猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)定位

中国农业科学 ›› 2011, Vol. 44 ›› Issue (2): 395-401 .

猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)定位

张陈华,蔡绍倩,巩元芳,卢昕,殷宗俊,张勤

(安徽农业大学动物科技学院)

收稿日期:2010-05-04 修回日期:2010-06-26 出版日期:2011-01-15 发布日期:2011-01-15
通讯作者: 殷宗俊,张勤

Mapping of Quantitative Trait Loci Affecting Haematological Traits on Swine Chromosome 10

ZHANG Chen-hua, CAI Shao-qin, GONG Yuan-fang, LU Xin, YIN Zong-jun, ZHANG Qin

(安徽农业大学动物科技学院)

Received:2010-05-04 Revised:2010-06-26 Online:2011-01-15 Published:2011-01-15
Contact: YIN Zong-jun, ZHANG Qin

摘要/Abstract

摘要：

【目的】检测定位猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状位点。【方法】以3个品种(大白猪、长白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头试验猪组成资源群体,在猪10号染色体上共选取13个微卫星标记,采用基于线性混合模型方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)进行了检测。通过似然比检验,利用置换法确定显著性阈值。【结果】()13个标记在群体中绝大多数的微卫星属于中度多态的遗传标记,所有微卫星标记在3个品种中的平均等位基因数为3.1754,平均杂合度为0.5215,平均多态信息含量为0.5999,平均香浓指数为1.3222。(2)达到了染色体极显著水平的3个QTL(P＜0.01),分别是影响着红细胞压积(HCT)、血红蛋白含量(HGB)和平均红细胞体积(MCV),影响血小板总数(PLT)的QTL也达到染色体显著水平(P＜0.05)。【结论】定位的4个影响猪血常规的QTL集中在10号染色体81—136cM区域,临近的标记分别为SW249、SWR136、S0070和SW1894。

关键词: 猪, 微卫星, QTL定位, 血常规指标

Abstract:

【Objective】 The study was performed for detecting and mapping quantitative trait loci (QTL) affecting haematological traits on the swine chromosome 10. 【Method】 A pig resource population consisted 368 individuals of three breeds (Landrace, Large White and Songliao Black Pig) distributed in 16 boar families. Thirteen microsatellite markers on swine chromosome 10 were selected and a linear mixed model was used to detect quantitative trait loci (QTL) affecting 18 haematological traits including white blood cell count (WBC), and blood cell (RBC), and blood platelet counts (PLT). Then, the method of substitution was used to calculate significant threshold values by likelihood ratio test. 【Result】 Thirteen microsatellite markers of this population were the genetic markers of medium polymorphism. On average, the number of alleles was 3.1754, heterozygosity was 0.5215, and polymorphic information content was 0.5999, shannon index was 1.3222, respectively, during all microsatellite markers of three breeds. Four significant QTL (P＜0.05) were identified on chromosome 10 affecting HCT, HGB, MCV and PLT, respectively. 【Conclusion】 Four QTLs affecting haematological traits were found to be located at 81-136 cM on chromosome 10. The markers close by were SW249, SWR136, S0070, and SW1894.

Key words: swine, microsatellite, QTL mapping, haematological traits

张陈华,蔡绍倩,巩元芳,卢昕,殷宗俊,张勤
. 猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)定位[J]. 中国农业科学, 2011, 44(2): 395-401 .

ZHANG Chen-hua,CAI Shao-qin,GONG Yuan-fang,LU Xin,YIN Zong-jun,ZHANG Qin
. Mapping of Quantitative Trait Loci Affecting Haematological Traits on Swine Chromosome 10
[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2011, 44(2): 395-401 .

