中国农业科学 ›› 2024, Vol. 57 ›› Issue (17): 3440-3457.doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2024.17.010
翟彩娇(), 葛礼姣, 程玉静(
), 仇亮, 王小秋, 刘水东
收稿日期:
2024-01-25
接受日期:
2024-07-22
出版日期:
2024-09-01
发布日期:
2024-09-04
通信作者:
联系方式:
翟彩娇,Tel:15162769249;E-mail:szgszcj18@163.com。
基金资助:
ZHAI CaiJiao(), GE LiJiao, CHENG YuJing(
), QIU Liang, WANG XiaoQiu, LIU ShuiDong
Received:
2024-01-25
Accepted:
2024-07-22
Published:
2024-09-01
Online:
2024-09-04
摘要:
【目的】分析冬瓜、节瓜种质的遗传多样性,构建综合评价体系,筛选优异种质,为冬瓜、节瓜种质创新和新品种选育提供理论支撑。【方法】以148份不同来源的冬瓜、节瓜种质为供试材料,利用28个表型性状和19对SSR标记进行遗传多样性分析。综合运用变异系数、Shannon-Wiener多样性指数、相关性分析、主成分分析结合隶属函数法、逐步回归和聚类分析等多元统计方法,对冬瓜、节瓜种质进行遗传多样性分析和综合评价。【结果】148份冬瓜、节瓜种质具有较高的表型遗传多样性,11个质量性状的遗传多样指数变幅为0.39(性型)—1.45(瓜形状),17个数量性状的遗传多样性指数变幅为1.89(首雄花节位)—2.09(叶柄长度),变异系数变幅为9.76%(种形指数)—63.95%(老瓜单瓜重),其中首雌花节位(42.32%)、老瓜纵径(42.95%)、瓜形指数(47.05%)、首雄花节位(47.48%)、老瓜单瓜重(63.95%)的变异系数均大于40%,进行遗传改良的潜力较大;主成分分析将18个主要表型性状转换为6个独立的综合指标,贡献率为 6.427%—29.605%,累计贡献率为81.236%;结合隶属函数值计算表型综合值(F值)鉴选出新西洲冬瓜 BR12(1.47)、兴蔬粉地龙冬瓜 BR25(1.14)等综合性状表现较好的优异种质;18个主要表型性状中有15个性状与F值极显著相关。利用逐步回归分析建立表型评价数学模型,筛选出9个表型综合评价指标。19对SSR标记在供试材料中扩增出的等位位点数2—6个,多态性信息含量的变幅为0.02—0.70,Shannon’s多样性指数变幅为0.06—1.48,148份冬瓜、节瓜种质具有较为丰富的遗传多样性,且节瓜群体的遗传多样性相对略高于冬瓜群体,个体内的遗传变异是导致冬瓜、节瓜整体遗传多样性的主要原因;基于表型性状和SSR分子标记的聚类分析分别将148份冬瓜、节瓜种质资源划分为6大类和3大类,两种方法的聚类结果均没有将冬瓜和节瓜聚成两大类,且与地理位置来源没有明显的相关性。【结论】148份冬瓜、节瓜种质表型性状遗传变异较为丰富,遗传多样性高;叶片长度、首雌花节位、老瓜纵径、老瓜肉厚、瓜梗长度、种子宽度、瓜面蜡粉、瓜形状和种子类型可以作为冬瓜、节瓜种质资源综合评价和亲本选择的关键指标;基于主要表型性状和SSR分子标记的聚类分析结果具有一定的一致性,聚类和群体划分与地理位置来源没有明显的相关性。
翟彩娇, 葛礼姣, 程玉静, 仇亮, 王小秋, 刘水东. 基于表型性状与SSR标记的冬瓜、节瓜种质资源遗传多样性分析[J]. 中国农业科学, 2024, 57(17): 3440-3457.
ZHAI CaiJiao, GE LiJiao, CHENG YuJing, QIU Liang, WANG XiaoQiu, LIU ShuiDong. Genetic Diversity Analysis of Wax Gourd and Chieh-Qua Germplasm Resources Based on Phenotypic Traits and SSR Markers[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2024, 57(17): 3440-3457.
