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1. 玉米大斑病菌LysM家族的鉴定及关键效应因子StLysM1对 植物免疫反应的调控作用
Xiaodong Gong, Dan Han, Lu Zhang, Guibo Yin, Junfang Yang, Hui Jia, Zhiyan Cao, Jingao Dong, Yuwei Liu, Shouqin Gu
Journal of Integrative Agriculture    2025, 24 (5): 1860-1874.   DOI: 10.1016/j.jia.2024.06.006
摘要86)      PDF    收藏

【目的】系统分析玉米大斑病菌LysM家族成员,筛选其中关键效应蛋白,并分析其对植物免疫反应的调控作用,为探究病菌致病性的分子机制奠定基础。【方法】利用生物信息学方法在玉米大斑病菌基因组中鉴定LysM家族成员,对其理化性质、进化关系、结构域及保守位点进行分析;基于转录组数据并结合qRT-PCR技术分析LysM家族基因在病菌侵染玉米过程中的表达模式;通过酵母分泌系统分析信号肽分泌活性;通过本氏烟瞬时表达系统分析关键效应蛋白StLysM1对植物免疫反应的调控作用;利用分子模拟和多糖结合试验检测LysM效应蛋白对几丁质的结合能力。【结果】在玉米大斑病菌基因组中共鉴定得到8LysM家族成员,分别命名为StLysM1~StLysM8,其中5个成员(StLysM1StLysM2StLysM5StLysM6StLysM7)为候选效应蛋白,这些效应蛋白均只含有LysM结构域,其他成员则含有额外的保守结构域。系统分析显示,StLysMs可分为真菌/细菌亚类和真菌特异亚类,其中真菌特异亚类的LysM结构域序列包含8GDxTC1229WNP31基序以及3个高度保守的半胱氨酸残基,而细菌/真菌亚类的LysM结构域序列保守位点较少。StLysM1基因在病菌侵染玉米24 h72 h过程中持续上调表达,其编码产物分泌蛋白,且在本氏烟中不能诱导植物的程序性细胞死亡(PCD),但可抑制由BAX/INF1诱导的PCDStLysM1自身不形成二聚体,但与几丁质结合,并抑制几丁质触发的活性氧爆发及病程相关基因NbPR1NbPR4的表达,提高本氏烟对灰葡萄孢的易感性。【结论】在玉米大斑病菌中共鉴定得到8StLysMs家族成员,其中StLysM1为关键效应因子,能够结合几丁质,进而抑制植物基础免疫促进病菌侵染。

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2. 小麦-黑麦抗白粉病6RL双端体附加与1R(1B)异代换系的创制与鉴定
Guohao Han, Jing Wang, Hanwen Yan, Lijun Cao, Shiyu Liu, Xiuquan Li, Yilin Zhou, Wei Liu, Tiantian Gu, Zhipeng Shi, Hong Liu, Lihui Li, Diaoguo An
Journal of Integrative Agriculture    2025, 24 (1): 72-84.   DOI: 10.1016/j.jia.2023.10.004
摘要61)      PDF    收藏

小麦白粉病严重威胁小麦的安全生产,利用抗病基因被认为是控制该病害最合适的措施。然而,品种间的相互杂交导致了当前主栽品种遗传背景的高度同质化。八倍体小黑麦是由小麦和黑麦人工合成的新物种,是小麦抗性改良的重要基因供体。本研究通过将八倍体小黑麦与普通小麦杂交,创制了抗白粉病小麦-黑麦后代YT5。通过基因组原位杂交、多色荧光原位杂交、多色基因组原位杂交和分子标记分析,证明YT56RL双端体附加与1R(1B)异代换系。白粉病遗传分析表明YT5的白粉病抗性来源于其黑麦6RL染色体。苗期利用不同白粉病菌株接种YT5, 发现YT5的叶片出现明显孢子,随后产生坏死反应,到成株期时植株表现为高抗,与黑麦染色体6RL上已报道的Pm基因表型不同。同时,YT5农艺性状较好,可作为优良桥梁材料应用于小麦遗传改良。为促进YT56RL上白粉病抗性的转移,选择并验证了两个黑麦6RL特异KASP标记,它们能够在不同小麦背景下检测该染色体臂,有效服务于分子标记辅助选择育种。

