【目的】探究不同茶树亲本和F1子代多酚类物质的遗传多样性,以及不同杂交组合多酚类物质的差异性和基因型的群体结构、亲缘关系,为亲本选配和品质改良的杂交育种提供参考。【方法】以12份不同亲本和87份F1子代茶树资源为试验材料,于2024—2025年测定12个多酚类物质指标,运用系统聚类、杂交组合差异分析、群体结构分析等方法进行多维度评价。【结果】多酚类物质变异系数为14.50%—89.34%,其中,小木麻黄素(STR)、1,2,6-三没食子酰基葡萄糖(1,2,6-TGG)、表儿茶素3-O-(3-O-甲基)没食子酸酯(EGCG3"Me)、没食子儿茶素没食子酸酯(GCG)和儿茶素没食子酸酯(CG)的变异系数较高,分别为89.34%、66.45%、64.22%、59.34%和58.12%。香农维纳指数为1.86—4.57,其中,表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)、三没食子酰基奎宁酸(TH)和没食子儿茶素没食子酸酯(GCG)的香农维纳指数较高,分别为4.57、4.45和4.23。多酚类物质的差异性分析中,‘保靖黄金茶1号’和‘安徽1号’F1子代的儿茶素没食子酸酯(CG)和三没食子酰基奎宁酸(TH)的含量均高于双亲,且表儿茶素3-O-(3-O-甲基)没食子酸酯(EGCG3"Me)与亲本趋势较为一致。通过多酚类物质聚类分析,将99份资源分为5个类群,第Ⅰ类群含49份资源,第Ⅱ类群含26份资源,第Ⅲ类群含20份资源,第Ⅳ类群和第Ⅴ类群各含2份资源。基于SNP位点的群体结构分析,将12份亲本和87份F1子代分为3个类群,类群Ⅰ包含46份资源,类群Ⅱ包含31份资源,类群Ⅲ包含22份资源,其中,类群Ⅰ全部由亲本‘保靖黄金茶1号’及其为父本(♂)的F1子代组成。3个类群的遗传多样性水平接近。亲缘关系分析结果显示,F1子代与其父本(♂)的亲缘关系更近。【结论】99份茶树资源具有丰富的遗传多样性;CG和TH可能存在超亲的杂种优势,EGCG3"Me在亲本与子代间的含量较为一致;生化成分聚类可将99份茶树资源分为5个类群,基于SNP的群体结构将其分为3个类群且遗传水平接近;在基因组水平上,多数杂交组合的F1子代与其父本表现出更高的相似性。