表1
冬瓜、节瓜种质资源质量性状描述分级"
性状 Trait | 分级 Classification | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | |
叶片形状 Leaf shape | 掌状 Palmate | 心脏形Cordate | 近圆形 Subround | 近三角形Subtriangular | |||||
叶片颜色Leaf color | 浅绿Light green | 绿Green | 深绿Dark green | ||||||
性型 Generotype | 纯雌株Gynoecious | 强雌株 Predominately gynoecious | 雌全株Gynomonoecious | 雌雄全株 Dimonoecious | 雌雄株Monoecious | 完全株Hermaphrodite line | 雄全株Androdioecy | 纯雄株Androecy | |
瓜面蜡粉 Wax powder | 无 Without | 少 Little | 中 Medium | 多 More | |||||
老瓜皮色 Fruit basal color | 银灰 Silvery grey | 浅绿 Light green | 绿 Green | 深绿 Dark green | 墨绿 Blackish green | ||||
棱沟 Furrow depth | 无 Without | 浅 Shallow | 中 Medium | 深 Deep | |||||
瓜形状 Fruit shape | 扁球形 Depressed-globose | 球形 Globose | 短圆筒 Short cylindrical | 椭球形Spheroidicity | 梨形 Pyriform | 长圆筒 Long cylindrical | |||
瓜瓤类型 Melon flesh type | 散瓤 Loose flesh | 吊瓤 Lifting flesh | |||||||
近瓜蒂端瓜面形状 Shape of the fruit surface near the pedicel | 凹 Concave | 平 Flat | 圆 Circle | 尖 Sharp | |||||
瓜顶形状 Shape of the fruit surface near the top | 凹 Concave | 平 Flat | 圆 Circle | 尖 Sharp | |||||
种子类型 Seed type | 无棱光籽 Light seed without edge | 有棱扁籽Corded flat seed |
表2
数量性状原始数据分级处理"
等级 Grade | 计算公式 Computational formula | 分级标准 Grading standard |
---|---|---|
1 | x-2δ | <x-2δ |
2 | (x-2δ)+0.5δ | x-2δ—(x-2δ)+0.5δ |
3 | (x-2δ)+2×0.5δ | (x-2δ)+0.5δ—(x-2δ)+2×0.5δ |
4 | (x-2δ)+3×0.5δ | (x-2δ)+2×0.5δ—(x-2δ)+3×0.5δ |
5 | (x-2δ)+4×0.5δ | (x-2δ)+3×0.5δ—(x-2δ)+4×0.5δ |
6 | (x-2δ)+5×0.5δ | (x-2δ)+4×0.5δ—(x-2δ)+5×0.5δ |
7 | (x-2δ)+6×0.5δ | (x-2δ)+5×0.5δ—(x-2δ)+6×0.5δ |
8 | (x-2δ)+7×0.5δ | (x-2δ)+6×0.5δ—(x-2δ)+7×0.5δ |
9 | (x-2δ)+8×0.5δ | (x-2δ)+7×0.5δ—(x-2δ)+8×0.5δ |
10 | x+2δ | >x+2δ |
表3
148份冬瓜、节瓜种质资源质量性状频率分布及多样性"
性状 Trait | 频率Frequency | 遗传多样性指数 Genetic diversity index (H′) | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | ||
叶片形状 Leaf shape | 0.56 | 0.34 | 0.10 | 0.92 | ||||||
叶片颜色 Leaf color | 0.28 | 0.47 | 0.25 | 1.06 | ||||||
性型 Generotype | 0.02 | 0.03 | 0.92 | 0.03 | 0.01 | 0.39 | ||||
瓜面蜡粉 Wax powder | 0.39 | 0.15 | 0.27 | 0.19 | 1.32 | |||||
老瓜皮色 Fruit basal color | 0.01 | 0.51 | 0.32 | 0.05 | 0.10 | 1.15 | ||||
棱沟 Furrow depth | 0.18 | 0.61 | 0.14 | 0.07 | 1.08 | |||||
瓜形状 Fruit shape | 0.03 | 0.05 | 0.46 | 0.10 | 0.11 | 0.24 | 1.45 | |||
瓜瓤类型 Melon flesh type | 0.50 | 0.50 | 0.69 | |||||||
近瓜蒂端瓜面形状 Shape of the fruit surface near the pedicel | 0.39 | 0.26 | 0.32 | 0.03 | 1.18 | |||||
瓜顶形状 Shape of the fruit surface near the top | 0.26 | 0.16 | 0.36 | 0.21 | 1.34 | |||||
种子类型 Seed type | 0.24 | 0.76 | 0.55 |
表4
148份冬瓜、节瓜种质资源数量性状变异统计分析"
性状 Trait | 最大值 Maximum | 最小值 Minimum | 平均值 Mean | 标准差 Standard deviation | 变异系数 Coefficient of variation (CV, %) | 遗传多样性指数 Genetic diversity index (H′) |
---|---|---|---|---|---|---|
