





中国农业科学 ›› 2023, Vol. 56 ›› Issue (20): 4125-4136.doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2023.20.016
• 畜牧·兽医 • 上一篇
苏佳(
), 赵炜, 刘丹, 王嘉, 白洪旭, 吴华伟, 薛青红, 陈晓春(
)
收稿日期:2022-11-11
接受日期:2023-04-04
出版日期:2023-10-16
发布日期:2023-10-31
通信作者:
联系方式:
苏佳,E-mail:hnzk912@163.com。
基金资助:
SU Jia(
), ZHAO Wei, LIU Dan, WANG Jia, BAI HongXu, WU HuaWei, XUE QingHong, CHEN XiaoChun(
)
Received:2022-11-11
Accepted:2023-04-04
Published:2023-10-16
Online:2023-10-31
摘要:
【目的】为解决现有兽用生物制品外源性马立克氏病病毒(Marek’s disease virus, MDV)检验方法灵敏度低、检测时间长、鉴别性不强的问题,研究分别建立MDV血清1型(MDV serotype 1,MDV 1)和MDV血清3型(MDV serotype 3,MDV 3)毒株的实时荧光定量PCR检测方法,用于禽用生物制品纯净性控制。【方法】从NCBI下载MDV 1、MDV血清2型(MDV serotype 1,MDV 2)和MDV 3各毒株UL19序列,进行核苷酸和氨基酸序列比对分析;分别针对MDV 1 CVI988毒株、MDV 3 FC126毒株的UL19设计特异性引物和相应的Taqman探针,建立实时荧光定量PCR检测方法;分别构建相应的重组质粒作为阳性标准品,建立标准曲线,并评价所建立方法基因拷贝数检测的灵敏度;分别对其他禽用病毒类生物制品、毒种、MDV 2 SB-1毒株UL19的全长质粒及生产原材料(SPF鸡胚尿囊液、胚体、尿囊膜、鸡胚成纤维细胞)进行检测,评价检测方法的特异性;分别对600、60、6、0.6、0.06、0.006、0.0006 PFU的CVI988毒株和FC126毒株进行检测,评价所建立方法检测活病毒粒子的灵敏度;分别以不同稀释度的阳性标准品质粒为模板,进行3次重复性检测,计算变异系数,分析所建立检测方法的可重复性。【结果】MDV UL19在同一血清型内核苷酸和推导的氨基酸同源性达99.99%,具有很高的保守性,在不同血清型间核苷酸同源性只有约75%,推导的氨基酸同源性只有约85%;分别建立了MDV 1和MDV 3两种实时荧光定量PCR检测方法;MDV 1检测方法标准曲线的扩增效率E=98.8%,相关系数R 2=0.992,标准曲线方程Y=-3.351X+38.828(Y=Ct,X=lg(拷贝数)),MDV 3检测方法标准曲线的扩增效率E=95.0%,相关系数R 2=0.998,标准曲线方程Y=-3.447X+36.496(Y=Ct,X=lg(拷贝数));所建立的两种检测方法特异性好,MDV 1或MDV 3毒株扩增曲线良好,其他禽用病毒类生物制品、毒种、MDV 2 SB-1毒株UL19的全长质粒及生产原材料未出现特异性扩增曲线;灵敏度高,MDV 1基因拷贝数检出限度为32.8拷贝/μL,至少可检出0.006 PFU的CVI988毒株,MDV 3基因拷贝数检出限度为10 拷贝/μL,至少可检出0.006 PFU的FC126毒株;重复性好,MDV 1检测方法重复性试验的变异系数小于1%,MDV 3检测方法重复性试验的变异系数小于1.5%。【结论】所建立的实时荧光定量PCR检测方法可分别用于禽用生物制品中外源性MDV1、MDV3毒株的检测。
苏佳, 赵炜, 刘丹, 王嘉, 白洪旭, 吴华伟, 薛青红, 陈晓春. 外源性马立克氏病病毒荧光定量PCR检测方法的建立[J]. 中国农业科学, 2023, 56(20): 4125-4136.
SU Jia, ZHAO Wei, LIU Dan, WANG Jia, BAI HongXu, WU HuaWei, XUE QingHong, CHEN XiaoChun. Establishment of Real-Time PCR Method for Detection of Extraneous Marek’s Disease Virus[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2023, 56(20): 4125-4136.
