根瘤菌基因组内简单重复序列的分析

doi:10.3864/j.issn.0578-1752.2008.10.011

中国农业科学 ›› 2008, Vol. 41 ›› Issue (10): 2992-2998 .doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.10.011

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根瘤菌基因组内简单重复序列的分析

黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院

收稿日期:2007-09-16 修回日期:2007-11-20 出版日期:2008-10-10 发布日期:2008-10-10
通讯作者: 王伟东

黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院

Received:2007-09-16 Revised:2007-11-20 Online:2008-10-10 Published:2008-10-10

摘要/Abstract

摘要： 【目的】分析根瘤菌基因组中的简单重复序列（simple sequence repeats，SSRs），为其在根瘤菌遗传多样性研究中的应用提供有益的信息。【方法】利用公共的微生物串联重复序列数据库资源，对已测序的3种根瘤菌基因组中SSRs的结构类型、分布、丰度等进行系统的比较分析。【结果】大豆慢生根瘤菌（Bradyrhizobium japonicum）、百脉根根瘤菌（Mesorhizobium loti）和苜蓿中华根瘤菌（Sinorhizobium meliloti）基因组中的SSRs分别为1 410个、859个和638个，3种根瘤菌基因组中长重复的四、五、六核苷酸基序更为丰富，变异性更高。数目最少的为单碱基重复。【结论】3种根瘤菌的SSR在结构类型和分布规律上均具有一定的相似性。

. 根瘤菌基因组内简单重复序列的分析[J]. 中国农业科学, 2008, 41(10): 2992-2998 .

. [J]. Scientia Agricultura Sinica, 2008, 41(10): 2992-2998 .

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