老瓜单瓜重Weight per fruit (kg) | 31.52 | 1.05 | 8.02 | 5.13 | 63.95 | 1.92 |
叶片长度 Leaf length (cm) | 42.83 | 21.65 | 33.35 | 4.39 | 13.17 | 2.06 |
叶片宽度 Leaf width (cm) | 46.07 | 20.70 | 33.94 | 4.56 | 13.43 | 2.03 |
叶柄长度 Petiole length (cm) | 25.43 | 9.87 | 17.10 | 3.24 | 18.94 | 2.09 |
首雄花节位 First male flower node | 25.33 | 3.75 | 10.05 | 4.77 | 47.48 | 1.89 |
首雌花节位 First female flower node | 39.00 | 5.00 | 14.42 | 6.10 | 42.32 | 1.96 |
老瓜纵径 Fruit length (cm) | 109.67 | 14.33 | 43.37 | 18.62 | 42.95 | 1.93 |
老瓜横径 Fruit diameter (cm) | 34.58 | 9.60 | 19.95 | 6.22 | 31.19 | 2.06 |
老瓜肉厚 Fruit thick (mm) | 64.00 | 18.94 | 40.41 | 8.43 | 20.86 | 2.02 |
瓜形指数 Fruit shape index | 7.18 | 0.66 | 2.34 | 1.10 | 47.05 | 1.94 |
瓜梗长度 Pedicle length (cm) | 12.00 | 2.73 | 6.08 | 1.87 | 30.80 | 2.00 |
可溶性固形物含量 Soluble solid content (%) | 4.23 | 1.73 | 2.85 | 0.53 | 18.46 | 2.07 |
种子厚度 Seed thickness (mm) | 4.09 | 1.54 | 2.59 | 0.47 | 17.98 | 2.05 |
种子长度 Seed length (mm) | 14.46 | 7.11 | 11.18 | 1.76 | 15.76 | 1.98 |
种子宽度 Seed width (mm) | 9.74 | 4.31 | 6.91 | 1.31 | 18.93 | 1.99 |
种形指数 Seed shape index | 2.14 | 1.23 | 1.64 | 0.16 | 9.76 | 2.05 |
种子千粒重Seed-1000-kernel weight (g) | 10.10 | 1.68 | 5.33 | 1.94 | 36.46 | 1.95 |
表5
冬瓜、节瓜种质资源主要表型性状的主成分分析"
性状 Trait | 主成分 Principal component | |||||
---|---|---|---|---|---|---|
Ⅰ | Ⅱ | Ⅲ | Ⅳ | Ⅴ | Ⅵ | |
老瓜单瓜重 Weight per fruit | 0.847 | -0.109 | 0.179 | -0.105 | 0.224 | 0.163 |
叶片长度 Leaf length | 0.641 | 0.447 | -0.001 | 0.404 | -0.207 | -0.253 |
叶片宽度 Leaf width | 0.656 | 0.419 | 0.057 | 0.382 | -0.225 | -0.295 |
叶柄长度 Petiole length | 0.503 | 0.372 | -0.144 | 0.294 | -0.535 | 0.084 |
首雌花节位 First female flower node | 0.344 | -0.185 | 0.389 | 0.163 | 0.612 | -0.140 |
老瓜纵径 Fruit length | 0.700 | 0.490 | -0.016 | -0.235 | 0.248 | 0.283 |
老瓜横径 Fruit diameter | 0.694 | -0.620 | 0.182 | 0.017 | -0.018 | 0.055 |
老瓜肉厚 Fruit thick | 0.655 | -0.183 | 0.468 | -0.042 | 0.135 | -0.190 |
瓜形指数 Fruit shape index | 0.142 | 0.865 | -0.103 | -0.130 | 0.226 | 0.263 |
瓜梗长度 Pedicle length | 0.440 | 0.290 | 0.166 | 0.266 | 0.313 | -0.084 |
种子长度 Seed length | 0.716 | -0.393 | -0.263 | -0.297 | -0.186 | 0.169 |
种子宽度 Seed width | 0.689 | -0.401 | -0.554 | -0.120 | 0.012 | -0.054 |
种形指数 Seed shape index | -0.179 | 0.113 | 0.646 | -0.249 | -0.318 | 0.377 |
种子千粒重 Seed-1000-kernel weight | 0.770 | -0.369 | -0.321 | -0.155 | -0.127 | 0.125 |
瓜面蜡粉 Wax powder | 0.000 | -0.337 | 0.090 | 0.653 | 0.005 | 0.507 |
老瓜皮色 Fruit basal color | 0.270 | 0.400 | 0.241 | -0.514 | -0.175 | -0.405 |
瓜形状 Fruit shape | 0.194 | 0.718 | -0.212 | -0.073 | 0.131 | 0.348 |
种子类型 Seed type | -0.251 | 0.085 | -0.715 | 0.073 | 0.329 | -0.161 |
特征值 Eigenvalue | 5.329 | 3.310 | 2.017 | 1.469 | 1.341 | 1.157 |
