甜菜幼苗低温和长日照诱导表达基因的克隆和序列分析

中国农业科学 ›› 2005, Vol. 38 ›› Issue (09): 1856-1862 .

甜菜幼苗低温和长日照诱导表达基因的克隆和序列分析

戴建军,常缨,张美萍,李彩凤,马凤鸣

收稿日期:2005-05-11 修回日期:1900-01-01 出版日期:2005-09-10 发布日期:2005-09-10

Cloning and Sequence Analysis of Cold and Longday Induced Expressed Genes from Sugar Beet (Beta vulgaris L.) Seedlings

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Received:2005-05-11 Revised:1900-01-01 Online:2005-09-10 Published:2005-09-10

摘要/Abstract

摘要： 以代表性差异分析cDNA-RDA(representational difference analysis of cDNA)方法获得在低温和长日照诱导甜菜(Beta vulgaris L)幼苗茎尖中差异表达的基因片段DP3，并进行了cDNA的末端快速扩增（rapid amplification of cDNA ends），经RT-PCR 扩增和基因组DNA中PCR扩增，克隆测序后获得1个全长609 bp的cDNA和855 bp的DNA序列，分别命名为Ty7Br600 和Ty7Br900，并在GenBank注册，登录号分别为AY324115和AY324114。在GenBank中比较未发现同源序列，可能为新基因。序列分析发现，Ty7Br600具有1个编码136个氨基酸的开放读码框（ORF）, Ty7Br900序列中存在1个内含子。分别以克隆的低温诱导甜菜幼苗cDNA为探针，分别进行Northern印记和Southern印记杂交。结果表明，cDNA差异片段只在低温诱导的甜菜中表达，在甜菜基因组中以2个拷贝或低拷贝形式存在。

关键词: 甜菜(Beta vulgaris L), 低温和长日照诱导, 代表性差异分析, 基因克隆, 序列分析

Abstract: cDNA representational difference analysis (cDNA-RDA) was applied to clone genes specifically expressed in cold and longday induced sugar beet (Beta vulgaris L.). One cDNA fragment was obtained after 3 rounds of subtractive hybridization and amplified by 3′-RACE and 5′-RACE. A sequence of 609 bp cDNA named Ty7Br600 and 855 bp DNA named Ty7Br900 were obtained respectively by RT-PCR and PCR after cloning and sequencing. Blasting in GenBank shows no homology with them, suggesting that it may be a novel gene of sugar beet. Results of Northern blotting and Southern blotting showed that the cDNA clone was only expressed in the cold induced sugar beet and low copy in sugar beet genome.

Key words: Sugar beet, Cold and longday induced, Representational difference analysis (cDNA-RDA), Gene cloning, Sequence analysis

戴建军,常缨,张美萍,李彩凤,马凤鸣. 甜菜幼苗低温和长日照诱导表达基因的克隆和序列分析[J]. 中国农业科学, 2005, 38(09): 1856-1862 .

,,,,. Cloning and Sequence Analysis of Cold and Longday Induced Expressed Genes from Sugar Beet (Beta vulgaris L.) Seedlings[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2005, 38(09): 1856-1862 .

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[1]	古丽旦,刘洋,李方向,成卫宁. 小麦吸浆虫小热激蛋白基因Hsp21.9的克隆及在滞育过程与温度胁迫下的表达特性[J]. 中国农业科学, 2023, 56(1): 79-89.
[2]	李雨泽,朱嘉伟,林蔚,蓝茉莹,夏黎明,张艺粒,罗聪,黄桂香,何新华. 香水柠檬RHF2A的克隆与互作蛋白的筛选[J]. 中国农业科学, 2022, 55(24): 4912-4926.
[3]	渠成,王然,李峰奇,罗晨. 烟粉虱味觉受体基因BtabGR1和BtabGR2的克隆与表达模式分析[J]. 中国农业科学, 2022, 55(13): 2552-2561.
[4]	张莉,张楠,江虎强,吴帆,李红亮. 中华蜜蜂NPC2基因家族克隆及表达模式分析[J]. 中国农业科学, 2022, 55(12): 2461-2471.
[5]	张璐,宗亚奇,徐维华,韩蕾,孙浈育,陈朝晖,陈松利,张凯,程杰山,唐美玲,张洪霞,宋志忠. 葡萄Fe-S簇装配基因的鉴定、克隆和表达特征分析[J]. 中国农业科学, 2021, 54(23): 5068-5082.
[6]	谭永安,姜义平,赵静,肖留斌. 绿盲蝽G蛋白偶联受体激酶2基因（AlGRK2）的表达分析及在绿盲蝽生长发育中的功能[J]. 中国农业科学, 2021, 54(22): 4813-4825.
[7]	王娜,赵资博,高琼,何守朴,马晨辉,彭振,杜雄明. 陆地棉盐胁迫应答基因GhPEAMT1的克隆及功能分析[J]. 中国农业科学, 2021, 54(2): 248-260.
[8]	谭永安,赵旭东,姜义平,赵静,肖留斌,郝德君. 绿盲蝽雷帕霉素靶蛋白的克隆、抗体制备及在蜕皮激素诱导下的应答[J]. 中国农业科学, 2021, 54(10): 2118-2131.
[9]	李祖任,罗丁峰,柏浩东,徐晶晶,韩进财,徐强,王若仲,柏连阳. 小飞蓬捕光叶绿素结合蛋白基因CcLhca-J9克隆及表达分析[J]. 中国农业科学, 2021, 54(1): 86-94.
[10]	周坤能,夏加发,云鹏,王元垒,马廷臣,张彩娟,李泽福. 水稻直立短穗突变体esp的转录组研究[J]. 中国农业科学, 2020, 53(6): 1081-1094.
[11]	沈静沅,唐美玲,杨庆山,高雅超,刘万好,程杰山,张洪霞,宋志忠. 葡萄钾离子通道基因VviSKOR的克隆、表达及电生理功能[J]. 中国农业科学, 2020, 53(15): 3158-3168.
[12]	唐斌,沈祺达,曾伯平,肖仲久,邱玲玉,潘碧莹,李昆,张道伟. 褐飞虱一个新的海藻糖合成酶基因的特性、发育表达及RNAi效果分析[J]. 中国农业科学, 2019, 52(3): 466-477.
[13]	蒋梦婷,朱宁,龚洪泳,侯应军,余心怡,渠慎春. ‘南通小方柿’赤霉素不敏感基因DkGAI2的克隆与功能分析[J]. 中国农业科学, 2019, 52(19): 3417-3429.
[14]	刘超，王玲利，吴頔，党江波，尚维，郭启高，梁国鲁. 枇杷叶片发育基因EjGRF5与启动子克隆及其在不同倍性枇杷中的表达[J]. 中国农业科学, 2018, 51(8): 1598-1606.
[15]	陈东凯，张林雅，邢振龙，雷仲仁. 美洲斑潜蝇气味结合蛋白OBP13的鉴定与功能[J]. 中国农业科学, 2018, 51(5): 893-904.