0
/ / 推荐

导出引用管理器 EndNote|Reference Manager|ProCite|BibTeX|RefWorks

链接本文: https://www.chinaagrisci.com/CN/

https://www.chinaagrisci.com/CN/Y2011/V44/I2/395

[1]	陈吉浩, 周界光, 曲翔汝, 王素容, 唐华苹, 蒋云, 唐力为, $\boxed{\hbox{兰秀锦}}$, 魏育明, 周景忠, 马建. 四倍体小麦胚大小性状QTL定位与分析[J]. 中国农业科学, 2023, 56(2): 203-216.
[2]	翟晓虎,李翎旭,陈小竹,蒋怀德,贺卫华,姚大伟. 肉中猪源性成分Real-time PCR定量检测技术[J]. 中国农业科学, 2023, 56(1): 156-164.
[3]	王一丹,杨发龙,陈弟诗,向华,任玉鹏. 猪腹泻病毒一步法多重TaqMan荧光定量RT-PCR检测法的建立及应用[J]. 中国农业科学, 2023, 56(1): 179-192.
[4]	王吉,张鑫,胡静荣,于智慧,朱迎春. 灭菌猪肉浆中发酵菌株脂质水解和氧化能力分析[J]. 中国农业科学, 2022, 55(9): 1846-1858.
[5]	李文慧,贺依静,姜瑶,赵红宇,彭磊,李佳,芮荣,剧世强. 伏马毒素B₁对猪体外成熟卵母细胞凋亡与自噬的影响[J]. 中国农业科学, 2022, 55(6): 1241-1252.
[6]	杨时鳗, 许程志, 许榜丰, 吴运谱, 贾云慧, 乔传玲, 陈化兰. H1N1亚型猪流感病毒HA蛋白225位氨基酸对病毒致病性的影响[J]. 中国农业科学, 2022, 55(4): 816-824.
[7]	童世锋,任智彬,林斐,葛雨竹,陶景丽,刘杨. 二花脸公猪不同耐冻性精子的蛋白质组学分析[J]. 中国农业科学, 2022, 55(23): 4743-4752.
[8]	刘进,胡佳晓,马小定,陈武,勒思,Jo Sumin,崔迪,周慧颖,张立娜,Shin Dongjin,黎毛毛,韩龙植,余丽琴. 水稻RIL群体高密度遗传图谱的构建及苗期耐热性QTL定位[J]. 中国农业科学, 2022, 55(22): 4327-4341.
[9]	陈彧,朱浩哲,陈益春,刘政,丁希,郭赟,丁世杰,周光宏. 猪肌肉干细胞在三维水凝胶中的分化研究[J]. 中国农业科学, 2022, 55(22): 4500-4512.
[10]	邹林翰,周新颖,张泽源,蔚睿,袁梦,宋晓朋,简俊涛,张传量,韩德俊,宋全昊. 小麦周8425B×小偃81重组自交系群体千粒重相关性状的QTL定位及单倍型分析[J]. 中国农业科学, 2022, 55(18): 3473-3483.
[11]	邢明杰,顾宪红,王枭鸿,郝月. IL-15过表达对猪骨骼肌细胞成肌分化的影响[J]. 中国农业科学, 2022, 55(18): 3652-3663.
[12]	杨昌沛,王乃秀,汪锴,黄子晴,林海烂,张莉,张晨,冯露秋,甘玲. 外源性γ-氨基丁酸抵抗仔猪氧化应激的效果及机制[J]. 中国农业科学, 2022, 55(17): 3437-3449.
[13]	常立国,何坤辉,刘建超. 多环境下玉米保绿相关性状遗传位点的挖掘[J]. 中国农业科学, 2022, 55(16): 3071-3081.
[14]	邓富丽,申丹,钟儒清,张顺芬,李滔,孙曙东,陈亮,张宏福. 体外法优化玉米—杂粕型饲粮的非淀粉多糖酶谱及其对育肥猪肠道微生物的影响[J]. 中国农业科学, 2022, 55(16): 3242-3255.
[15]	张冯禧,肖琦,朱家平,尹力鸿,赵霞玲,严明帅,徐晋花,温立斌,牛家强,何孔旺. 非洲猪瘟病毒P30蛋白单克隆抗体制备、鉴定及阻断ELISA方法的建立[J]. 中国农业科学, 2022, 55(16): 3256-3266.