贡献率 Contribution rate (%) | 29.605 | 18.390 | 11.203 | 8.159 | 7.452 | 6.427 |
累计贡献率 Accumulated contribution rate (%) | 29.605 | 47.995 | 59.198 | 67.357 | 74.809 | 81.236 |
表6
冬瓜、节瓜种质资源的综合评价"
编号 Material code | 主成分因子分值 Principal component value | 综合得分 F value | 排名 Ranking | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
F1 | F2 | F3 | F4 | F5 | F6 | |||
BR12 | 3.05 | 0.48 | -0.02 | 1.36 | 0.51 | 0.91 | 1.47 | 1 |
BR25 | 1.63 | 0.84 | -0.65 | 1.35 | 2.21 | 1.43 | 1.14 | 2 |
BR44 | 1.34 | 2.24 | 1.65 | -1.26 | 0.02 | 0.51 | 1.14 | 2 |
BR91 | 0.88 | 1.82 | -0.01 | -1.11 | 2.50 | 2.56 | 1.05 | 3 |
BR24 | 1.40 | 2.02 | 1.38 | -1.16 | -0.80 | 0.06 | 0.97 | 4 |
BR17 | 1.94 | 1.62 | -0.33 | -0.66 | 0.40 | -1.37 | 0.89 | 5 |
BR90 | 1.49 | -0.38 | 1.37 | 1.25 | 1.86 | -1.26 | 0.84 | 6 |
BR38 | 1.07 | 2.02 | 0.08 | -0.17 | 1.34 | -1.55 | 0.84 | 6 |
BR16 | 0.93 | 1.83 | 1.42 | -0.87 | 0.11 | -0.44 | 0.84 | 6 |
BR26 | 1.47 | 1.72 | 0.10 | -0.72 | 0.30 | -0.86 | 0.83 | 7 |
BR34 | 1.38 | 1.63 | -0.44 | -0.18 | 0.92 | -0.76 | 0.82 | 8 |
BR19 | 1.32 | 1.30 | 1.61 | -1.26 | -0.33 | -0.30 | 0.82 | 8 |
BR29 | 1.09 | 1.65 | 0.73 | -0.12 | -0.42 | -0.70 | 0.76 | 9 |
BR89 | 1.53 | -0.41 | 1.41 | -0.13 | 1.96 | -1.46 | 0.71 | 10 |
表7
表型综合值(F值)与18个主要农艺性状的相关系数"
性状 Trait | WPF | LL | LW | PL | FFN | FL | FDM | FT | FSI | PDL | SL | SW | SSI | SKW | WP | FBC | FS | ST |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
WPF | 1 | |||||||||||||||||
LL | 0.38** | 1 | ||||||||||||||||
LW | 0.38** | 0.93** | 1 | |||||||||||||||
PL | 0.22** | 0.59** | 0.59** | 1 | ||||||||||||||
FFN | 0.37** | 0.13 | 0.17* | -0.18* | 1 | |||||||||||||
FL | 0.72** | 0.46** | 0.44** | 0.36** | 0.18* | 1 | ||||||||||||
FDM | 0.76** | 0.17* | 0.21* | 0.10 | 0.35** | 0.20* | 1 | |||||||||||
FT | 0.70** | 0.33** | 0.35** | 0.11 | 0.41** | 0.33** | 0.64** | 1 | ||||||||||
FSI | 0.10 | 0.33** | 0.27** | 0.26** | -0.06 | 0.73** | -0.46** | -0.13 | 1 | |||||||||
PDL | 0.30** | 0.35** | 0.39** | 0.25** | 0.33** | 0.38** | 0.08 | 0.28** | 0.26** | 1 | ||||||||
SL | 0.54** | 0.17* | 0.20* | 0.25** | 0.12 | 0.35** | 0.64** | 0.33** | -0.18* | 0.09 | 1 | |||||||
SW | 0.48** | 0.20* | 0.21** | 0.23** | 0.13 | 0.30** | 0.59** | 0.26** | -0.18* | 0.11 | 0.85** | 1 | ||||||
SSI | -0.07 | -0.13 | -0.11 | -0.06 | -0.05 | -0.03 | -0.09 | 0.02 | 0.03 | -0.06 | -0.03 | -0.54** | 1 | |||||
SKW | 0.57** | 0.27** | 0.27** | 0.30** | 0.13 | 0.38** | 0.66** | 0.34** | -0.14 | 0.17* | 0.89** | 0.86** | -0.22** | 1 | ||||
WP | 0.06 | -0.04 | -0.05 | 0.05 | 0.10 | -0.18* | 0.24** | -0.01 | -0.24** | 0.06 | 0 | 0.01 | 0 | 0.04 | 1 | |||
FBC | 0.16* | 0.23** | 0.28** | 0.16 | -0.03 | 0.33** | -0.07 | 0.25** | 0.26** | 0.19* | 0.1 | 0.01 | 0.13 | 0.03 | -0.45** | 1 | ||
