淅川乌骨鸡全基因组转座子的鉴定与分析

李东华,付亚伟,张晨曦,曹艳芳,李文婷,李转见,康相涛,孙桂荣

Genome-Wide Identification and Characterization of Transposable Elements in Xichuan Black-Bone Chicken

DongHua LI,YaWei FU,ChenXi ZHANG,YanFang CAO,WenTing LI,ZhuanJian LI,XiangTao KANG,GuiRong SUN

表1 基因组转座子统计分析

Table 1 Statistical analysis of genome TEs

分类 Class 类别 Order 超家族 Superfamily 数量 Counts 逆转录转座子 Retrotransposons LTR Copia 2 182 Gypsy 424 ERV1 12 026 ERVK 7 502 ERVL 57 233 ERV 5 265 LINE CR1 243 531 I 489 L2 591 RTE-X 259 SINE SINE/MIR 208 DNA转座子 DNA transposons DNA CMC-EnSpm 1 808 hAT-Ac 486 hAT-Charlie 9 076 MULE-MuDR 462 P 2 853 PIF-Harbinger 4 148 TcMar-Mariner 18 304 RC/Helitron RC/Helitron 3 405