小麦TaNAC基因基于可变剪切和microRNA的转录后调控分析

吕士凯,马小龙,张敏,邓平川,陈春环,张宏,刘新伦,吉万全

Post-transcriptional Regulation of TaNAC Genes by Alternative Splicing and MicroRNA in Common Wheat (Triticum aestivum L.)

LÜ ShiKai,MA XiaoLong,ZHANG Min,DENG PingChuan,CHEN ChunHuan,ZHANG Hong,LIU XinLun,JI WanQuan

表3 克隆得到的13组TaNAC结构变异转录本中正常编码产物的结构特征和理化性质

Table 3 Structural characteristics and physicochemical properties of the peptides encoded by the 13 groups of normal encoding transcripts selected from the cloned TaNAC transcripts

分组 Groups 克隆的转录本名称 Name of cloned transcripts 肽链长度 Peptide length (aa) NAM结构域 起止位置 NAM start_end (aa) 跨膜结构域位置 Topology of TMHs 脂肪系数 Aliphatic index 亲水性总 平均值 GRAVY 不稳定系数 Instability index 理论等电点 pI 预测的亚细胞定位 Predicted subcellular localization 1 TaNAC_NTL5_7B.2 643 23—149 o620—642i 71.12 -0.424 36.32 4.63 细胞核 Nu TaNAC_NTL5_7B.3 292 无 None o269—291i 70.45 -0.114 40.41 4.61 胞外/细胞核 Ex / Nu 2 TaNAC008_3A.1 481 10—136 o448—470i 72.45 -0.554 35.92 5.67 细胞核/细胞质 Nu / Cy TaNAC008_3A.2 198 10—136 无 None 65.56 -0.809 37.89 9.08 细胞质 Cy 3 TaNAC013_3A.1 338 73—212 无 None 63.08 -0.656 35.37 8.83 细胞核/线粒体 Nu / Mi TaNAC013_3A.2 338 73—212 无 None 63.08 -0.655 35.48 8.83 细胞核/线粒体/细胞质 Nu / Mi / Cy TaNAC013_3A.3 266 73—212 无 None 67.18 -0.676 36.58 9.15 细胞核/线粒体 Nu / Mi 4 TaNAC017_5A.2 730 13—136 o695—717i 69.74 -0.511 49.35 4.55 细胞核 Nu TaNAC017_5A.3 566 无 None o531—553i 72.86 -0.403 51.11 4.18 细胞核/胞外 Nu / Ex TaNAC017_5A.6 435 13—136 o400—422i 76.00 -0.476 50.17 5.92 细胞核 Nu TaNAC017_5A.4 分段 S — — — — — — — — — — — — TaNAC017_5A.5 分段 S — — — — — — — — — — — — 5 TaNAC011_7D.1 488 57—226 无 None 53.79 -0.843 55.96 7.53 细胞核 Nu TaNAC011_7D.2 分段 S — — — — — — — — — — — — 6 TaNAC017_5D.2 719 13—136 o683—705i 69.61 -0.490 49.99 4.57 细胞核 Nu TaNAC017_5D.4* 683 13—136 o647—669i 70.26 -0.528 50.36 4.62 细胞核 Nu 7 TaNAC024_3D.1 439 45—186 无 None 59.13 -0.813 48.33 6.88 细胞核 Nu TaNAC024_3D.2 438 44—185 无 None 59.27 -0.806 48.24 6.76 细胞核 Nu TaNAC024_3D.3 分段 S — — — — — — — — — — — — 8 TaNAC039_6B.3 351 8—135 无 None 58.97 -0.755 38.99 6.57 细胞核 Nu TaNAC039_6B.5 分段 S — — — — — — — — — — — — 9 TaNAC073_3B.3 321 46—188 无 None 54.7 -0.902 37.18 8.6 细胞核 Nu TaNAC073_3B.6 278 46—188 无 None 59.64 -0.828 33.43 8.83 细胞核 Nu TaNAC073_3B.4 分段 S — — — — — — — — — — — — 10 TaNAC092_2A.3 355 14—138 无 None 64.14 -0.412 30.91 7.21 细胞核/叶绿体 Nu / Ch TaNAC092_2A.5 分段 S — — — — — — — — — — — — 11 TaNAC092_2D.6 353 14—138 无 None 65.33 -0.397 33.56 6.86 细胞核/叶绿体 Nu / Ch TaNAC092_2D.7 分段 S — — — — — — — — — — — — TaNAC092_2D.8 分段 S — — — — — — — — — — — — 12 TaNAC024_3A.1 439 45—186 无 None 58.45 -0.828 46.99 6.76 细胞核 Nu TaNAC024_3A.3 438 44—185 无 None 58.58 -0.821 46.9 6.67 细胞核 Nu TaNAC024_3A.6 分段 S — — — — — — — — — — — — TaNAC024_3A.7 分段 S — — — — — — — — — — — — 13 TaNAC092_2B.1 354 14—138 无 None 65.14 -0.386 31.18 6.67 叶绿体/细胞核 Ch / Nu TaNAC092_2B.3 235 14—136 无 None 57.87 -0.506 31.91 5.27 胞外/细胞核 Ex / Nu TaNAC092_2B.7 分段 S — — — — — — — — — — — —