表1
样品信息"
| 样品类型 Sample type | 名称 Name | 来源 Source |
|---|---|---|
| 尿囊液生产毒 Viruses produced in allantoic fluid | 鸡新城疫活疫苗 Newcastle Disease Vaccine, Live | 某生产厂家A Manufacturer A |
| 鸡传染性支气管炎活疫苗 Avian Infectious Bronchitis Vaccine, Live | 某生产厂家C Manufacturer C | |
| 禽流感病毒 Avian Influenza Virus | 某生产厂家D Manufacturer D | |
| 细胞生产毒 Viruses produced in cells | 鸡传染性法氏囊病活疫苗 Infectious Bursal Disease Vaccine, Live | 某生产厂家B Manufacturer B |
| 鸡痘活疫苗 Avian Pox Vaccine, Live | 某生产厂家B Manufacturer B | |
| 禽呼肠孤病毒 Avian Reovirus | 中国兽医药品监察所实验室 Laboratory of China Institute of Veterinary Drug Control | |
| 禽脑脊髓炎病毒 Avian Encephalomyelitis Virus | 中国兽医药品监察所实验室 Laboratory of China Institute of Veterinary Drug Control | |
| 禽腺病毒(I、III群) Avian Adenovirus(Group I、III) | 中国兽医药品监察所实验室 Laboratory of China Institute of Veterinary Drug Control | |
| 禽白血病病毒 Avian Leukosis Virus | 中国兽医药品监察所实验室 Laboratory of China Institute of Veterinary Drug Control | |
| 禽网内组织增生症病毒 Avian Reticuloendotheliosis Virus | 中国兽医药品监察所实验室 Laboratory of China Institute of Veterinary Drug Control | |
| 组织(胚体/尿囊膜)生产毒 Viruses produced in tissues (embryonic body/allantoic membrane) | 鸭瘟活疫苗 Duck Plague Vaccine, Live | 某生产厂家F Manufacturer F |
| 鸡传染性喉气管炎活疫苗 Fowl Pox-Laryngotracheitis Vaccine, Live | 某生产厂家E Manufacturer E | |
| MDV 1毒株 MDV 1 strains | CVI988株 Strain CVI988 | 某生产厂家A Manufacturer A |
| 814株 Strain 814 | 某生产厂家G Manufacturer G | |
| SC 9-1株 Strain SC 9-1 | 某生产厂家H Manufacturer H | |
| Md5株 Strain Md5 | 中国兽医药品监察所实验室 Laboratory of China Institute of Veterinary Drug Control | |
| MDV 3毒株 MDV 3 strains | FC126株 Strain FC126 | 中国兽医药品监察所实验室 Laboratory of China Institute of Veterinary Drug Control |
表3
MDV 1实时荧光定量PCR重复性的检测"
| 浓度(拷贝/μL) Content (copies/μL) | Ct值 Ct value | 均值 X | 标准差 SD | 变异系数 CV (%) | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | ||||
| 3.28×107 | 14.41 | 14.16 | 14.33 | 14.30 | 0.13 | 0.91% |
| 3.28×106 | 16.23 | 16.22 | 16.25 | 16.23 | 0.01 | 0.09% |
| 3.28×105 | 19.66 | 19.48 | 19.69 | 19.61 | 0.11 | 0.57% |
| 3.28×104 | 24.17 | 24.14 | 24.16 | 24.16 | 0.01 | 0.05% |
| 3.28×103 | 27.83 | 27.76 | 27.91 | 27.83 | 0.07 | 0.27% |
| 3.28×102 | 30.96 | 31.11 | 31.09 | 31.05 | 0.08 | 0.27% |
| 3.28×101 | 32.69 | 32.84 | 32.96 | 32.83 | 0.13 | 0.41% |
表4
MDV 3实时荧光定量PCR重复性的检测"
| 浓度(拷贝/μL) Content (copies/μL) | Ct值 Ct value | 均值 X | 标准差 SD | 变异系数 CV (%) | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2 | 3 | ||||
| 1.00×108 | 12.50 | 12.18 | 12.20 | 12.29 | 0.18 | 1.48% |
| 1.00×107 | 15.86 | 15.60 | 15.63 | 15.70 | 0.14 | 0.90% |
| 1.00×106 | 19.27 | 19.12 | 19.08 | 19.16 | 0.10 | 0.50% |
| 1.00×105 | 23.10 | 23.14 | 23.12 | 23.12 | 0.02 | 0.08% |
| 1.00×104 | 26.84 | 26.18 | 26.51 | 26.51 | 0.33 | 1.25% |
| 1.00×103 | 30.88 | 30.41 | 30.31 | 30.53 | 0.30 | 0.99% |
| 1.00×102 | 33.42 | 33.26 | 33.03 | 33.23 | 0.20 | 0.59% |
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