松杨栅锈菌两菌群RAPD特异序列的标记转换

doi:10.3864/j.issn.0578-1752.2009.01.045

中国农业科学 ›› 2009, Vol. 42 ›› Issue (1): 349-354 .doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.01.045

松杨栅锈菌两菌群RAPD特异序列的标记转换

西北农林科技大学林学院

收稿日期:2007-11-29 修回日期:2008-01-30 出版日期:2009-01-10 发布日期:2009-01-10

Specific RAPD-DNA Markers Transfer of Two Populations of Melampsora larici-populina

西北农林科技大学林学院

Received:2007-11-29 Revised:2008-01-30 Published:2009-01-10 Online:2009-01-10

摘要/Abstract

摘要：

【目的】根据RAPD分析结果，对松杨栅锈菌西部和北方两大地理相关菌群RAPD扩增特异性DNA片段进行SCAR标记转换。【方法】经pGEM-T载体克隆和测序、Seqman整合后，用Primerselct分别设计了两地理菌群的简并引物对（西部菌群简并引物对PNW0118-382-F:GAATCGGCCACAAAACTATC,PNW0118-382-R:GAATCGGCCATGACTTGAGC,北方菌群简并引物对PNW0118-400-F:GAATCGGCCACAAAACTATC，PNW0118-400-R:GAATCGGCCATGACTTGAGCTGC）。【结果】经PCR条件优化成功获得两大地理菌群的SCAR标记。西部菌群SCAR标记为382 bp，北方菌群的SCAR标记为400 bp。【结论】两对引物可用于松杨栅锈菌地理菌群的检测。

关键词: 松杨栅锈菌, DNA, SCAR标记

Abstract:

【Objective】 This paper focused on achieving sequence characterized amplified region (SCARs) of geographic populations of Melampsora larici-populina, and transferring them to codominant markers. 【Method】 Based on the results of RAPD study of Melampsora larici-populina, DNA fragments of Western and Northern populations were recycled, purified, pGEM-T vector cloned and sequenced. About 400bp length DNA fragments were achieved after being integrated by software Seqman, and two pairs of primers were designed by software Primerselect (Western population primers: PNW0118-382-F: GAATCGGCCACAAAACTATC, PNW0118-382-R: GAATCGGCC ATGACTTGAGC, and Northern population primers: PNW0118-400-F: GAATCGGCCACAAAA CTATC, PNW0118-400-R: GAATCGGCCATGACTTGAGCTGC).【Result】 With these primers, SCARs of Western population (382 bp) and Northern population (400 bp) were amplified successfully by optimized conditions of polymerase chain reactions. 【Conclusion】The two pairs of primer can be used to monitor the geographic groups of Melampsora larici-populina

Key words: Melampsora larici-populina, DNA , SCAR markers

. 松杨栅锈菌两菌群RAPD特异序列的标记转换[J]. 中国农业科学, 2009, 42(1): 349-354 .

Specific RAPD-DNA Markers Transfer of Two Populations of Melampsora larici-populina

[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2009, 42(1): 349-354 .

[1]	赵子杰, 宋豪, 董小鸥, 万建民. 转座元件系统介导的大片段DNA定向插入技术研究进展[J]. 中国农业科学, 2026, 59(6): 1141-1156.
[2]	李娅毓, 王新亮, 周金环, 李楚欣, 李佳欣, 田旭斌, 宋震. 柑橘鳞皮病毒基因组全长cDNA克隆构建及其侵染性鉴定[J]. 中国农业科学, 2025, 58(17): 3451-3460.
[3]	吴玉珍, 黄龙雨, 周大云, 黄义文, 付守阳, 彭军, 匡猛. 中国棉花审定品种SSR指纹库的构建与综合评价[J]. 中国农业科学, 2024, 57(8): 1430-1443.
[4]	赵真坚, 王凯, 陈栋, 申琦, 余杨, 崔晟頔, 王俊戈, 陈子旸, 禹世欣, 陈佳苗, 王翔枫, 唐国庆. 基因组和DNA甲基化组联合分析筛选猪肉质性状关键基因[J]. 中国农业科学, 2024, 57(7): 1394-1406.
[5]	高晨曦, 郝陆洋, 胡悦, 李永祥, 张登峰, 李春辉, 宋燕春, 石云素, 王天宇, 黎裕, 刘旭洋. 干旱条件下玉米转座子插入关联的表观调控分析[J]. 中国农业科学, 2024, 57(6): 1034-1048.
[6]	苏小雨, 谭政委, 李春明, 李磊, 鲁丹丹, 余永亮, 董薇, 安素妨, 杨青, 孙瑶, 许兰杰, 杨红旗, 梁慧珍. 高温胁迫下芝麻全基因组甲基化差异及关联基因表达分析[J]. 中国农业科学, 2024, 57(24): 4825-4838.
[7]	苏国钊, 李嫒嫒, 刘中华, 陈宇华, 张秀杰, 马莹雪, 杨旭红, 邓超, 徐振江. 苦瓜品种SSR分子标记鉴定技术体系构建与应用[J]. 中国农业科学, 2024, 57(11): 2227-2242.
[8]	李慧, 张雨峰, 李晓刚, 王中华, 蔺经, 常有宏. 全基因组DNA甲基化和转录组联合分析鉴定杜梨耐盐相关转录因子[J]. 中国农业科学, 2023, 56(7): 1377-1390.
[9]	杜炳辰, 王铭, 刘春国, 王世达, 魏新宇, 路雅曼, 孙振钊, 刘在斯, 魏丽丽, 王靖飞, 杨德成. 盖塔病毒SC483株cDNA感染性克隆的构建[J]. 中国农业科学, 2023, 56(17): 3479-3486.
[10]	薛亚鹏, 丁艺冰, 王宇卓, 王晓丹, 曹晓宁, SANTRA Dipak K, 陈凌, 乔治军, 王瑞云. 基于荧光SSR构建中国糜子核心种质DNA分子身份证[J]. 中国农业科学, 2023, 56(12): 2249-2261.
[11]	陈玉梅, 张聪聪, 胡丽蓉, 房浩, 窦金焕, 郭刚, 王炎, 刘巧香, 王雅春, 徐青. 热应激对奶牛GNAS启动子区DNA甲基化水平的影响[J]. 中国农业科学, 2023, 56(12): 2395-2406.
[12]	赵春芳,赵庆勇,吕远大,陈涛,姚姝,赵凌,周丽慧,梁文化,朱镇,王才林,张亚东. 半糯粳稻品种核心标记的筛选及DNA指纹图谱的构建[J]. 中国农业科学, 2022, 55(23): 4567-4582.
[13]	黄勋和,翁茁先,李威娜,王庆,何丹林,罗威,张细权,杜炳旺. 中国地方品种黄鸡线粒体DNA D-loop遗传多样性研究[J]. 中国农业科学, 2022, 55(22): 4526-4538.
[14]	马雪萌,余成敏,赛小玲,刘贞,桑海洋,崔百明. PSORA：一种基于高通量测序的T-DNA插入位点分析方法[J]. 中国农业科学, 2022, 55(15): 2875-2882.
[15]	李镇希,李文婷,黄家权,郑正,许美容,邓晓玲. 膜吸附法结合可视化环介导等温扩增技术检测柑橘黄龙病菌[J]. 中国农业科学, 2022, 55(1): 74-84.

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