中国农业科学 ›› 2024, Vol. 57 ›› Issue (2): 336-348.doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2024.02.009
收稿日期:
2023-06-16
接受日期:
2023-11-09
出版日期:
2024-01-16
发布日期:
2024-01-19
通信作者:
联系方式:
代瑛姿,E-mail:2388874188@qq.com
基金资助:
DAI YingZi(), GUO HongYang, YANG ZhiFeng, WANG XianPu(), XU LiLi()
Received:
2023-06-16
Accepted:
2023-11-09
Published:
2024-01-16
Online:
2024-01-19
摘要:
【目的】 对葡萄转录因子VvERF2进行蛋白质生物信息学分析,利用基因克隆、同源遗传转化技术,探索该转录因子在葡萄愈伤组织盐胁迫下的功能,为进一步研究AP2/ERF超家族对葡萄的作用机理提供参考。【方法】 借助NCBI-Blast(
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表2
8种植物ERF2蛋白质理化性质分析"
物种 Species | ID号 ID number | 氨基酸残基数 Number of amino acid residue | 分子量 Molecular weight (kDa) | 理论等电点 Theoretical isoelectric point | 不稳定系数 Instability index (%) | 脂肪指数Aliphatic index | 平均亲水性 Average hydrophilicity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
葡萄 Vitis vinifera | XP_002279585.2 | 240 | 26.43 | 6.94 | 62.32 | 68.67 | -0.555 |
苹果 Malus domestica | XP_008352414 | 276 | 29.62 | 8.45 | 57.23 | 70.98 | -0.457 |
草莓 Fragaria ananassa | AZL19475 | 295 | 31.60 | 6.76 | 56.57 | 71.80 | -0.363 |
中国白梨 Pyrus bretschneideri | XP_009369170.2 | 269 | 28.82 | 8.47 | 52.47 | 68.85 | -0.455 |
桃 Prunus persica | XP_007209449 | 281 | 30.16 | 9.09 | 59.26 | 76.65 | -0.411 |
无花果 Ficus carica | QID57935.1 | 348 | 38.60 | 5.54 | 55.88 | 66.75 | -0.570 |
拟南芥 Arabidopsis thaliana | AB008103.1 | 266 | 28.97 | 8.68 | 56.72 | 67.86 | -0.499 |
番茄 Solanum lycopersicum | NP_001316388.2 | 242 | 26.76 | 7.68 | 71.59 | 69.34 | -0.433 |
表3
VvERF2启动子顺式作用元件预测"
元件 Motifs | ABRE | ARE | MYB | MYC | Box4 | CGTCA-motif | MRE |
---|---|---|---|---|---|---|---|
数量 Quantity | 2 | 2 | 4 | 6 | 7 | 4 | 2 |
功能 Function | 参与脱落酸信号响应 Participate in abscisic acid signal response | 厌氧诱导调控元件 Anaerobic induction regulatory element | 参与光信号响应 Participate in optical signal response | 茉莉酸甲酯响应 信号调控元件 Methyl jasmonate responsive signal regulatory element | 参与光信号响应的MYB结合位点 MYB binding sites involved in optical signal response |
表4
葡萄愈伤组织生长量、总糖、总酸、总酚含量及抗氧化水平测定"
愈伤组织 Callus | 生长量 Growth (g·dish-1 FW) | 总糖 Total sugar (mg·g-1 FW) | 总酸 Total acid (mg·g-1 FW) | 总酚 Total phenol (mg·g-1 FW) | DPPH抗氧化活性 DPPH antioxidant activity (mg·g-1 FW) | FRAP抗氧化活性 FRAP antioxidant activity (mg·g-1 FW) | ABTS抗氧化活性 ABTS antioxidant activity (mg·g-1 FW) |
---|---|---|---|---|---|---|---|
wt | 0.33±0.017 | 26.04±1.02 | 0.14±0.0088 | 0.13±0.0012 | 0.86±0.010 | 1.60±0.45 | 1.38±0.32 |
erf2-1 | 0.41±0.065* | 27.48±1.98 | 0.11±0.0069** | 0.17±0.0032** | 1.22±0.012* | 2.88±0.27* | 1.75±0.12* |
erf2-2 | 0.40±0.027* | 26.99±1.34 | 0.08±0.0060* | 0.18±0.0021* | 1.33±0.021* | 3.51±0.073** | 2.38±0.23* |
erf2-3 | 0.39±0.051* | 28.02±2.18 | 0.10±0.0021* | 0.18±0.0032** | 1.40±0.030* | 3.51±0.10** | 2.45±0.10* |
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