小麦TaNAC基因基于可变剪切和microRNA的转录后调控分析

吕士凯,马小龙,张敏,邓平川,陈春环,张宏,刘新伦,吉万全

Post-transcriptional Regulation of TaNAC Genes by Alternative Splicing and MicroRNA in Common Wheat (Triticum aestivum L.)

LÜ ShiKai,MA XiaoLong,ZHANG Min,DENG PingChuan,CHEN ChunHuan,ZHANG Hong,LIU XinLun,JI WanQuan

表2 克隆得到的13个基因可变剪切形成的35条TaNAC结构变异转录本

Table 2 The 35 TaNAC structural variation transcripts cloned from 13 genes by alternative splicing

分组 Groups TaNAC转录本名称 Names of TaNAC transcripts 序列长度 Sequence length (bp) GenBank登录号 Accessions 对应中国春参考基因组的基因 The corresponding genes in IWGSC RefSeq v1.1 是否外显子跳跃 Exon skipping or not 是否内含子保留 Intron retention or not 转录本编码方式 Coding mode of transcripts 1 TaNAC_NTL5_7B.2 1932 MN747301 TraesCS7B02G196900 是 Yes 否 No 正常 N TaNAC_NTL5_7B.3 879 MN747304 TraesCS7B02G196900 正常 N 2 TaNAC008_3A.1 1446 MN747252 TraesCS3A02G176500 是 Yes 否 No 正常 N TaNAC008_3A.2 597 MN747253 TraesCS3A02G176500 正常 N 3 TaNAC013_3A.1 1017 MN747260 TraesCS3A02G245900 是 Yes 否 No 正常 N TaNAC013_3A.2 1017 MN747262 TraesCS3A02G245900 正常 N TaNAC013_3A.3 974 MN786410 TraesCS3A02G245900 提前终止 P 4 TaNAC017_5A.2 2193 MN747191 TraesCS5A02G271500 是 Yes 否 No 正常 N TaNAC017_5A.3 1701 MN747193 TraesCS5A02G271500 正常 N TaNAC017_5A.4 1181 MN786415 TraesCS5A02G271500 分段 S TaNAC017_5A.5 1237 MN786416 TraesCS5A02G271500 分段 S TaNAC017_5A.6 1308 MN747194 TraesCS5A02G271500 正常 N 5 TaNAC011_7D.1 1467 MN747256 TraesCS7D02G365200 否 No 是 Yes 正常 N TaNAC011_7D.2 865 MN786437 TraesCS7D02G365200 分段 S 6 TaNAC017_5D.2 2160 MN747189 TraesCS5D02G279100 否 No 是 Yes 正常 N TaNAC017_5D.4 2052 IWGSC TraesCS5D02G279100 正常 N 7 TaNAC024_3D.1 1320 MN747206 TraesCS3D02G109400 否 No 是 Yes 正常 N TaNAC024_3D.2 1317 MN747210 TraesCS3D02G109400 正常 N TaNAC024_3D.3 1457 MN786432 TraesCS3D02G109400 分段 S 8 TaNAC039_6B.3 1056 MN747281 TraesCS6B02G286200 否 No 是 Yes 正常 N TaNAC039_6B.5 1171 MN786440 TraesCS6B02G286200 分段 S 9 TaNAC073_3B.3 966 MN747291 TraesCS3B02G410500 否 No 是 Yes 正常 N TaNAC073_3B.4 1134 MN786442 TraesCS3B02G410500 分段 S TaNAC073_3B.6 979 MN786412 TraesCS3B02G410500 提前终止 P 10 TaNAC092_2A.3 1068 MN747237 TraesCS2A02G338300 否 No 是 Yes 正常 N TaNAC092_2A.5 1325 MN786430 TraesCS2A02G338300 分段 S 11 TaNAC092_2D.6 1062 MN747248 TraesCS2D02G324700 否 No 是 Yes 正常 N TaNAC092_2D.7 1403 MN786434 TraesCS2D02G324700 分段 S TaNAC092_2D.8 1405 MN786435 TraesCS2D02G324700 分段 S 12 TaNAC024_3A.1 1320 MN747211 TraesCS3A02G107400 是 Yes 是 Yes 正常 N TaNAC024_3A.3 1317 MN747208 TraesCS3A02G107400 正常 N TaNAC024_3A.6 1612 MN786431 TraesCS3A02G107400 分段 S TaNAC024_3A.7 1401 MN786419 TraesCS3A02G107400 分段 S 13 TaNAC092_2B.1 1065 MN747239 TraesCS2B02G343600 是 Yes 是 Yes 正常 N TaNAC092_2B.3 708 MN747234 TraesCS2B02G343600 正常 N TaNAC092_2B.7 1167 MN786429 TraesCS2B02G343600 分段 S