粗糙脉孢菌基因组中的微卫星序列的组成和分布

doi:10.3864/j.issn.0578-1752.040612

中国农业科学 ›› 2004, Vol. 37 ›› Issue (06): 851-851 .doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.040612

粗糙脉孢菌基因组中的微卫星序列的组成和分布

李成云，李进斌，周晓罡，张绍松，许明辉

@李成云$云南省农业科学院生物技术研究所/农业部南方高原农业生物技术重点实验室!昆明650223 @李进斌$云南省农业科学院植物保护研究所!昆明650205 @周晓罡$云南省农业科学院生物技术研究所/农业部南方高原农业生物技术重点实验室!昆明650223 @张绍松$云南省农业科学院生物技术研究所/农业部南方高原农业生物技术重点实验室!昆明650223 @许明辉$云南省农业科学院生物技术研究所/农业部南方高原农业生物技术重点实验室!昆明650223

出版日期:2004-06-20 发布日期:2004-06-20

Published:2004-06-20 Online:2004-06-20

摘要/Abstract

摘要： 利用已经公布的粗糙脉孢菌基因组测序结果,对该真菌基因组中的微卫星(SSR)序列进行了系统分析。结果表明,在已经公布的38.0　Mb 的基因组序列中,共有14 788 个以1～6个核苷酸为基序的 SSR序列(长度大于15　bp,匹配值大于80%),其碱基总数占整个基因组碱基数的 0.95%,平均2.57　kb 就分布有一个大于15　bp的SSR。其中数量最多的三碱基 SSR,数量达到 4 729个,其次为六碱基 SSR　(2 940个)和单碱基 SSR(2 489 个),这3 类SSR 总数达10 158 个

关键词: 粗糙脉孢菌, 基因组, 微卫星序列, 频率, 分布, 遗传标记

李成云, 李进斌, 周晓罡, 张绍松, 许明辉. 粗糙脉孢菌基因组中的微卫星序列的组成和分布[J]. 中国农业科学, 2004, 37(06): 851-851 .

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