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3. 有机肥替代化肥降低节水灌溉稻田N2O排放的潜力及微生物学机制研究
Delei Kong, Xianduo Zhang, Qidong Yu, Yaguo Jin, Peikun Jiang, Shuang Wu, Shuwei Liu, Jianwen Zou
Journal of Integrative Agriculture    2024, 23 (9): 3159-3173.   DOI: 10.1016/j.jia.2024.03.047
摘要97)      PDF    收藏
节水灌溉策略可以有效减少稻田甲烷排放,但由于土壤含氧量和氧化还原电位的变化,会强烈刺激氧化亚氮(N2O)的排放。然而,目前有关不同施肥措施下节水灌溉稻田土壤N2O排放与氮(N)循环功能基因之间的关系却很少被研究。此外,有机肥替代化肥对稻田N2O排放的减排潜力及微生物学机制有待进一步阐明。本研究分析了我国东南部连续两年不同施肥措施对稻田土壤N2O排放和相关功能微生物【氨氧化古菌(AOA)、氨氧化细菌(AOB)、nirSnirKnosZ】的影响。共设置了三个试验处理:不施氮肥(Control)、化学氮肥(Ni)和有机肥部分替代化学氮肥(Ni+No)。研究结果表明,平均两个水稻生长季,Control、Ni和Ni+No处理的N2O累积排放量分别为0.47、4.62和4.08 kg ha−1。与Ni处理相比,Ni+No施肥措施在保障水稻产量的同时,显著降低了土壤N2O排放量11.6%,其N2O排放因子(EF)为0.95%。与Control处理相比,施用氮肥可以显著提高AOB、nirSnirKnosZ基因丰度。有机肥部分替代化学氮肥显著降低了AOB和nirS基因丰度,但增加了nosZ基因丰度。AOB对氮肥的响应比AOA更敏感。N2O累积排放量与AOB、nirS基因丰度呈正相关关系,而与nosZ基因丰度、nosZ/nirS比值呈负相关关系。综上所述,在节水灌溉稻田中,有机肥替代化学氮肥可以减少土壤N2O排放,主要通过改变土壤NO3--N、pH和DOC含量,从而抑制硝化过程的氨氧化和反硝化过程的亚硝酸盐还原,以及增强反硝化过程的N2O还原。
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4.

生长素原初响应基因MdGH3-2/12的沉默降低了苹果对腐皮镰孢菌的抗性

Qianwei Liu, Shuo Xu, Lu Jin, Xi Yu, Chao Yang, Xiaomin Liu, Zhijun Zhang, Yusong Liu, Chao Li, Fengwang Ma
Journal of Integrative Agriculture    2024, 23 (9): 3012-3024.   DOI: 10.1016/j.jia.2024.03.003
摘要92)      PDF    收藏
苹果再植病(ARD)严重降低了苹果产业的产量和质量。腐皮镰孢菌(F. solani)已被报道为引起ARD的主要病原微生物之一。生长素(吲哚-3-乙酸,IAA)作为一种内源性植物激素,几乎参与了植物所有生长发育过程,并在植物对病原体的免疫中发挥作用。Gretchen Hagen3GH3)是早期/初级生长素响应基因之一。本研究的目的是通过用腐皮镰孢菌处理MdGH3-2/12 RNAi植株来评估MdGH3-2MdGH3-12在腐皮镰孢菌防御反应中的作用。结果表明,在腐皮镰孢菌侵染下,MdGH3-2/12 RNAi抑制了植株生物量的积累,加重了根系损伤。接种腐皮镰孢菌后,MdGH3-2/12 RNAi抑制了酰胺合成酶的生物合成。这导致游离IAA与氨基酸结合受到抑制,最终导致过量的游离IAA积累。过量的游离IAA改变了植物组织结构,加速了真菌菌丝的入侵,降低了抗氧化酶(SOD、POD和CAT)的活性,增加了活性氧(ROS)水平,降低了总叶绿素含量和光合能力,同时调节了PR1PR4PR5PR8等相关抗病基因的表达。此外还改变了植物激素和氨基酸的含量,最终降低了苹果植株对腐皮镰孢菌的抗性。总之,这些结果表明MdGH3-2MdGH3-12在ARD中对腐皮镰孢菌的抗性起着重要作用。
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5. 小麦条锈菌新菌系Yr5毒力小种比当前流行小种具有高寄生适合度和潜在流行风险
Gensheng Zhang, Mudi Sun, Xinyao Ma, Wei Liu, Zhimin Du, Zhensheng Kang, Jie Zhao
Journal of Integrative Agriculture    2024, 23 (8): 2674-2685.   DOI: 10.1016/j.jia.2023.11.005
摘要110)      PDF    收藏

