春小麦籽粒主要品质性状的全基因组关联分析

严勇亮,时晓磊,张金波,耿洪伟,肖菁,路子峰,倪中福,丛花

Genome-Wide Association Study of Grain Quality Related Characteristics of Spring Wheat

YAN YongLiang,SHI XiaoLei,ZHANG JinBo,GENG HongWei,XIAO Jing,LU ZiFeng,NI ZhongFu,CONG Hua

表3 春小麦品质性状显著关联的稳定的位点信息

Table 3 Stable locus information with significant correlation of spring wheat quality traits

性状 Trait 位点 Marker 染色体 Chr. 物理位置 Position (Mb) P值 P value 表型贡献率 R2 (%) 环境 Environment 沉降值 SV (mL) AX-109923777 1B 335.51 1.25E-05—4.48E-05 6.96—7.83 E4, E5 AX-109389304 1B 445.67 6.44E-05—4.57E-04 5.49—6.79 E4, E5 AX-94935157 1D 470.73—478.86 2.57E-05—3.85E-04 5.42—7.54 E2, E5 AX-109486695 3A 725.15 1.15E-04—5.59E-04 5.11—6.23 E2, E5 AX-108986146 3B 547.59 2.89E-05—3.18E-04 5.56—7.22 E4, E5 AX-111583589 4A 121.51 5.34E-05—7.95E-04 4.95—6.94 E4, E5 AX-110417316 4A 130.42 1.05E-05—6.22E-05 6.78—7.98 E4, E5 AX-111264892 4A 241.73 1.40E-04—2.24E-04 5.79—6.17 E4, E5 AX-109608730 4A 413.76 2.96E-05—3.05E-04 5.67—7.25 E4, E5 AX-109285136 4A 594.90—598.79 9.75E-05—8.96E-04 3.82—6.39 E2, E3, E4 AX-109834040 4A 609.82 2.7E-04—6.83E-04 4.98—5.65 E4, E5 AX-110002719 4B 43.56 2.69E-04—9.30E-04 3.79—4.69 E2, E4 AX-94513518 4B 556.06 2.13E-07—5.41E-04 5.24—10.89 E2, E3 AX-110023236 5A 30.66 7.47E-04—9.28E-04 4.80—4.95 E2, E4 AX-109374128 5A 600.17 7.45E-05—4.00E-04 5.43—6.61 E4, E5 AX-110149809 5B 554.32 2.12E-04—3.56E-04 5.45—5.92 E3, E5 AX-109983932 5B 604.61 5.60E-04—5.87E-04 5.15—5.18 E2, E3 AX-109402563 5D 28.88 3.63E-05—1.86E-04 6.05—7.11 E4, E5 AX-110082918 5D 529.22 5.79E-05—3.09E-04 5.57—6.72 E4, E5 AX-109512342 6A 25.80—28.33 3.91E-05—4.89E-04 5.25—7.11 E2, E3, E4, E5 AX-94564307 6D 21.98 4.64E-05—7.11E-04 4.98—6.93 E2, E4 AX-111614875 6D 70.62 3.43E-05—1.81E-04 5.96—7.10 E4, E5 AX-109452823 7A 26.47—32.70 5.93E-05—9.46E-04 3.72—6.34 E1, E2, E4, E5 AX-109477546 7B 155.48—159.71 1.99E-05—7.71E-04 5.03—10.36 E2, E3, E4, E5 AX-94420739 7D 540.87 9.04E-04—9.43E-04 4.83—5.08 E2, E4 出粉率 FY (%) AX-109428041 1A 22.48 4.14E-04—7.46E-04 5.02—5.24 E3, E5 AX-94802245 1D 73.73—77.36 1.14E-04—1.00E-03 4.88—6.34 E3, E4 AX-111099555 2B 18.94—24.13 5.37E-05—3.64E-04 4.42—5.72 E3, E4 AX-111040045 4A 632.76-659.66 1.51E-04—9.74E-04 3.83—5.96 E3, E5 AX-110671478 6A 3.80—6.57 3.32E-06—9.73E-04 3.78—7.77 E3, E4 AX-111534875 6A 5.51—12.28 1.44E-05—3.98E-04 5.61—7.91 E1, E3, E4 AX-111745518 6A 17.54—24.41 1.51E-04—4.85E-04 6.14—6.15 E1, E4 AX-111611885 6D 2.49—5.82 1.57E-04—7.67E-04 5.00—6.14 E3, E4 AX-111076418 7A 8.91—12.44 1.70E-04—8.12E-04 3.75—5.14 E4, E5 蛋白质含量 PRC (%) AX-94935157 1D 470.73—478.18 8.52E-04—9.52E-04 3.85—4.77 E2, E4 AX-94694898 2B 620.64 2.57E-04—8.16E-04 4.87—5.71 E2, E4 AX-111218282 2D 523.36 3.71E-04—8.94E-04 4.82—5.47 E2, E4 AX-94589328 2D 624.10 6.02E-04—8.85E-04 5.10—5.12 E2, E4 AX-110442313 3A 510.31—510.60 2.91E-04—8.05E-04 4.88—5.62 E2, E4 AX-110002719 4B 43.56 1.20E-04—2.83E-04 4.59—5.13 