中国农业科学 ›› 2010, Vol. 43 ›› Issue (11): 2292-2299 .doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.11.012
盛慧,秦智伟,周秀艳,武涛
Identification of Embryo Development-Related Genes in Cucumber Using SSH
SHENG Hui, QIN Zhi-wei, ZHOU Xiu-yan, WU Tao
摘要:
【目的】寻找黄瓜胚胎发育早期和胚胎发育晚期优势表达基因,研究其胚胎发育的分子机制。【方法】利用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization, SSH)技术构建胚胎发育早期和晚期差异表达cDNA文库。【结果】经反向Northern blot杂交检测,共得到97个阳性克隆。利用分子生物学软件对测序后的序列进行质量检测和聚类、拼接,共得到93个UniESTs,其中包括86个singletons和7个contigs。将上述EST序列在GenBank上进行BLAST比对,有83个EST片段找到了与之匹配的同源序列,有10个EST片段未找到同源序列,推测可能是新基因。【结论】其中很多EST与拟南芥、水稻或玉米蛋白质数据库中的热激蛋白具有很高的同源性。将以上序列应用GeneOntology进行功能分类,发现在胚胎发育早期细胞防御和代谢过程占主要位置;在胚胎发育晚期细胞防御和抗渗透胁迫功能是非常重要的。