中国农业科学 ›› 2008, Vol. ›› Issue (9): 2670-2677 .doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.09.014

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柑橘类病毒的分子鉴定与分型

  

  1. 湖南农业大学园艺园林学院

  • 收稿日期:2007-08-29 修回日期:2007-12-17 出版日期:2008-09-01 发布日期:2008-09-01
  • 通讯作者: 邓子牛

  1. 湖南农业大学园艺园林学院

  • Received:2007-08-29 Revised:2007-12-17 Online:2008-09-01 Published:2008-09-01

摘要:

【目的】检测湖南地区柑橘所携带的柑橘类病毒类型,并鉴定柑橘类病毒的亚型。【方法】以田间柑橘枝条韧皮部为试材,提取总RNA,反转录成cDNA,再用不同类型类病毒的特异引物进行PCR扩增,鉴定出各个样品所携带的柑橘类病毒类型;通过测序分析各类型的序列,并与国内外报道的序列进行同源性分析,确定所测样品的亚型。【结果】建立了CEVd、CVdII、CVdⅢ等柑橘类病毒的RT-PCR检测方法。在5个供试样品中检测出3种类型的柑橘类病毒,即柑橘裂皮病类病毒(citrus exocortis viroid,CEVd)、柑橘类病毒Ⅱ型(citrus viriodⅡ,CVdⅡ,又名hop stunt viroid,HSVd)和柑橘类病毒Ⅲ型(citrus viriodⅢ,CVdⅢ),其中CVdⅡ和CVdⅢ为国内首次发现。亚型分析表明CVdⅡ可能为新的亚型;CVdⅢ为b亚型,可能具有矮化功能。【结论】在中国鉴定出3种类型的柑橘类病毒,CEVd与国内已报道的序列完全一致,其中CVdⅡ和CVdⅢ为首次在中国发现;检测到的CVdⅡ可能为新的亚型。

关键词: 柑橘, 类病毒, 检测, 序列分析, 分型

Key words: