柚cDNA中NBS-LRR类R基因同源序列的分离

中国农业科学 ›› 2004, Vol. 37 ›› Issue (10): 1580-1584 .

• 研究简报 • 上一篇

柚cDNA中NBS-LRR类R基因同源序列的分离

黄代青,王平,吕柳新

中国农业大学植物营养系

收稿日期:2002-11-27 修回日期:2004-03-25 出版日期:2004-10-20 发布日期:2004-10-20
通讯作者: 王平

Isolation of NBS-LRR Class Resistance Gene Analogs from Stigma cDNA of Pomelo (Citrus grandis cv. guanxi)

中国农业大学植物营养系

Received:2002-11-27 Revised:2004-03-25 Online:2004-10-20 Published:2004-10-20

摘要/Abstract

摘要： 提取柚花柱的总RNA，通过逆转录合成其cDNA，根据已知植物抗病基因（R基因）的NBS保守区设计简并引物，对cDNA进行扩增，获得大小约为500 bp的PCR产物，对连接产物进行酶切归类，筛选得到不同类别的克隆12个，并进行了测序。通过序列同源比较分析发现，其中有10个片段属于NBS-LRR类抗病基因的同源序列（RGA），与已知植物R基因相应区段的氨基酸序列的同源性为11.5%～47.1%。

关键词: 柚子, R基因, NBS-LRR类R基因同源序列

Abstract: Degenerate oligonucleotide primers based on conserved motifs in the nucleotide binding site (NBS) region of known resistance proteins were used to amplify sequences from stigma cDNA of pomelo (Citrus grandis cv. guanxi) at anthesis by polymerase chain reaction (PCR). A bright band of about 500 bp was obtained. After cloning, 12 classes of clones were selected for sequencing. Searching in the GenBank database using BLAST revealed that 10 classes of sequences showed high level of amino acid similarity to several cloned NBS-LRR class plant resistance genes and many RGAs from other plant species. These pomelo resistance gene analogs (RGAs) are all　expressed sequences because of coming from cDNA. Therefore, they are valuable probes for screening candidate disease genes in pomelo.

Key words: Pomelo, R gene, NBS-LRR class R gene analogs

黄代青,王平,吕柳新. 柚cDNA中NBS-LRR类R基因同源序列的分离[J]. 中国农业科学, 2004, 37(10): 1580-1584 .

,,. Isolation of NBS-LRR Class Resistance Gene Analogs from Stigma cDNA of Pomelo (Citrus grandis cv. guanxi)[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2004, 37(10): 1580-1584 .

0
/ / 推荐

导出引用管理器 EndNote|Reference Manager|ProCite|BibTeX|RefWorks

链接本文: https://www.chinaagrisci.com/CN/

https://www.chinaagrisci.com/CN/Y2004/V37/I10/1580

[1]	宋桃伟，蔡惠芬，罗卫星，刘若余，张依裕，孙岩岩，刘彬. 两个贵州山羊品种GHSR和GHRL基因遗传变异及其与生长性状的关联性[J]. 中国农业科学, 2015, 48(1): 140-153.
[2]	杜晓惠, 李丛艳, 刘俊莹, 牛伟贺, 张细权. 鸡催乳素受体基因多态性与就巢及产蛋性状的关联分析[J]. 中国农业科学, 2013, 46(12): 2558-2565.
[3]	王宵燕, 何庆玲, 经荣斌, 宋成义. ESR基因在苏姜猪世代选育中的遗传变异及与猪群繁殖性状的关联[J]. 中国农业科学, 2012, 45(4): 768-773.
[4]	孙伟, 李达, 马月辉, 关伟军, 储明星, 丁家桐, 李碧春, 张有法, 陈玲, 吴文忠, 周洪. 湖羊GHR和IGF-Ⅰ基因表达的发育性变化及其与肉质性状的关联[J]. 中国农业科学, 2012, 45(22): 4678-4687.
[5]	王廿, 鄢锦辉, 张开春, 王晶, 张晓明, 闫国华. 甜樱桃DFR基因内含子2和内含子3的多态性[J]. 中国农业科学, 2012, 45(2): 320-329.
[6]	岳磊, 陈雪影, 庄娜, 何家欣, 时伟, 廖晓萍, 刘雅红. 动物源qnr基因阳性肠杆菌I类整合子的研究[J]. 中国农业科学, 2012, 45(2): 385-390.
[7]	吴井生, 王金玉. FSHR基因第10外显子多态性及其与小梅山猪产仔数的相关性[J]. 中国农业科学, 2012, 45(13): 2728-2736.
[8]	黄贺,狄生伟,田亚光,王希彪,李和平,张贵学 . 民猪PRLR基因PCR-SSCP多态性与产仔数关联分析[J]. 中国农业科学, 2011, 44(11): 2341-2346 .
[9]	陈从英,朱万成,李平华,魏娜,郭源梅,高军 . 白色杜洛克×二花脸F2资源群体中催乳素（PRL）和催乳素受体（PRLR）基因与母猪杀婴行为和产仔数关联性研究 [J]. 中国农业科学, 2010, 43(11): 2347-2354 .
[10]	. PPAR基因在鹅肥肝形成中的可调节性表达[J]. 中国农业科学, 2008, 41(10): 3270-3276 .
[11]	李轶女,孙丙耀,苏宁,孟祥勋,张志芳,沈桂芳. 水稻叶绿体表达体系的建立及抗PPT叶绿体转化植株的获得[J]. 中国农业科学, 2007, 40(9): 1849-1855 .
[12]	邵铁梅,宋福平,李卓夫,张杰,姜声华,刘大群,黄大昉. 产Zwittermicin A的苏云金芽孢杆菌菌株的筛选及抗性基因zmaR的克隆与表达[J]. 中国农业科学, 2005, 38(09): 1811-1816 .
[13]	曹必好, 雷建军, 夏勇, 宋洪元, 陈国菊, David J. Oliver. 结球甘蓝NBS-LRR类R基因同源序列的分离[J]. 中国农业科学, 2004, 37(07): 1081-1081 .
[14]	霍秀文, 魏建华, 徐春波, 米福贵, 云锦凤. 冰草种间杂种蒙农杂种组织培养再生和遗传转化体系的建立[J]. 中国农业科学, 2004, 37(05): 642-642 .
[15]	程仲毅,薛庆中. 马铃薯蛋白酶抑制剂-Ⅱ基因在转基因水稻中的遗传及表达[J]. 中国农业科学, 2003, 36(6): 603-609 .

柚cDNA中NBS-LRR类R基因同源序列的分离

Isolation of NBS-LRR Class Resistance Gene Analogs from Stigma cDNA of Pomelo (Citrus grandis cv. guanxi)

PDF

赞

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

Metrics

本文评价

推荐阅读 0