小麦籽粒超氧化物歧化酶（SOD）活性全基因组关联分析

王继庆,任毅,时晓磊,王丽丽,张新忠,苏力坛·姑扎丽阿依,谢磊,耿洪伟

Genome-Wide Association Analysis of Superoxide Dismutase (SOD) Activity in Wheat Grain

WANG JiQing,REN Yi,SHI XiaoLei,WANG LiLi,ZHANG XinZhong,SULITAN· GuZhaLiAYi,XIE Lei,GENG HongWei

表4 SNP-GWAS检测到的SOD活性显著相关的位点

Table 4 SOD activity related loci detected by SNP-GWAS

标记 Marker 染色体 Chromosome 物理位置 Position (bp) 环境 Environment P值 P value 贡献率 R2 (%) Ex_c12584_2014 1A 435061794 A 5.77E-04 5.94 BS00109991_51 1A 536439240—536614333 A 7.90E-04—8.82E-04 7.02—7.07 Ra_c5683_2584 1A 551460924 A 9.44E-04 5.38 Kukri_c8533_1398 1B 49886407 E2 9.60E-04 8.43 Ra_c11303_359 1B 379383435 E2 9.78E-04 8.46 BS00022411_51 1B 629159210 E1/E3/A 2.88E-05—2.97E-04 8.93—11.10 Tdurum_contig92425_1574 2A 779977420 E2/A 6.80E-06—2.13E-04 8.52—16.45 BS00038217_51 2B 99961034 E1 6.35E-04 8.66 RFL_Contig1987_3440 2B 555840884 E1/E3/A 7.00E-05—3.92E-04 8.83—11.28 BS00026037_51 2B 793151228 E1/E3/A 1.24E-04—5.25E-04 14.23—16.62 BS00049876_51 2D 12891888 A 7.40E-04 7.36 Kukri_c40882_76 3B 19250811—19390877 E1 4.50E-04—6.44E-04 6.04—6.38 CAP8_c9373_277 3D 21005688 E1/A 3.13E-04—5.86E-04 5.81—6.81 Tdurum_contig12116_297 4B 60543887 E1/E3/A 4.52E-05—3.71E-04 8.40—10.97 Excalibur_c29496_799 4D 475027917 E1 3.96E-04 7.68 BS00022191_51 5A 476402782 E1/E3/A 6.11E-05—3.21E-04 8.57—10.77 BS00024602_51 5A 499660243 E3/A 2.64E-04—4.51E-04 26.29—32.43 Kukri_c14889_1086 5A 540052370—540611794 E1 3.04E-04—9.20E-04 6.22—9.17 tplb0061l23_1365 5B 506768500 A 6.90E-04 7.18 BobWhite_rep_c62475_70 5B 531199416 E1/E3/A 6.96E-05—5.30E-04 7.93—11.03 RAC875_c33791_320 5B 679804074 E1/E3/A 8.46E-06—7.05E-04 6.91—10.13 RAC875_c49940_385 5D 399290149 E1/A 3.21E-04—9.48E-04 5.37—6.69 RAC875_c13610_1239 6A 1497847—2402603 E2/A 8.61E-06—6.32E-04 6.29—17.00 BS00037162_51 6A 617689729 A 8.99E-04 7.93 BS00082893_51 6B 166226—169518 E2 2.24E-04—5.29E-04 13.18—13.22 Kukri_c49331_77 6B 664266146—667884621 E1/E3/A 4.25E-05—7.81E-04 6.21—11.61 Kukri_c338_109 6B 708660893 E3 7.10E-04 9.40% Excalibur_c57840_227 6D 456465650 E1/E3/A 7.43E-05—4.78E-04 8.21—10.83 Kukri_c16814_103 7B 700830992 E1 9.32E-04 5.69