中国农业科学 ›› 2008, Vol. 41 ›› Issue (8): 2241-2248 .doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.08.004

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IT-ISJ标记及其在陆地棉遗传图谱构建中的应用

  

  1. 西南大学农学与生物科技学院/农业部生物技术与作物品质改良重点实验室
  • 收稿日期:2007-05-18 修回日期:2007-07-07 出版日期:2008-08-10 发布日期:2008-08-10

  

  1. 西南大学农学与生物科技学院/农业部生物技术与作物品质改良重点实验室
  • Received:2007-05-18 Revised:2007-07-07 Online:2008-08-10 Published:2008-08-10
  • Contact: Zhengsheng Zhang

摘要: 【目的】开发可用于植物遗传多样性分析和遗传图谱构建的新型标记。【方法】根据植物结构基因内含子拼接位点的保守序列,设计扩增内含子的内含子-外显子拼接位点(intron targeted intron-exon splice junction,IT-ISJ)标记引物,并用于陆地棉遗传图谱构建。【结果】利用704个IT-ISJ引物组合,对陆地棉高品质品种渝棉1号和多显性基因标记系T586进行多态性筛选,获得49个多态性引物组合,占筛选引物的7.0%。49个多态性引物组合在(渝棉1号×T586)F2:7重组近交系群体270个系中检测到58个位点。以58个IT-ISJ、150个SSR和8个形态标记进行连锁分析,构建的遗传连锁图包括22个连锁群、113个位点(49个IT-ISJ、62个SSR和2个形态标记)。连锁图覆盖714.5 cM,占棉花基因组的16.1%,标记间平均长度为6.3 cM。【结论】IT-ISJ标记多态性高,可有效地用于陆地棉遗传连锁图谱的构建。

关键词: 内含子定靶的内含子-外显子拼接位点(IT-ISJ), 陆地棉, 遗传图谱