FS | 0.11 | 0.30** | 0.27** | 0.31** | -0.10 | 0.54** | -0.30** | -0.08 | 0.70** | 0.19* | -0.03 | -0.04 | 0 | -0.02 | -0.14 | 0.17* | 1 | |
ST | -0.24** | -0.07 | -0.14 | -0.17* | -0.18* | -0.11 | -0.35** | -0.37** | 0.09 | -0.08 | -0.09 | 0.13 | -0.41** | -0.1 | -0.1 | -0.23** | 0.12 | 1 |
F值 | 0.69** | 0.70** | 0.70** | 0.49** | 0.42** | 0.81** | 0.30** | 0.53** | 0.55** | 0.62** | 0.21** | 0.14 | 0.05 | 0.28** | 0.09 | 0.26** | 0.49** | -0.31** |
表8
不同类群冬瓜、节瓜种质资源主要表型性状的均值分析"
性状 Trait | 类群Ⅰ Cluster Ⅰ | 类群Ⅱ Cluster Ⅱ | 类群Ⅲ Cluster Ⅲ | 类群Ⅳ Cluster Ⅳ | 类群Ⅴ Cluster Ⅴ | 类群Ⅵ Cluster Ⅵ |
---|---|---|---|---|---|---|
老瓜单瓜重 Weight per fruit (kg) | 12.01 | 8.55 | 5.95 | 10.95 | 10.66 | 2.68 |
叶片长度 Leaf length (cm) | 35.24 | 29.15 | 33.34 | 36.73 | 36.45 | 31.46 |
叶片宽度 Leaf width (cm) | 36.17 | 29.77 | 33.68 | 38.02 | 36.90 | 31.72 |
叶柄长度 Petiole length (cm) | 18.38 | 13.59 | 17.39 | 18.40 | 19.60 | 16.21 |
首雌花节位 First female flower node | 16.53 | 20.08 | 9.04 | 17.35 | 14.45 | 10.86 |
老瓜纵径 Fruit length (cm) | 42.49 | 35.04 | 39.28 | 63.97 | 63.70 | 31.61 |
老瓜横径 Fruit diameter (cm) | 27.43 | 23.17 | 19.30 | 19.03 | 19.90 | 12.03 |
老瓜肉厚 Fruit thick (mm) | 45.51 | 42.99 | 36.22 | 47.80 | 42.38 | 32.79 |
瓜形指数 Fruit shape index | 1.56 | 1.48 | 2.17 | 3.42 | 3.29 | 2.72 |
瓜梗长度 Pedicle length (cm) | 6.21 | 5.76 | 4.72 | 7.17 | 7.81 | 5.52 |
种子长度 Seed length (mm) | 12.18 | 11.64 | 11.97 | 11.25 | 12.48 | 8.63 |
种子宽度 Seed width (mm) | 7.74 | 7.02 | 7.52 | 6.35 | 8.05 | 5.18 |
种形指数 Seed shape index | 1.59 | 1.67 | 1.59 | 1.78 | 1.55 | 1.67 |
种子千粒重 Seed-1000-kernel weight (g) | 7.01 | 5.38 | 5.77 | 5.27 | 6.83 | 2.62 |
表9
19对SSR 标记在148份材料中的遗传多样性参数"
引物 Primer name | 引物序列 Primer sequence (5′-3′) | 等位基因数 Number of alleles (Na) | 有效等位基因数 Number of effective alleles (Ne) | Shannon’s多样性指数 Shannon’s diversity index (I) | Nei’s多样性指数 Nei’s diversity index (H) | 多态性信息含量 Polymorphism information content (PIC) |
---|---|---|---|---|---|---|
1c096 | F: GACACTACCTTGCGCAGTGA R: TGCTACAACGGCAAATTCCA | 3 | 2.92 | 1.08 | 0.66 | 0.58 |
1c189 | F:GAGAAAAGTTTGACATATCCACTCT R: GAGTGTAGCTCAACTGGCGT | 6 | 3.65 | 1.48 | 0.73 | 0.68 |
2c053 | F: CCCGCCACTCAATCTTCCTT R: AGTGGATGATGAGGTATGCGA | 2 | 1.19 | 0.30 | 0.16 | 0.15 |
3c190 | F: TTTGCTCGACTGACTCCGAC R: ACGAGACACAATGCAGGGAG | 4 | 2.79 | 1.14 | 0.64 | 0.57 |
4c020 | F: ACCTCTGTTCAGGGTAAAGCA R:AGTGACACACTTAAATGGTGAAACC | 5 | 3.95 | 1.47 | 0.75 | 0.70 |
4c071 | F: CGCAACTTGCAACCTACTCG R: ACACTTTTGTTGTCATCCCACCT | 2 | 1.21 | 0.32 | 0.18 | 0.16 |
5c190 | F: TGAACGGTCGTTAACTGCGT R: AGACTCAAACTACTCGGACAAA | 2 | 2.00 | 0.69 | 0.50 | 0.37 |
8c050 | F: GATGCGAGCCTTCTTCAAACA R: AGTACGTATTGTTGCACTTACACT | 3 | 2.20 | 0.86 | 0.55 | 0.44 |
8c070 | F: CTGGAACGCATCTCTCTGCT R: TCCAGTGTCTCTTCATCCGA | 2 | 2.00 | 0.69 | 0.50 | 0.37 |
