粳稻品种SSR多态性检出率的分析

中国农业科学 ›› 2005, Vol. 38 ›› Issue (12): 2549-2554 .

粳稻品种SSR多态性检出率的分析

鲍根良,富田桂,小林麻子,骆荣挺,张小明,王俊敏,叶胜海

浙江省农业科学院

收稿日期:2004-08-30 修回日期:2005-09-23 出版日期:2005-12-10 发布日期:2005-12-10
通讯作者: 鲍根良

Analysis on SSR Polymorphisms of Japonica Rice Varieties

,,,,,,

浙江省农业科学院

Received:2004-08-30 Revised:2005-09-23 Online:2005-12-10 Published:2005-12-10

摘要/Abstract

摘要： 用395对SSR引物测得多态性检出率：日本近缘品种（粳型）间为11.12%，日本近缘品种与意大利品种（粳型）间、与美国品种（籼型）间及与菲律宾品种（籼型）间分别为17.58%、20.80%和38.62%，显示相同粳稻生态型品种间多态性检出率低于不同生态型品种间，而相同粳稻生态型内，日本近缘品种间的多态性检出率更低。在日本近缘品种中，不同品种间多态性检出率差异较大，其变幅为3.79~15.95%。此外，不同染色体间引物的多态性检出率也存在较大差异，其中第10染色体的供试引物多态性检出率无论在不同生态型品种间或相同生态型品种间均最低。

关键词: 粳稻, 近缘品种, SSR分析, 多态性, 检出率

Abstract: 395 SSR (Simple sequence repeats) primer pairs were used to analyze 16 Japonica and Indica rice varieties. The result showed that the polymorphisms detected were 11.12% among Japanese closely related varieties (JCRV，Japonica), 17.58% between JCRV and Italy varieties (Japonica), 20.80% between JCRV and America varieties (Indica) and 38.62% between JCRV and Philippines varieties (Indica). It implied that polymorphisms were lower among identical Japonica type varieties than between different ecological type varieties, and lowest among JCRV in the identical Japonica type varieties. However, polymorphisms were obviously different among JCRV, variance ranges of that were from 3.79% to 15.95%. Furthermore, there were significant differences in polymorphisms among various chromosomes as well; the polymorphisms of SSR markers in tenth chromosomes were always lowest among any type varieties.

Key words: Japonica rice, Closely related variety, SSR analysis, Polymorphism, Detected rate

鲍根良,富田桂,小林麻子,骆荣挺,张小明,王俊敏,叶胜海. 粳稻品种SSR多态性检出率的分析[J]. 中国农业科学, 2005, 38(12): 2549-2554 .

,,,,,,. Analysis on SSR Polymorphisms of Japonica Rice Varieties[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2005, 38(12): 2549-2554 .

0
/ / 推荐

导出引用管理器 EndNote|Reference Manager|ProCite|BibTeX|RefWorks

链接本文: https://www.chinaagrisci.com/CN/

https://www.chinaagrisci.com/CN/Y2005/V38/I12/2549

[1]	林萍, 王开良, 姚小华, 任华东. 基于转录组SNP构建油茶主要品种资源的分子身份证[J]. 中国农业科学, 2023, 56(2): 217-235.
[2]	朱大伟,章林平,陈铭学,方长云,于永红,郑小龙,邵雅芳. 中国优质稻品种品质及食味感官评分值的特征[J]. 中国农业科学, 2022, 55(7): 1271-1283.
[3]	赵春芳,赵庆勇,吕远大,陈涛,姚姝,赵凌,周丽慧,梁文化,朱镇,王才林,张亚东. 半糯粳稻品种核心标记的筛选及DNA指纹图谱的构建[J]. 中国农业科学, 2022, 55(23): 4567-4582.
[4]	赵黎明,黄安琪,王亚新,蒋文鑫,周行,沈雪峰,冯乃杰,郑殿峰. 连续旋耕下深耕对寒地优质粳稻产量形成的影响[J]. 中国农业科学, 2022, 55(22): 4550-4566.
[5]	邵小龙,徐文,王潇,杨晓静,沈飞,刘琴. 3种粳稻籽粒水分解吸过程中的裂纹变化[J]. 中国农业科学, 2022, 55(2): 390-402.
[6]	李晓川,王朝海,周平,马维,吴瑞,宋治豪,梅艳. 马铃薯品种（系）田间晚疫病抗性评价和全基因组遗传多样性分析[J]. 中国农业科学, 2022, 55(18): 3484-3500.
[7]	朱春艳,宋佳伟,白天亮,王娜,马帅国,普正菲,董艳,吕建东,李杰,田蓉蓉,罗成科,张银霞,马天利,李培富,田蕾. NaCl胁迫对不同耐盐性粳稻种质幼苗叶绿素荧光特性的影响[J]. 中国农业科学, 2022, 55(13): 2509-2525.
[8]	梁鹏,张天闻,孟科,邵顺成,邹诗凡,荣轩,强浩,冯登侦. 绵羊ADIPOQ多态性与生长性状的关联分析[J]. 中国农业科学, 2022, 55(11): 2239-2256.
[9]	邓艾兴,刘猷红,孟英,陈长青,董文军,李歌星,张俊,张卫建. 田间增温1.5℃对高纬度粳稻产量和品质的影响[J]. 中国农业科学, 2022, 55(1): 51-60.
[10]	吴云雨,肖宁,余玲,蔡跃,潘存红,李育红,张小祥,黄年生,季红娟,戴正元,李爱宏. 长江下游粳稻稻瘟病广谱抗性基因组合模式分析[J]. 中国农业科学, 2021, 54(9): 1881-1893.
[11]	许志英,王佰翠,马晓兰,贾子苗,叶兴国,林志珊,胡汉桥. 基于小麦SNP芯片对簇毛麦6V#2和6V#4染色体及其与小麦6A、6D染色体的多态性分析[J]. 中国农业科学, 2021, 54(8): 1579-1589.
[12]	马会珍,陈心怡,王志杰,朱盈,蒋伟勤,任高磊,马中涛,魏海燕,张洪程,刘国栋. 中国部分优质粳稻外观及蒸煮食味品质特征比较[J]. 中国农业科学, 2021, 54(7): 1338-1353.
[13]	许方甫,卞金龙,韩超,陈志青,刘国栋,邢志鹏,胡雅杰,魏海燕,张洪程. 淮北地区优质食味粳稻温光适应性和最佳播种期[J]. 中国农业科学, 2021, 54(7): 1365-1381.
[14]	蒋伟勤,胡群,俞航,马会珍,任高磊,马中涛,朱盈,魏海燕,张洪程,刘国栋,胡雅杰,郭保卫. 优质食味粳稻控混肥一次性基施效应[J]. 中国农业科学, 2021, 54(7): 1382-1396.
[15]	刘秋员,周磊,田晋钰,程爽,陶钰,邢志鹏,刘国栋,魏海燕,张洪程. 长江中下游地区常规中熟粳稻氮效率综合评价及高产氮高效品种筛选[J]. 中国农业科学, 2021, 54(7): 1397-1409.