中国农业科学 ›› 2008, Vol. ›› Issue (12): 4257-4263 .doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.12.042

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cDNA-AFLP法筛选红树植物盐应答基因

陈银华,韩淑梅,沙爱华,朱红林,范吉星,谢 俊,符秀梅,李小靖

  

  1. 海南大学教育部热带生物资源重点实验室
  • 收稿日期:2007-10-10 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-12-20 发布日期:2008-12-20
  • 通讯作者:

  1. 海南大学教育部热带生物资源重点实验室
  • Received:2007-10-10 Revised:1900-01-01 Online:2008-12-20 Published:2008-12-20

摘要:

【目的】分析红树植物盐胁迫下基因表达谱,分离识别耐盐相关基因。【方法】分别对红树植物-秋茄进行海水和淡水处理。分时提取总RNA进行等量混合,获得两种不同处理的样品池。采用cDNA-AFLP技术进行表达差异分析。【结果】256对引物组合共筛选了约15 000个cDNA片段,获得差异片段61个。差异基因表达模式分为2类,即海水处理诱导上升和下调表达,其中上升表达的基因片段为36个,下调表达的基因片段为25个;其中38个可视为已知基因。按照其功能分类可分为8大类:基础代谢、跨膜蛋白、信号转导、蛋白质代谢、转录因子、细胞骨架、抗病蛋白、假想蛋白,而其中又以基础代谢相关基因所占比重最大。【结论】构建了红树植物-秋茄在盐胁迫下的基因表达谱,从基因组水平上识别了一批受盐胁迫诱导或抑制表达、与耐盐相关的基因,这些新基因可用于耐盐的分子机理研究。

关键词: 红树, 耐盐性, 基因分离, cDNA-AFLP