中国农业科学 ›› 2004, Vol. 37 ›› Issue (03): 328-328 .

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用生物信息学技术构建cSSR分子标记开发体系

@汤继凤$中国农业科学院作物品种资源研究   

  1. @汤继凤$中国农业科学院作物品种资源研究所重点实验室!北京100081 @曹永生$中国农业科学院作物品种资源研究所重点实验室!北京100081 @高丽锋$中国农业科学院作物品种资源研究所重点实验室!北京100081 @贾继增$中国农业科学院作物品种资源研究所重点实验室!北京100081
  • 出版日期:2004-03-20 发布日期:2004-03-20

  1. @汤继凤$中国农业科学院作物品种资源研究所重点实验室!北京100081 @曹永生$中国农业科学院作物品种资源研究所重点实验室!北京100081 @高丽锋$中国农业科学院作物品种资源研究所重点实验室!北京100081 @贾继增$中国农业科学院作物品种资源研究所重点实验室!北京100081
  • Online:2004-03-20 Published:2004-03-20

摘要: 存在于基因编码区的简单重复序列(又称cSSR或者EST-SSR),既可用作分子标记又可用于基因功能研究。Internet上大量的EST数据为cSSR标记的开发提供了丰富的资源。生物信息学是cSSR分子标记开发的有力工具。笔者构建的cSSR分子标记开发体系包括自行编制的SSR标记发掘程序SSRFinder,生物学家常用的引物设计程序Primer3和DNAstar, 以及遗传定位程序MapMaker和图形显示程序JgeneMap。根据SSR分子标记发掘中存在的问题,提出了SSR分子标记发掘算法,并用此算法编写了

关键词: cSSR, EST-SSR, 精确cSSR, 复合型cSSR, 遗传图谱, 小麦

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