糯玉米是主要的鲜食玉米类型之一,waxy基因突变导致了玉米籽粒的糯性。中国糯玉米地方品种丰富,云南及其周边地区被认为是糯玉米的起源中心和遗传多样性中心。已知中国糯玉米waxy等位基因包括wx-D7、wx-D10、wx-Cin4、wx-124、wx-Reina和wx-xuanwei。这些等位基因的突变位点都发生在waxy基因的编码区,而调控区引起waxy基因的突变在玉米中却鲜有报道。本研究以405份云南糯玉米地方品种为材料,通过分子标记检测,鉴定waxy基因上游3.5Kb调控区的大片段插入和缺失。研究发现三类不同的waxy等位基因:wx-PIF/Harbinger、wx-hAT和wx-Elote2。三类等位基因分别属于304bp的PIF/Harbinger家族 MITE类转座子的插入、560bp的hAT家族MITE类转座子的插入和6560bp的LTR-like转座子的插入。此外研究中完成了云南70%以上的糯玉米地方品种waxy等位基因的鉴定,可为糯玉米地方品种的利用提供基础
杂交水稻为世界粮食的供应做出了重大贡献,而骨干亲本在杂交水稻品种选育中发挥着重要作用。为明确水稻骨干亲本蜀恢527(SH527,Oryza sativa)在育种过程中所利用的关键基因组区域,本研究对其进行了基于系谱的全基因组分析。利用高密度单核苷酸多态性(SNP)阵列对包括SH527、6个亲本品种及17个衍生恢复系在内的24个品种进行了扫描,分析了上游亲本对SH527基因组的独特贡献,确定了SH527及其衍生品种中保守的关键基因组区域。同时,利用多年的产量性状数据和SNP 芯片结果进行全基因组关联分析,发现了一些可能的已知或新的产量性状的关联位点。这项研究初步揭示了SH527育种的关键区域,将为后续育种提供参考。杂交水稻为世界粮食的供应做出了重大贡献,而骨干亲本在杂交水稻品种选育中发挥着重要作用。为明确水稻骨干亲本蜀恢527(SH527,Oryza sativa)在育种过程中所利用的关键基因组区域,本研究对其进行了基于系谱的全基因组分析。利用高密度单核苷酸多态性(SNP)阵列对包括SH527、6个亲本品种及17个衍生恢复系在内的24个品种进行了扫描,分析了上游亲本对SH527基因组的独特贡献,确定了SH527及其衍生品种中保守的关键基因组区域。同时,利用多年的产量性状数据和SNP 芯片结果进行全基因组关联分析,发现了一些可能的已知或新的产量性状的关联位点。这项研究初步揭示了SH527育种的关键区域,将为后续育种提供参考。