苹果锈果类病毒在7个品种苹果上的分子变异及系统发育关系
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李紫腾,曹钰晗,李楠,孟祥龙,胡同乐,王树桐,王亚南,曹克强
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Molecular Variation and Phylogenetic Relationship of Apple Scar Skin Viroid in Seven Cultivars of Apple
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LI ZiTeng,CAO YuHan,LI Nan,MENG XiangLong,HU TongLe,WANG ShuTong,WANG YaNan,CAO KeQiang
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表2 不同ASSVd分离物二级结构最小自由能
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Table 2 Minimum free energy of secondary structure of different ASSVd isolates in this study
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来源
Source | 编号
Number | 长度
Length (nt) | 登录号
Accession number | 碱基类型
Base type | 最小自由能
Minimum free energy (kJ·mol-1) | | 斗南Tonami | DN1 | 325 | MH105019 | 5 | -561.9 | | 斗南Tonami | DN1-2 | 331 | MH105020 | 5 | -583.2 | | 富士Fuji | FS1-1 | 329 | MG891838 | 1 | -563.1 | | 富士Fuji | FS4-1 | 330 | MH105022 | 4 | -565.6 | | 富士Fuji | FS4-9 | 329 | MH105023 | 3 | -567.7 | | 富士Fuji | FS4-13 | 329 | MH105024 | 3 | -567.7 | | 富士Fuji | FS3-4 | 326 | MH105025 | 2 | -558.1 | | 富士Fuji | FS3-10 | 329 | MH105026 | 2 | -575.7 | | 王林Wang Lin | WL1-5 | 332 | MH105027 | 6 | -568.1 | | 王林Wang Lin | WL1-6 | 331 | MH105028 | 5 | -583.2 | | 王林Wang Lin | WL2-2 | 333 | MH105029 | 6 | -577.8 | | 王林Wang Lin | WL3 | 328 | MH105030 | 1 | -558.1 | | 信侬红Xin Nonghong | Xnho1 | 332 | MH105031 | 6 | -576.1 | | 信侬红Xin Nonghong | Xnho1-3 | 332 | MH105032 | 1 | -579.5 | | 信侬黄Xin Nonghuang | Xnhu1-3 | 332 | MH105033 | 6 | -572.3 | | 中秋王Mid-Autumn King | ZQW7 | 331 | MH105034 | 4 | -563.5 | | 金冠Gold Delicious | GD3-23 | 329 | MH105035 | 2 | -575.7 |
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