8c186 | F: CCCGCCAATTCGAACCATTC R: TACCAACCAGGGCAAAACGT | 6 | 1.41 | 0.53 | 0.29 | 0.26 |
9c051 | F: AAAACGAGAAACTGCAGCCG R: TCCTCCTCTTCTCCTCTGCC | 2 | 1.02 | 0.06 | 0.02 | 0.02 |
9c071 | F: ACCCATTTTGTCCTACCATGTGT R: CGTCTTCGTCAAATTGGGACT | 3 | 2.43 | 0.96 | 0.59 | 0.50 |
9c255 | F: CCTTTCTTCCATAAGTCGAGGGT R: AGGTTTGCTCCAACCAAAAAGA | 2 | 1.43 | 0.48 | 0.30 | 0.26 |
10c006 | F: CGATGCGTGCGCCTAAAATT R: ACACGAGAAATTGGCAAACAACT | 4 | 2.63 | 1.08 | 0.62 | 0.54 |
10c148 | F: AAGCGTACCTTCACAGAGCC R: TCCCCAAATGCCCTAACGTC | 3 | 2.34 | 0.92 | 0.57 | 0.48 |
11c160 | F: GCCCACACTCACCTTACACA R: AGCCCCACCGAATTAATGCT | 3 | 2.52 | 0.99 | 0.60 | 0.52 |
11c204 | F: AGAAGCTTGTGGAAAAGTCAACT R: CGAAGTAGCCCAATCAAAGTGT | 2 | 1.28 | 0.38 | 0.22 | 0.19 |
11c239 | F: AGACTCCTAGAACACACACACC R: ACCCCTTCAAATCCAAACTCA | 3 | 1.09 | 0.20 | 0.08 | 0.08 |
12c147 | F: ACAAATCCCCACAAGACGGG R: TGCGTTTTACTTGCCTATGTGA | 3 | 2.57 | 1.00 | 0.61 | 0.53 |
均值Mean | 3.16 | 2.14 | 0.77 | 0.45 | 0.39 |
表10
冬瓜、节瓜群体的遗传多样性分析"
群体 Population | 群体大小 Sample size | 等位基因数 Number of alleles (Na) | 有效等位基因数 Number of effective alleles (Ne) | Shannon’s多样性指数 Shannon’s diversity index (I) | Nei’s多样性指数 Nei’s diversity index (H) | 多态性信息含量 Polymorphism information content (PIC) |
---|---|---|---|---|---|---|
冬瓜Wax gourd | 121 | 3.16 | 2.09 | 0.77 | 0.44 | 0.38 |
节瓜Chieh-qua | 27 | 2.79 | 2.27 | 0.78 | 0.47 | 0.40 |
表11
基于SSR 标记的冬瓜、节瓜群体的分子方差分析(AMOVA)和基因分化"
变异来源 Source | 自由度 DF | 平方和 SS | 均方差 MSE | 方差分量 Variance component | 方差分量百分率 Total variance (%) | 基因流 (Nm) |
---|---|---|---|---|---|---|
群体间Among population | 1 | 12.887 | 12.887 | 0.108 | 2 | — |
群体内In population | 161 | 467.244 | 2.902 | 0 | 0 | — |
个体内In individual | 163 | 896.5 | 5.5 | 5.5 | 98 | — |
总体Total | 325 | 1376.632 | 5.608 | 100 | — | |
平均Mean | — | — | — | — | — | 22.014 |
[1] |
周胜军, 陈新娟, 朱育强, 陈丽萍, 张鹏. 我国冬瓜和节瓜种质资源的研究现状及建议. 植物遗传资源学报, 2014, 15(1): 211-214.
|
|
|
[2] |
乔燕春, 林锦英, 谢伟平, 谢丽芳, 李莲芳. 节瓜、冬瓜重要性状多样性及亲缘关系的SRAP分析. 植物遗传资源学报, 2014, 15(5): 1150-1155.
doi: 10.13430/j.cnki.jpgr.2014.05.034 |
|
|
[3] |
|
[4] |
万正林, 武鹏, 周艳霞, 邓俭英, 李立志, 龙明华. 同源四倍体及起源二倍体黑皮冬瓜营养品质与耐贮性比较. 江苏农业科学, 2019, 47(8): 209-212.
|
|
|
[5] |
谢大森, 江彪, 刘文睿, 薛舒丹, 张白鸽. 优质、抗病冬瓜多样化育种研究进展. 广东农业科学, 2020, 47(11): 50-59.
|
|
|
[6] |
孙远涛, 龙文靖, 李元, 刘天朋, 赵甘霖, 丁国祥, 倪先林. 45份糯高粱种质资源主要农艺性状和SSR标记的遗传多样性分析. 作物杂志, 2024(1): 57-64.
|
|
|
[7] |
叶新如, 刘建汀, 李永平, 朱海生, 温庆放. 基于EST-SSR标记的MCID法鉴定冬瓜种质资源. 核农学报, 2021, 35(4): 780-788.
doi: 10.11869/j.issn.100-8551.2021.04.0780 |
doi: 10.11869/j.issn.100-8551.2021.04.0780 |
|
[8] |
焦贤贤, 刘文睿, 江彪, 彭庆务, 刘政国, 谢大森. 基于SSR标记的冬瓜种质资源遗传多样性分析. 分子植物育种, 2019, 17(1): 161-168.
|
|
|
[9] |
向艳涛, 刘昌燕, 韩雪松, 李莉, 孙龙清, 陈宏伟, 沙爱华. 基于SSR标记的毛豆种质资源遗传多样性分析. 中国油料作物学报. https://doi.org/10.19802/j.issn.1007-9084.2023040.
