中国农业科学 ›› 2008, Vol. 41 ›› Issue (8): 2302-2309 .doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.08.012

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激发子PB90诱导不结球白菜过敏性细胞死亡早期上调表达基因片段的分析

  

  1. 南京农业大学植物保护学院/农业部病虫监测与治理重点开放实验室
  • 收稿日期:2007-06-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-08-10 发布日期:2008-08-10
  • 通讯作者: 张正光

  1. 南京农业大学植物保护学院/农业部病虫监测与治理重点开放实验室
  • Received:2007-06-01 Revised:1900-01-01 Online:2008-08-10 Published:2008-08-10

摘要: 【目的】从基因组水平筛选不结球白菜中受激发子PB90诱导过敏性细胞死亡早期上调表达的基因。【方法】采用抑制性差减杂交的方法筛选疫霉菌激发子PB90注射处理不结球白菜叶片5 h内上调表达的基因。【结果】测定分析了200个上调表达的cDNA片段,生物信息学分析表明它们包含70个上调表达的基因片段,共分为9类:基本能量或代谢产物;蛋白质合成分解;细胞信号传导;细胞凋亡;转录;运输相关和编码未知功能的蛋白等。进一步用半定量RT-PCR分析了候选基因beclin,thioredoxin,HLA-B,MAP3K,SPT1, SPT2和AGO1,表明这7个基因在PB90诱导不结球白菜过敏性细胞死亡早期上调表达。【结论】构建了疫霉菌激发子PB90诱导不结球白菜过敏性细胞死亡早期抑制性差减杂交cDNA文库,获得了70个上调表达的基因,并对其中7个基因的可能功能进行预测分析,认为这些基因可能与疫霉菌激发子PB90诱导不结球白菜过敏性细胞死亡有关。这些基因的挖掘为进一步阐明过敏性细胞死亡的分子机制提供了素材。

关键词: PB90, 不结球白菜, 抑制性差减杂交, 上调, 过敏反应

Key words: PB90, non-heading Chinese cabbage, suppression subtractive hybridization, up-regulated, hypersensitive response