中国东北和华北地区紫花苜蓿根瘤菌遗传多样性研究

李昕芫,娄金秀,刘清源,胡健,张英俊

Genetic Diversity Analysis of Rhizobia Associated with Medicago sativa Cultivated in Northeast and North China

LI XinYuan,LOU JinXiu,LIU QingYuan,HU Jian,ZHANG YingJun

表2 紫花苜蓿根瘤菌BOX型种类及其分布

Table 2 The BOX types and their distributions in the rhizobia associated with Medicago sativa

BOX型 BOX type 菌株数 No. of strains 占比 Percentage (%) 比对序列号 Accession No. 菌种 Species 采样地b Sampling site 区域 Region 1 38 7.62 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城、凤城、黑龙江（5）b、建平（6）、辽阳（21）、前郭、沈阳、五河（2） Baicheng, Fengcheng, Heilongjiang (5), Jianping (6), Liaoyang (21), Qianguo, Shenyang, Wuhe (2) NE、N 2 2 0.40 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城、五河 Baicheng, Wuhe NE、N 3 1 0.20 EF549450 (91.34) a 中慢生根瘤菌属 Mesorhizobium sp. 白城 Baicheng NE 4 1 0.20 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 辽阳 Liaoyang NE 5 6 1.20 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城、前郭、特尼河、通榆（2）、五河 Baicheng, Qianguo, Turney river, Tongyu (2), Wuhe NE、N 6 1 0.20 KF206625 (100) 黄土根瘤菌 Rhizobium loessense 白城 Baicheng NE 7 93 18.64 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城（2）、沧州、衡水（28）、新乡（23）、荥阳、郑州（13）、辽阳（10）、前郭（2）、聊城（3）、沈阳（7）、五河（3） Baicheng (2), Cangzhou, Hengshui (28), Xinxiang (23), Xingyang, Zhengzhou (13), Liaoyang (10), Qianguo (2), Liaocheng (3), Shenyang (7), Wuhe (3) NE、N 8 2 0.40 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城、沈阳 Baicheng, Shenyang NE 9 3 0.60 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城、郑州、齐齐哈尔 Baicheng, Zhengzhou, Qiqihar NE、N 10 1 0.20 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城 Baicheng NE 11 1 0.20 KF206625 (100) 黄土根瘤菌 Rhizobium loessense 白城 Baicheng NE 12 4 0.80 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城、聊城（3） Baicheng, Liaocheng (3) NE、N 13 15 3.00 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城（5）、建平、通榆（4）、谢尔塔拉（4）、延边 Baicheng (5), Jianping, Tongyu (4), Cher tara (4), Yanbian NE 14 8 1.60 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城、前郭、通榆（3）、五河（2）、延边 Baicheng, Qianguo, Tongyu (3), Wuhe (2), Yanbian NE、N 15 1 0.20 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城 Baicheng NE 16 2 0.40 KP251033 (100) 华癸根瘤菌 Mesorhizobium huakuii 通榆 Tongyu NE 17 1 0.20 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 前郭 Qianguo NE 18 15 3.00 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 齐齐哈尔（3）、沈阳、特尼河（3）、五河（6）、谢尔塔拉（2） Qiqihar (3), Shenyang, Turney river (3), Wuhe (6), Cher tara (2) NE、N 19 36 7.20 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 沧州、衡水（5）、新乡（2）、荥阳（2）、郑州（5）、前郭、胶州（12）、通榆（2）、五河（4）、延边（2） Cangzhou, Hengshui (5), Xinxiang (2), Xingyang (2), Zhengzhou (5), Qianguo, Jiaozhou (12), Tongyu (2), Wuhe (4), Yanbian (2) NE、N 20 13 2.60 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 齐齐哈尔、沈阳（8）、通榆 、五河（3） Qiqihar, Shenyang (8), Tongyu, Wuhe (3) NE、N 21 1 0.20 AM418747 (99.67) 附着剑菌 Sinorhizobium adhaerens 沈阳 Shenyang NE OX型 BOX type 菌株数 No. of strains 占比 Percentage (%) 比对序列号 Accession No. 菌种 Species 采样地b Sampling site 区域 Region 22 58 11.62 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城（35）、凤城（2）、齐齐哈尔、建平（4）、前郭、沈阳（8）、五河（5）、谢尔塔拉（2） Baicheng (35), Fengcheng (2), Qiqihar, Jianping (4), Qianguo, Shenyang (8), Wuhe (5), Cher tara (2) NE、N 23 141 28.26 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 凤城（3）、沧州（25）、衡水（14）、新乡（20）、荥阳（14）、郑州（12）、辽阳（2）、胶州（12）、聊城（20）、沈阳、通榆（2）、五河（15）、谢尔塔拉 Fengcheng (3), Cangzhou (25), Hengshui (14), Xinxiang (20), Xingyang (14), Zhengzhou (12), Liaoyang (2), Jiaozhou (12), Liaocheng (20), Shenyang, Tongyu (2), Wuhe (15), Cher tara NE、N 24 8 1.60 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 五河 Wuhe N 25 3 0.60 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 荥阳（2）、前郭 Xingyang (2), Qianguo NE、N 26 1 0.20 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 五河 Wuhe N 27 4 0.80 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 特尼河（3）、五河 Turney river (3), Wuhe NE、N 28 6 1.20 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 荥阳、建平、五河（4） Xingyang, Jianping, Wuhe (4) NE、N 29 3 0.60 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 白城（2）、谢尔塔拉 Baicheng (2), Cher tara NE 30 1 0.20 EU120727 (98.01) 华中根瘤菌 Rhizobium mesosinicum 沈阳 Shenyang NE 31 2 0.40 AM418747 (99.67) 附着剑菌 Sinorhizobium adhaerens 沈阳 Shenyang NE 32 1 0.20 KF580979 (92.72) 芸苔叶杆菌 Phyllobacterium brassicacearum 沈阳 Shenyang NE 33 19 3.81 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 沧州（4）、新乡（11）、郑州、聊城（2） Cangzhou (4), Xinxiang (11), Zhengzhou, Liaocheng (2) N 34 2 0.40 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 新乡 Xinxiang N 35 1 0.20 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 沧州 Cangzhou N 36 1 0.20 KF206603 (99.33) 绿豆根瘤菌 Rhizobium vignae 白城 Baicheng NE 37 2 0.40 - 草木樨中华根瘤菌 Sinorhizobium meliloti 五河 Wuhe N