|
|
|
[10] |
张一中, 张晓娟, 梁笃, 郭琦, 范昕琦, 聂萌恩, 王绘艳, 赵文博, 杜维俊, 柳青山. 基于表型性状的高粱育种材料遗传多样性分析及综合评价. 中国农业科学, 2023, 56(15): 2837-2853. doi:10.3864/j.issn.0578-1752.2023.15.001.
|
|
|
[11] |
任明刚, 李春红, 杨平, 何大智, 赵艳花, 范金华, 卢平, 唐兴发, 冯明友. 44份黑花生资源的表型遗传多样性及综合鉴评. 中国油料作物学报, 2024, 46(1): 51-61.
doi: 10.19802/j.issn.1007-9084.2022192 |
|
|
[12] |
李欢, 鄢小青, 杨占烈, 谭金玉, 黎小冰, 陈能刚, 吴荣菊, 陈惠查, 阮仁超. 贵州香禾糯地方稻种资源表型遗传多样性分析与综合评价. 中国农业科学, 2023, 56(11): 2035-2046. doi:10.3864/j.issn.0578-1752.2023.11.001.
|
|
|
[13] |
李赢, 刘海翠, 石晓旭, 石吕, 韩笑, 刘建, 魏亚凤. 398份裸大麦种质资源表型性状遗传多样性分析. 植物遗传资源学报, 2023, 24(5): 1311-1320.
doi: 10.13430/j.cnki.jpgr.20230301002 |
doi: 10.13430/j.cnki.jpgr.20230301002 |
|
[14] |
关峰, 石博, 万新建, 张景云, 黄长林, 张会国, 黄国东. 江西省地方冬瓜种质资源表型性状遗传多样性分析. 植物遗传资源学报, 2022, 23(2): 385-397.
doi: 10.13430/j.cnki.jpgr.20210830001 |
doi: 10.13430/j.cnki.jpgr.20210830001 |
|
[15] |
谢大森, 何晓明, 彭庆务. 冬瓜种质资源的综合鉴评. 中国蔬菜, 2009(8): 36-41.
|
|
|
[16] |
|
[17] |
李赢, 刘海翠, 石吕, 石晓旭, 韩笑, 刘建, 魏亚凤. 江苏裸大麦种质资源遗传多样性和群体结构分析. 作物学报, 2023, 49(10): 2687-2697.
|
doi: 10.3724/SP.J.1006.2023.31006 |
|
[18] |
张凯歌, 胡倩梅, 靳志恒, 杨会会, 杨路明, 胡建斌, 朱华玉. 219份甜瓜种质资源的遗传多样性分析. 河南农业大学学报, 2020, 54(2): 216-230.
|
|
|
[19] |
宋世威, 李珍, 刘厚诚, 孙光闻, 陈日远. 冬瓜和节瓜种质资源遗传多样性的RAPD分析. 中国蔬菜, 2010(22): 47-53.
|
|
|
[20] |
江彪, 刘文睿, 谢大森, 何晓明, 彭庆务. 冬瓜种质资源亲缘关系的ISSR分析. 热带作物学报, 2013, 34(4): 616-620.
|
|
|
[21] |
杜旋, 田守波, 张红梅, 刘娜. SCoT标记分析节瓜育种材料的遗传多样性. 分子植物育种. http://kns.cnki.net/kcms/detail/46.1068.S.20211110.1637.008.html.
|
|
|
[22] |
王鹏, 刘政国, 黄成秋, 陈勇, 覃海平. 节瓜自交系遗传多样性的ISSR分析. 植物遗传资源学报, 2015, 16(5): 1123-1127.
doi: 10.13430/j.cnki.jpgr.2015.05.028 |
doi: 10.13430/j.cnki.jpgr.2015.05.028 |
|
[23] |
|
[24] |
王长林, 沈镝. 冬瓜和节瓜种质资源描述规范和数据标准. 北京: 中国农业出版社, 2008.
|
|
|
[25] |
赵陆滟, 许俊强, 许彬, 胡安平, 张应华. 236份黄瓜种质资源农艺性状的遗传多样性分析及优质种质筛选. 南方农业学报, 2021, 52(1): 145-154.
|
|
|
[26] |
孙东雷, 卞能飞, 陈志德, 邢兴华, 徐泽俊, 齐玉军, 王幸, 王晓军, 王伟. 花生种质资源表型性状的综合评价及指标筛选. 植物遗传资源学报, 2018, 19(5): 865-874.
doi: 10.13430/j.cnki.jpgr.20180105001 |
|
|
[27] |
doi: 10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x pmid: 15969739 |
[28] |
赵芹, 谢大森, 何晓明, 陈仁芳, 彭庆务, 罗少波. 节瓜及近缘葫芦科作物种质资源rDNA-ITS序列分析与系统进化研究. 植物遗传资源学报, 2014, 15(5): 1096-1106.