E2, E4, E5 AX-111560874 5B 10.50 1.38E-04—5.85E-04 5.11—6.15 E2, E4 AX-109300733 6A 12.28—17.54 5.03E-05—8.33E-04 4.87—6.98 E2, E4 AX-95194586 6D 77.52 3.12E-04—9.12E-04 4.97—5.68 E2, E4 AX-111654743 7A 32.00—32.70 8.79E-05—8.48E-04 3.83—5.30 E1, E2, E3, E5 AX-108797850 7B 453.77 2.79E-04—7.67E-04 4.93—5.66 E2, E4 AX-108753131 7D 534.44—540.87 3.72E-04—6.37E-04 5.17—5.70 E2, E4 AX-108974357 7D 566.20—566.23 4.25E-04—8.84E-04 4.99—5.36 E2, E4 AX-110945986 7D 609.24—610.23 2.75E-04—8.28E-04 4.97—5.68 E2, E3 淀粉含量 STC (%) AX-95180100 1D 359.67 2.12E-05—2.57E-04 5.75—7.55 E4, E5 AX-94589328 2D 624.10—629.21 8.13E-05—8.67E-04 4.86—6.63 E1,E2 AX-109934763 3D 559.16—561.01 3.24E-05—9.76E-04 4.78—7.56 E1, E2 AX-110417316 4A 130.42—136.97 4.48E-04—8.12E-04 4.93—5.59 E1, E2 AX-109332913 4A 701.53 2.32E-04—7.15E-04 5.26—5.79 E1, E2 AX-110169414 5A 575.26 2.31E-04—5.72E-04 4.07—4.90 E1, E2 AX-110046517 6A 8.09—12.28 2.58E-05—8.16E-04 5.14—7.43 E1, E3 AX-111745518 6A 17.54 5.73E-04—8.12E-04 4.90—5.42 E1, E2 AX-108888443 6D 16.23—21.98 6.92E-04—9.04E-04 4.82—5.26 E1, E2 AX-110545157 7A 32.70 2.86E-04—7.03E-04 4.14—4.54 E1, E2 AX-108974357 7D 566.20—566.23 2.60E-04—7.07E-04 5.00—5.80 E1, E2 容重 TW (g·L-1) AX-109301633 2A 84.15 4.89E-04—9.53E-04 4.50—5.44 E1, E3 AX-110173580 2A 697.04—698.01 2.69E-04—4.71E-04 4.23—6.47 E1, E2 AX-86184511 2B 158.15—164.43 2.03E-04—9.14E-04 4.53—4.79 E1, E4 AX-110946610 4A 608.03—616.89 7.28E-04—7.84E-04 3.93—4.71 E1, E2 AX-109947431 5B 672.48—678.51 2.29E-04—6.26E-04 5.26—5.84 E3, E5 AX-110402876 7D 626.92 3.38E-04—4.10E-04 5.43—5.56 E2, E5 湿面筋含量 WCG (%) AX-110002719 4B 43.56 1.27E-04—3.97E-04 4.32—5.06 E2, E4, E5 AX-111560874 5B 10.50 2.83E-04—9.94E-04 4.71—5.61 E2, E4 AX-111745518 6A 17.54—25.80 3.01E-04—6.74E-04 4.97—5.75 E2, E4 AX-111654743 7A 32.00—32.70 7.64E-05—7.13E-04 4.72—5.35 E1, E2 AX-94420739 7D 540.87 6.47E-04—6.52E-04 5.04—-5.22 E2, E4 籽粒硬度 GH (%) AX-111107679 1A 476.08—483.94 1.32E-04—6.54E-04 4.92—5.01 E4, E5 AX-110918237 1A 487.48—489.18 5.71E-05—8.41E-04 4.76—6.59 E4, E5 AX-109499408 1A 496.31—500.66 1.77E-04—6.78E-04 3.94—5.91 E3, E5 AX-110369038 1B 627.15—628.51 3.72E-04—9.45E-04 3.81—4.74 E1, E2, E3 AX-94534666 1D 457.15—457.95 3.16E-06—5.85E-04 4.01—7.42 E2, E3, E5 AX-111636440 2A 505.33—507.36 1.45E-04—9.12E-04 3.92—5.34 E1, E3 AX-94447403 2D 439.44 5.38E-04—7.59E-04 4.84—5.39 E1, E3 AX-111640432 3A 728.42—731.08 1.70E-04—5.00E-04 4.12—4.76 E2, E3, E5 AX-110951756 3B 7.08 7.16E-06—8.58E-04 4.73—8.11 E2, E3 AX-111018209 3D 553.59—560.75 3.97E-04—8.39E-04 4.98—5.28 E1, E5 AX-111031457 5A 571.71—571.94 9.82E-05—1.82E-04 4.72—5.12 E3, E5 AX-108945948 6A 9.14—13.06 1.00E-04—9.09E-04 5.00—6.02 E1, E5 AX-108802871 7A 10.09—16.64 2.96E-04—8.09E-04 4.32—5.85 E1, E5 AX-111664463 7A 123.20—127.55 8.90E-05—6.93E-04 3.86—6.29 E4, E5 AX-110495496 7A 484.39—489.95 2.30E-04—9.39E-04 3.72—5.65 E3, E4, E5