柑橘CCD基因家族鉴定及CcCCD4a对果肉颜色的影响

张亚飞,彭洁,朱延松,杨胜男,王旭,赵婉彤,江东

Genome Wide Identification of CCD Gene Family in Citrus and Effect of CcCCD4a on the Color of Citrus Flesh

YaFei ZHANG,Jie PENG,YanSong ZHU,ShengNan YANG,Xu WANG,WanTong ZHAO,Dong JIANG

表3 柑橘基因组中的CCD基因

Table 3 The CCD genes identified in citrus

基因名称 Gene name 基因组登录号 Gene accession No. 蛋白质大小 Protein length (aa) RPE65位置 RPE65 domain location 分子量 Molecular mass (KD) 等电点 Isoelectric point (pI) 亚细胞定位 Subcellular localization CcCCD1a CICLEv10031014m 597 106—587 67.2 6.33 细胞质 Cytoplasm CcCCD1b CICLEv10031039m 589 100—579 66.67 6.05 细胞质 Cytoplasm CcCCD4a CICLEv10031003m 603 124—595 66.45 6.87 叶绿体 Chloroplast CcCCD4b1 CICLEv10028113m 563 87—553 63.06 8.34 叶绿体 Chloroplast CcCCD4b2 CICLE_v10030384m 508 38—504 56.91 6.56 细胞质 Cytoplasm CcCCD4c CICLEv10011335m 597 115—590 66.35 8.53 叶绿体 Chloroplast CcCCD4d CICLEv10013726m 412 93—403 45.86 7.25 叶绿体 Chloroplast CcCCD7 CICLEv10027500m 590 43—580 66.51 6.07 叶绿体 Chloroplast CcCCD8a CICLEv10008050m 510 29—508 56.8 5.93 细胞质 Cytoplasm CcCCD8b CICLEv10010609m 556 76—554 61.965 5.98 叶绿体 Chloroplast CcCCD_like CICLEv10010551m 611 89—598 69.18 6.53 细胞质 Cytoplasm CcNCED3 CICLEv10019364m 606 134—598 67.01 6.37 叶绿体 Chloroplast CcNCED5 CICLEv10014639m 609 136—601 67.79 6.3 叶绿体 Chloroplast CcNCED6 CICLEv10006710m 592 113—583 65.29 7.32 细胞质 Cytoplasm