用高通量测序技术研究松辽黑猪与长白猪背最长肌 mRNA和lncRNA的差异表达

吴垚群,陈少康,盛熙晖,齐晓龙,王相国,倪和民,郭勇,王楚端,邢凯

Differential Expression of mRNA and lncRNA in Longissimus Dorsi Muscle of Songliao Black Pig and Landrace Pig Based on High-Throughput Sequencing Technique

YaoQun WU,ShaoKang CHEN,XiHui SHENG,XiaoLong QI,XiangGuo WANG,HeMin NI,Yong GUO,ChuDuan WANG,Kai XING

表3 差异表达基因最显著富集的GO条目

Table 3 GO entries with the most significant enrichment of differentially expressed genes

类型 Type GO条目 GO entries 基因数目 Number of genes 校正后P值 Corrected P value 细胞组成 Cell composition 膜组分 Membrane part 299 1×10-6 膜内组分 Intrinsic component of membrane 249 1×10-6 细胞器 Organelle 1825 1×10-6 细胞内部分 Intracellular part 1890 1×10-6 胞内 Intracellular 2003 1×10-6 被膜小泡 Membrane-bounded vesicle 212 1×10-6 包膜细胞器 Membrane-bounded organelle 1491 1×10-6 细胞器膜 Organelle membrane 135 1×10-6 胞内细胞器 Intracellular organelle 1624 1×10-6 质膜组分 Plasma membrane part 68 1×10-6 分子功能 Molecular function 阳离子结合 Cation binding 316 1×10-6 结合 Binding 1791 1×10-6 蛋白质结合 Protein binding 705 1×10-6 金属离子结合 Metal ion binding 171 1×10-6 转换金属离子结合 Transition metal ion binding 128 1×10-6 小分子结合（small molecule binding） 181 1×10-6 碳水化合物衍生物结合（carbohydrate derivative binding） 164 1×10-6 分子传感活性（molecular transducer activity） 75 1×10-6 嘌呤核苷酸结合 Purine nucleoside binding 144 1×10-6 核糖核苷结合 Ribonucleotide binding 144 1×10-6 生物过程 Biological process 调控代谢过程 Regulation of metabolic process 461 1×10-6 调控大分子代谢过程 Regulation of macromolecule metabolic process 376 1×10-6 生物过程的正调控 Positive regulation of biological process 246 1×10-6 调控细胞代谢过程 Regulation of cellular metabolic process 312 1×10-6 调控初级代谢过程 Regulation of primary metabolic process 295 1×10-6 细胞过程的正调控 Positive regulation of cellular process 206 1×10-6 基因表达调控 Regulation of gene expression 275 1×10-6 分子功能调控 Regulation of molecular function 183 1×10-6 调控刺激反应 Regulation of response to stimulus 196 1×10-6 调控蛋白质代谢过程 Regulation of protein metabolic process 158 1×10-6