RNAi介导的有害生物防控策略是农业生物技术领域的最新突破之一。但是,目前对RNAi防控策略可能产生的脱靶效应仍未完全了解。本文中,我们研究了两种昆虫致死基因siRNA在靶标和非标靶昆虫中的脱靶效应。结果表明,致死基因siRNA的脱靶效应广泛存在于靶标昆虫和非靶标昆虫中。我们根据基因的同源性、相关KEGG途径以及与siRNA序列的连续匹配度,对所有表达量受影响的基因进行了分类。出人意料的是,非靶标基因表达量受影响的程度与序列的连续匹配度并不一直。而少部分同源基因和KEGG相关基因的表达量正如预期的一样发生了显著变化。通过计算转录组熵值,结果表明尽管在siRNA处理后数百个基因的表达受到影响,但转录组的熵值保持不变,这表明转录组的表达模式在整体上是平衡的。本文的结果表明,siRNA与非靶标生物中的单个基因发生交叉反应,但在基因组水平上对靶标和非靶标生物中转录组完整性并没有显着影响。同时,本文提出了一种评估昆虫致死基因siRNA脱靶效应的体系,将有助于评估RNAi害虫防控策略的安全性。