|
|
|
[29] |
张晓煜, 王仕鹏, 曹昆山, 李旭婧, 叶晗, 李小玉, 汪奎, 方玉川, 刘柏林. 基于表型性状与SSR标记的马铃薯种质资源遗传多样性研究. 西北农业学报. http://kns.cnki.net/kcms/detail/61.1220.s.20230703.1314.002.html.
|
|
|
[30] |
牛雪婧, 王新栋, 王金萍, 孙娟, 郄彦敏, 王丽娜, 耿立格. 高粱地方种质资源表型多样性分析及综合评价. 植物遗传资源学报, 2024, 25(4): 922-935.
|
|
[1] | 郭磊, 黄晨艳, 宋宏峰, 沈志军, 张斌斌, 马瑞娟, 孙朦, 何鑫, 俞明亮. 桃苗圃适用除草剂的筛选、混配与安全性评价[J]. 中国农业科学, 2024, 57(9): 1734-1747. |
[2] | 吴玉珍, 黄龙雨, 周大云, 黄义文, 付守阳, 彭军, 匡猛. 中国棉花审定品种SSR指纹库的构建与综合评价[J]. 中国农业科学, 2024, 57(8): 1430-1443. |
[3] | 戎亚思, 李丰, 张鹏钰, 王东勇, 苏小雨, 田媛, 高桐梅. 基于主成分-聚类分析芝麻盛花期耐高温评价及品种筛选[J]. 中国农业科学, 2024, 57(20): 3957-3973. |
[4] | 王小军, 王金兰, 琚泽亮, 梁国玲, 贾志锋, 刘文辉, 马祥, 马金秀, 李文. 环青海湖地区不同饲用燕麦品种生产性能和营养品质综合评价[J]. 中国农业科学, 2024, 57(19): 3730-3742. |
[5] | 杨春, 杨代星, 李燕, 梁思慧, 邓小强, 乔大河, 陈娟, 郭燕, 林开勤, 陈正武. 贵州大树茶形态学特征及生化成分综合分析[J]. 中国农业科学, 2024, 57(19): 3894-3916. |
[6] | 周罕觅, 马林爽, 孙旗立, 陈佳庚, 李纪琛, 苏裕民, 陈诚, 吴奇. 基于多目标综合评价的苹果水氮综合调控[J]. 中国农业科学, 2024, 57(18): 3654-3670. |
[7] | 李玉姗, 肖菁, 马越, 田超, 赵连佳, 王帆, 宋羽, 蒋程瑶. 169份番茄种质资源表型性状遗传多样性分析及综合评价[J]. 中国农业科学, 2024, 57(18): 3671-3683. |
[8] | 雷梦林, 刘霞, 王艳珍, 崔国庆, 穆志新, 刘龙龙, 李欣, 逯腊虎, 李晓丽, 张晓军. 基于55K SNP芯片的山西冬小麦种质资源遗传多样性分析[J]. 中国农业科学, 2024, 57(10): 1845-1856. |
[9] | 宋想, 王钟曼, 张秋玲, 魏媛媛, 赵小刚, 刘波, 戴思兰. 早花露地小菊杂交后代株系的综合评价与筛选[J]. 中国农业科学, 2024, 57(1): 173-189. |
[10] | 侯赵玉, 龚亦钊, 钱祎, 程卓雅, 陶俊, 赵大球. 芍药耐热性评价及其鉴定指标筛选[J]. 中国农业科学, 2023, 56(23): 4742-4756. |
[11] | 米热扎提江·喀由木, 西尔艾力·吾麦尔江, 李晓曈, 王香茹, 贵会平, 张恒恒, 张西岭, 董强, 宋美珍. 棉花苗期耐低磷种质筛选及耐低磷综合评价[J]. 中国农业科学, 2023, 56(21): 4150-4162. |
[12] | 张一中, 张晓娟, 梁笃, 郭琦, 范昕琦, 聂萌恩, 王绘艳, 赵文博, 杜维俊, 柳青山. 基于表型性状的高粱育种材料遗传多样性分析及综合评价[J]. 中国农业科学, 2023, 56(15): 2837-2853. |
[13] | 李欢, 鄢小青, 杨占烈, 谭金玉, 黎小冰, 陈能刚, 吴荣菊, 陈惠查, 阮仁超. 贵州香禾糯地方稻种资源表型遗传多样性分析与综合评价[J]. 中国农业科学, 2023, 56(11): 2035-2046. |
[14] | 陈志敏, 陈晓林, 谭振华, 陈兆星, 谌丹丹, 马岩岩, 郑永强, 易时来, 吕强, 谢让金. 不同产区纽荷尔脐橙橘园果实综合品质评价与适宜区域筛选[J]. 中国农业科学, 2023, 56(10): 1949-1965. |
[15] | 王洋洋,刘万代,贺利,任德超,段剑钊,胡新,郭天财,王永华,冯伟. 基于多元统计分析的小麦低温冻害评价及水分效应差异研究[J]. 中国农业科学, 2022, 55(7): 1301-1318. |
|