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小麦TaDRO与根系形态的关联分析及在中国和全球 品种中的地理分布与演变
张维军, 李甜, 秦琳, 赵静, 赵俊杰, 柳洪, 侯健, 郝晨阳, 陈东升, 魏亦勤, 景蕊莲, 张学勇
中国农业科学    2018, 51 (10): 1815-1829.   DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2018.10.001
摘要   (597 HTML41 PDF(pc) (3498KB)(494)  

目的 根系改良是提高小麦抗逆性和产量的关键因素之一。通过克隆不同根系类型小麦品种的根系相关基因TaDRO,分析其与小麦重要农艺性状的关系,开发标记,为品种改良提供理论依据和技术支撑。方法 以根系性状多态性较高的21份普通小麦为材料,测序分析TaDRO-5ATaDRO-5BTaDRO-5D的序列多态性;利用“中国春”-缺体四体材料对其进行染色体定位,并用最新版的中国春基因组序列对其进行精细物理定位,根据TaDRO-5ATaDRO-5B序列多态性开发分子标记;以323份普通小麦构成的自然群体为材料进行TaDRO单元型与表型性状的关联分析。结果 克隆了小麦TaDRO的A、B、D基因组序列,利用最新版的中国春基因组序列分别将TaDRO-5ATaDRO-5BTaDRO-5D定位于小麦染色体5A、5B和5D上,分别位于426.15、381.00和327.60 Mb处;在TaDRO-5A全长序列中共检测到3个SNP,形成Hap-5A-AHap-5A-C 2种单元型,根据启动子区-2 271 bp的序列差异,开发出分子标记TaDRO-5A-KASP。在TaDRO-5B全长序列中共检测到17个SNP和1个InDel,形成Hap-5B-ⅠHap-5B-Ⅱ 2种单元型,根据-300 bp的InDel开发了分子标记TaDRO-5B-InDel。关联分析表明,TaDRO-5A与株高、千粒重和根系生长角度显著相关,Hap-5A-A是增大根系生长角度、降低株高、增加千粒重的浅根型单元型,而Hap-5A-C是减小根系生长角度、增加株高、降低千粒重的深根型单元型。TaDRO-5B与株高显著相关,Hap-5B-Ⅰ是增加株高和降低千粒重的深根型单元型,Hap-5B-Ⅱ是降低株高和增加千粒重的浅根型单元型。在地方品种中,Hap-5A-CHap-5B-Ⅰ为优势单元型,在育成品种中,Hap-5A-AHap-5B-Ⅱ为优势单元型;深根型单元型Hap-5A-CHap-5B-Ⅰ在干旱、半干旱麦区品种中的分布频率高于湿润麦区;在全球地理分布中,干旱麦区品种中Hap-5A-C为优势单元型,但Hap-5B-I优势不明显。随着育种年代推进,小麦品种中浅根型单元型Hap-5A-AHap-5B-Ⅱ的频率增加。结论 小麦根系相关基因TaDROHap-5A-CHap-5B-Ⅰ是增加株高和降低千粒重的深根型单元型,Hap-5A-AHap-5B-Ⅱ是降低株高和增加千粒重的浅根型单元型;随着灌溉和化肥用量的增加,中国小麦品种逐步由深根、高秆类型转变为浅根、矮秆类型;利用分子标记选择矮秆、深根类型,可能提高品种水肥利用效率。


年份
Year
地点
Site
环境
Environments
TaDRO-5A TaDRO-5B
株高PH
P-value
千粒重TKW
P-value
根角度RGA
P-value
株高PH
P-value
根角度RGA
P-value
2015 顺义
Shunyi
水WW ns ns 0.0017**
旱DS ns 0.0431* ns
水热HE 0.0310* 0.0252* 0.0011**
旱热DE 0.0165* 0.0209* 0.0223*
2016 昌平
Changping
水WW 0.0223* ns 0.0364*
旱DS ns ns 0.0017**
顺义
Shunyi
水WW 0.0160* 0.0342* 0.0133*
旱DS 0.0148* 0.0198* 0.0327*
水热HE 0.0108* ns 0.0095**
旱热DE 0.0243* ns 0.0122*
2016 实验室 Lab 0.04984* ns
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表1 小麦自然群体TaDRO-5ATaDRO-5B单元型与农艺性状的关联分析
正文中引用本图/表的段落
表1   小麦自然群体TaDRO-5ATaDRO-5B单元型与农艺性状的关联分析
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