小麦条锈病是小麦最具破坏性的真菌病害之一,严重威胁着世界范围内小麦的安全生产。在中国,新的生理小种出现并迅速发展成为优势小种,导致小麦抗性品种丧失抗性,进而被迭代更替,造成小麦产量大幅下降。因此为了预测一个新小种能否成为流行优势小种具有重要意义。本研究中,在10个中国小麦品种上对两个新出现的Yr5毒力小种(TSA-6TSA-9)与四个目前占优势的中国小种(CYR31CYR32CYR33CYR34)的相对寄生适应性进行了评价。将 6 测试条锈菌小种接种二叶期的小麦幼苗,接种后第 5 天,测量以下参数或指标对测试小种的寄生适合度进行评估,包括孢子萌发率(Urediospore germination rate)、孢子形成能力(Sporulation capacity)、潜育期(Latent period)、夏孢子堆长度(Length of the uredia)、夏孢子堆密度(Uredia density)、产孢期(Sporulation period)、病害严重度(Disease severity)和侵染表型(Infection type)。当小麦品种对测试条锈菌小种(即小种-品种亲和组合)感病时,测量寄生适合度参数。结果显示,基于多重比较(LSD)分析,总体测试小种之间的相对寄生适应度参数存在显著差异(P<0.05)。寄生适应度参数进行主成分分析(PCA分析其中代表产孢能力的主成分贡献率是 53.78%,代表扩展能力和孢子活力的主成分贡献率是 21.89%,代表潜在侵染能力的主成分贡献率是 17.46%累计贡献率超过90%,表明这三个主成分基本能够代表测试小种所有相对寄生适合度参数的绝大部信息。本研究还构建了三个主成分和综合因子得分数学模型,基于计算结果表明Yr5毒力小种TSA-9TSA-6的相对寄生适应度均高于CYR34CYR31CYR33,但低于小种CYR32具有发展成为优势小种潜在风险。因此,需要对两个Yr5毒力小种及其变异菌系进行持续监测。在小麦育种中应避免单使用具有Yr5抗性基因的小麦品种(系),并建议与其他有效的Yr基因聚合使用

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6. 草地贪夜蛾瞬时受体电位通道基因的鉴定及TRPA1的功能研究
Yutong Zhang, Hangwei Liu, Song Cao, Bin Li, Yang Liu, Guirong Wang
Journal of Integrative Agriculture    2024, 23 (6): 1994-2005.   DOI: 10.1016/j.jia.2023.09.023
摘要126)      PDF    收藏

草地贪夜蛾是一种极具破坏性的害虫,由于其强大的繁殖和迁飞能力,已成为一种全球性害虫。瞬时受体电位(Transient Receptor PotentialTRP通道一个庞大的离子通道家族,在昆虫感知外界环境和维持内部稳态中发挥着举足轻重的作用。近年来,TRP通道在昆虫行为调控中的重要作用得到了广泛的研究。本研究草地贪夜蛾基因组中鉴定了15TRP基因座共编码26个转录本,并分析了其在不同发育阶段的表达谱。结果表明,草地贪夜蛾含有4TRPC基因、6TRPA基因、1TRPM基因、2TRPV基因、1TRPN基因和1TRPML基因,但并未鉴定到TRPP基因。此外,利用爪蟾卵母细胞表达系统对SfruTRPA1功能进行了鉴定,SfruTRPA1能被20 ~ 45℃范围内的升高温度激活,在相同温度范围内重复刺激后无明显脱敏现象。外,SfruTRPA1能被天然化学物质异硫氰酸烯丙酯(allyl isothiocyanate, AITC)和肉桂醛(cinnamaldehyde, CA)激活研究草地贪夜蛾的TRP通道基因进行了鉴定,为开发针对TRP通道的新型农药提供了靶标,也为全面解析TRP通道在昆虫生理功能中的作用奠定了基础。

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7. 新型四氢β-咔啉衍生物的发现和构效关系研究及其作为凋亡诱导剂控制植物细菌性病害
Shanshan Su, Hongwu Liu, Junrong Zhang, Puying Qi, Yue Ding, Ling Zhang, Linli Yang, Liwei Liu, Xiang Zhou, Song Yang
Journal of Integrative Agriculture    2024, 23 (4): 1259-1273.   DOI: 10.1016/j.jia.2023.05.031
摘要140)      PDF    收藏

