本研究在花椒中鉴定了270个MYB基因,并将其分为四个亚家族。 R2R3-MYB (ZbMYB) 包含251个基因,根据系统发育结果和序列相似性分为33个亚科。这些亚科中有24个同时包含花椒MYB和拟南芥AtMYB,9个仅包含花椒或拟南芥。具有相似功能的ZbMYB聚集在同一亚科中,表明功能保守。亚细胞定位分析预测大多数ZbMYB基因存在于细胞核中。转座复制在花椒MYB基因家族的扩展中起主要作用。通过系统发育分析和转录组分析,发现28个ZbMYB基因可能调控花椒中黄酮类化合物的生物合成,这些基因呈现出独特的时空表达模式。在花椒果实不同发育阶段,通过qRT-PCR分析得出EVM0042160和EVM0033809基因的表达模式与花椒中的黄酮类和花青素物质含量曲线非常相似。进一步相关性分析表明,不同发育阶段花椒果实的黄酮类物质含量与28个ZbMYB基因的转录本丰度具有不同程度的相关性。这些结果表明ZbMYB基因可能参与了花椒中黄酮类物质代谢途径。对为花椒中MYB基因家族全面系统分析以及进一步研究MYB转录因子的功能奠定了坚实的基础。