小麦条锈菌,即条形柄锈菌小麦转化型(Puccinia striiformis West. f. sp. tritici Erikss. & Henn.),是危害小麦及部分禾本科作物的重要真菌。小麦条锈菌的夏孢子可以依靠气流远距离传播,使病原菌可以跨区传播扩散。早期研究通过小麦条锈病的田间发生时序,推测小麦条锈菌可能在陕西关中地区由西向东传播,且陕西关中地区菌源可能来自邻近省份甘肃省,但是一直没有直接证据证实这一推测。
本研究于2019-2020年和2020-2021年冬小麦种植季节在陕西关中地区(宝鸡、咸阳、西安、渭南)和甘肃省陇南、天水、平凉、庆阳四个地区共采集321株小麦条锈菌样品,使用23对KASP-SNP引物对获得的条锈菌样品进行基因分型。联合多种群体遗传方法分析了亚群体之间的关系,从DNA水平明确了2019年 ~ 2021年陕西省内关中地区小麦条锈菌的传播路径,以及小麦条锈菌自甘肃省向陕西省传播的主要路径,取得主要结果如下:
1. 证实陕西关中与甘肃条锈菌的迁移方向主要是从甘肃传向陕西关中地区,但两地间的条锈菌群体也存在一定程度的基因交流。
2. 表明陕西省关中地区条锈菌的迁移方向是由西(宝鸡)向东(渭南)扩散。陕西关中地区的四个亚群体(宝鸡、咸阳、西安、渭南)之间基因交流频繁(5.559 ≤ Nm ≤ 29.148),遗传分化程度低(0.009 ≤ Fst ≤ 0.043)。
3. 表明2019年至2021年陕西关中地区小麦条锈菌的菌源来源主要来自甘肃省陇南天水地区,平凉和庆阳地区作为次要菌源提供地。迁移网络图与风场分析支持病原菌传播路径。
4. 连锁不平衡分析表明陕西省宝鸡、咸阳地区和甘肃省陇南、天水、平凉、庆阳地区均存在较强的遗传重组信号,可能导致当地小麦条锈菌群体的遗传多样性水平升高。
综上所述,甘肃省天水和陇南地区是陕西关中地区的小麦条锈菌菌源地,为其条锈病发生提供菌源,陕西省关中地区小麦条锈菌自西向东的传播路线,即宝鸡→咸阳→西安→渭南。这一研究为陕西关中地区小麦条锈菌传播路径提供了直接分子证据,进而为阻断条锈菌在甘肃和陕西之间的传播,以及为中国小麦条锈病发生与防控提供了重要的理论依据。