开发高活性、环境友好的绿色新农药是保护农作物健康和食品安全的重要手段。为了发现新的候选杀菌剂,本研究论文采用Pictet–Spengler反应制备了一系列新颖的1,2,3,4-四氢-β-咔啉(THC)衍生物,并评估了其对水稻白叶枯病菌Xoo)、柑橘溃疡病菌Xac)和猕猴桃溃疡病菌Psa)的离体活体生物活性结果表明,大多数目标化合物对三种植物病原都表现出良好的生物活性。其中,化合物A17水稻白叶枯病菌柑橘溃疡病菌表现优异抑菌活性,其EC50值分别为7.27 mg mL-14.89 mg mL-1化合物A8猕猴桃溃疡病菌显示出好的抑制活性,其EC50值为4.87 mg mL-1此外,在200 mg mL-1浓度下,化合物A17水稻白叶枯病(52.67%)柑橘溃疡病(79.79%)表现出优异的防治效果,化合物A8猕猴桃溃疡病的防治效果为84.31%构效关系研究表明:THCA环的C6位无取代基时有利于提高其抑菌活性;对于 THCC环,当N2位是NH基团是有利于提高其抑菌活性;此外,THCC环的NH位置引入长链可以增强其抗菌活性。通过大量的生物学实验验证,THC衍生物能扰乱细菌体内的氧化还原系统,造成细菌活性氧的爆发细胞膜的破坏,最终导致细菌的死亡。上述的研究工作为以THC为活性骨架的新型杀菌剂创制提供了重要参考

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8. Proteomic Analysis of Wheat Seed in Response to Drought Stress
ZHANG Yu-feng, HUANG Xiu-wen, WANG Li-li, WEI Liu, WU Zhi-hui, YOU Ming-shan , LI Bao-yun
Journal of Integrative Agriculture    2014, 13 (5): 919-925.   DOI: 10.1016/S2095-3119(13)60601-2
摘要2363)      PDF    收藏
Drought stress is one of the major factors affecting in wheat yield and grain quality. In order to investigate how drought stress might influence wheat quality during grain filling, three wheat cultivars Gaocheng 8901, Jagger and Nongda 3406 were subjected to drought stress during the grain filling stage. Neither globulin and glutenin, nor the relative percentage of amylose significantly changed following drought treatments, whereas albumin and gliadin concentrations did. The SDS-sedimentation, which has a strong linear correlation with wheat baking quality was markedly decreased following drought stress. These results indicated that drought had an adverse effect on wheat quality. In order to investigate the protein complexes in the wheat flour, the data from native PAGE and SDS-PAGE were combined and a total of 14 spots were successfully identified, and of these eight protein types were determined to be potential complex forming proteins.
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9. 基于转录-代谢和组织解剖的不同干旱处理下谷子光合差异因子解析
Jing Wang, Zexin Sun, Lei Tian, Wei Sun, Xinning Wang, Zhihao Wang, Zhiying Wang, Zhao Li, Wei Liu, Qianchi Ma, Chuanyou Ren, Xinning Gao, Yue Li, Liwei Wang, Xiaoguang Wang, Chunji Jiang, Chao Zhong, Xinhua Zhao, Haiqiu Yu
Journal of Integrative Agriculture    DOI: 10.1016/j.jia.2024.04.001
录用日期: 2024-04-28

10. 一种快速检测和定量小麦叶片中潜伏侵染白粉病菌的方法
Aolin Wang, Ru Jiang, Meihui Zhang, Hudie Shao, Fei Xu, Kouhan Liu, Haifeng Gao, Jieru Fan, Wei Liu, Xiaoping Hu, Yilin Zhou, Xiangming Xu
Journal of Integrative Agriculture    DOI: 10.1016/j.jia.2024.06.004
录用日期: 2024-07-01

11. 橘小实蝇转基因系统的开发及其在嗅觉靶标研究中的应用潜力
Jie Zhang, Qi Wang, Jinxi Yuan, Zhen Tian, Shanchun Yan, Wei Liu, Guirong Wang
Journal of Integrative Agriculture    DOI: 10.1016/j.jia.2024.07.021
录用日期: 2024-07-18