学 ›› 2004, Vol. 37 ›› Issue (01): 1-1 .

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水稻中富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点(LRR-NBS)基因家族的生物信息学分析

@孙学辉$中国农业科学院生物技术研究所!北京100081@路铁刚$中国农业科学院生物技术研究所!北京100081 @贾士荣$中国农业科学院生物技术研究所!北京100081 @黄大昉$中国农业科学院生物技术研究所!北京100081   

  • 出版日期:2004-01-20 发布日期:2004-01-20

  • Online:2004-01-20 Published:2004-01-20

摘要: 采用HMM(HiddenMarkovModel) ,对源于日本晴的粳稻 (国际水稻测序计划 ,IRGSP)基因组和 9311的籼稻基因组 (北京华大 ,BGI)的蛋白质数据库进行了搜索 ,分别获得了 32 5和 344个富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点 (leucinerichrepeat-nucleotidebindingsite ,LRR -NBS)类的抗病基因的蛋白序列 ,并得到了与这些蛋白相应的cDNA序列。对粳稻蛋白功能结构域的分析表明 ,多个蛋白具有与植物防卫反应相关的结构域 ,还发现多个蛋

关键词: 水稻, 生物信息学, 抗病基因, 基因家族, LRR-NBS

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