口蹄疫病毒基因组的遗传变异剖析

doi:10.3864/j.issn.0578-1752.2008.09.035

中国农业科学 ›› 2008, Vol. ›› Issue (9): 2826-2834 .doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.09.035

口蹄疫病毒基因组的遗传变异剖析

中国农业科学院兰州兽医研究所/家畜疫病病原生物学国家重点实验室/农业部畜禽病毒学重点实验室/农业部草食动物疫病重点开放实验室

收稿日期:2007-06-26 修回日期:2007-10-04 出版日期:2008-09-01 发布日期:2008-09-01
通讯作者: 刘永生

中国农业科学院兰州兽医研究所/家畜疫病病原生物学国家重点实验室/农业部畜禽病毒学重点实验室/农业部草食动物疫病重点开放实验室

Received:2007-06-26 Revised:2007-10-04 Online:2008-09-01 Published:2008-09-01

摘要/Abstract

摘要：

【目的】明确口蹄疫病毒基因组的结构特征及其变异与结构、功能的关系以及系统发生关系。【方法】利用DNAstar和Clustalx程序进行184个口蹄疫病毒基因组序列的同源性分析、多重排比。【结果】口蹄疫病毒基因组ORF大小有所差异，范围为6 963～7 120 nt，编码2 320～2 339 aa的多聚蛋白。核苷酸和氨基酸序列的同源性，7个不同血清型间＞77.6%和＞78.3%，本研究发现了可能和生物学功能相关的新的保守和变异区域。【结论】口蹄疫病毒RNA的变异类型丰富和多样性程度较高，自然界存在的毒株可能大于血清学和测序发现的FMDV的毒株数目。

. 口蹄疫病毒基因组的遗传变异剖析[J]. 中国农业科学, 2008, (9): 2826-2834 .

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