起译密码子AUG侧翼序列对水稻基因表达水平的影响

中国农业科学 ›› 2004, Vol. 37 ›› Issue (05): 625-625 .

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起译密码子AUG侧翼序列对水稻基因表达水平的影响

刘庆坡，谭军，薛庆中

@刘庆坡$浙江大学农业与生物技术学院农学系!杭州310029杭州华大基因研发中心,杭州310007 @谭军$杭州华大基因研发中心!杭州310007 @薛庆中$浙江大学农业与生物技术学院农学系!杭州310029杭州华大基因研发中心,杭州310007

出版日期:2004-05-20 发布日期:2004-05-20

Online:2004-05-20 Published:2004-05-20

摘要/Abstract

摘要： 对541条水稻基因序列测定了其起译密码子AUG侧翼区序列(-20～+6)不同位点的同义密码子偏性及基因表达水平。结果表明,与密码子适应指数(CAI)和密码子偏好指数(CPP)、mRNA丰度呈显著或极显著相关的位点分别有5个(-19、-18、-9、-4和+5)、8个(-19、-18、-14、-9、-6、-4、-1和+5)和7个(-18、-16、-15、-9、-7、-1和+6),其中只有-4和+5位点与CAI和CPP的值正相关,表明上述位点在转录水平上处于有利进化的自然选择压。对高表达的变应原蛋白基因7个特殊位

关键词: 水稻, 起译密码子, 侧翼序列, 同义密码子偏性, 基因表达水平, 定点突变模拟

刘庆坡, 谭军, 薛庆中. 起译密码子AUG侧翼序列对水稻基因表达水平的影响[J]. 中国农业科学, 2004, 37(05): 625-625 .

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