马传染性贫血病病毒L株前病毒全基因组核苷酸序列分析

中国农业科学 ›› 2001, Vol. 34 ›› Issue (6): 690-696 .

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马传染性贫血病病毒L株前病毒全基因组核苷酸序列分析

刘红全,王柳,杨志彪,孔宪刚,童光志

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室

出版日期:2001-06-20 发布日期:2001-06-20

中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室

Online:2001-06-20 Published:2001-06-20

摘要/Abstract

摘要： 本实验所用的马传染性贫血病毒（ＥＩＡＶ）Ｌ株（ＥＩＡＶ－Ｌ）是我国研制成功的ＥＩＡＶ弱毒疫苗的原始强毒株。以ＥＩＡＶ－Ｌ感染马外周血液白细胞中ＤＮＡ为模板，利用ＰＣＲ技术，分４个片段扩增ＥＩＡＶ－Ｌ前病毒ＤＮＡ，并分别克隆到载体质粒ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔＳＫ中，得到４个重组质粒ｐ２．８、ｐ２．４、ｐ３．１和ｐ１．２，经酶切鉴定后测序。对测序结果分析、拼接，得到ＥＩＡＶ－Ｌ前病毒基因组全序列。ＥＩＡＶ－Ｌ前病毒基因组全长８２３５ｂｐ，其中Ｇ＋Ｃ含量为３８％。通过使用计算机软件ＤＮＡＳＩＳ分析，ＥＩＡＶ－Ｌ与马传贫驴强毒和马传贫驴白细胞疫苗毒序列同源性分别为９８．４％和９６．９％。同源性如此接近反映了它们之间的亲缘关系，另外ＥＩＡＶ－Ｌ与驴强毒的同源性高于其与驴白细胞弱毒疫苗株的同源性，这符合驴白细胞弱毒疫苗株的衍生过程。基因组两端是长为３１６ｂｐ的ＬＴＲ，其中Ｕ３为１９７ｂｐ，Ｒ为８０ＢＰ，Ｕ５为３９ｂｐ。前病毒基因组有３个较大的开放阅读框架（ＯＲＦ），分别编码ｇａｇ、ｐｏｌ和ｅｎｖ基因。ｇａｇ基因位于７１３～１９１２位碱基之间，全长１２００ｂｐ；ｐｏｌ基因位于１７０８～５１０９位碱基之间，全长

关键词: 马传染性贫血病毒, L株, 前病毒核替酸, 序列分析

Key words: NULL

刘红全,王柳,杨志彪,孔宪刚,童光志. 马传染性贫血病病毒L株前病毒全基因组核苷酸序列分析[J]. 中国农业科学, 2001, 34(6): 690-696 .

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