番茄褪绿病毒的进化动态与适应性进化特征

邹林峰,涂丽琴,沈建国,杜振国,蔡伟,季英华,高芳銮

The Evolutionary Dynamics and Adaptive Evolution of Tomato Chlorosis Virus

ZOU LinFeng,TU LiQin,SHEN JianGuo,DU ZhenGuo,CAI Wei,JI YingHua,GAO FangLuan

表1 本研究用到的ToCV分离物信息

Table 1 ToCV isolates information used in this study

分离物 Isolate 国家 Country 采样日期 Sampling date 序列登录号 Accession number 分离物 Isolate 国家 Country 采样日期 Sampling date 序列登录号 Accession number BR: Taquara:15 巴西Brazil 2015 KY569401 Gr-535 希腊Greece 2008 EU284744 ToC-Br2 巴西Brazil 2006 JQ952601 To-Il1970 希腊Greece 2011 HG380085 BJ 中国China 2012-10-26 KC311375 To-Il1857 希腊Greece 2011 HG380088 SDSG 中国China 2012-10 KC709510 To-Il2002 希腊Greece 2011 HG380089 Nanjing 中国China 2014-05-12 KJ815045 To-Il2010 希腊Greece 2011 HG380090 14HD-12 中国China 2014-09-25 KP335046 To-Rh1933 希腊Greece 2011 HG380084 15HD-8 中国China 2014-09-25 KR184675 To-Rh1835 希腊Greece 2011 HG380087 15-PG-9 中国China 2015-03-25 KT751008 To-Se2042 希腊Greece 2011 HG380086 NGXJZ 中国China 2014-08-03 KX272755 1 毛里求斯Mauritius 2007-02 FM206381 HBCZ 中国China 2014-08-03 KP217195 2 毛里求斯Mauritius 2007-02 FM206382 HBHS 中国China 2014-08-03 KP217196 BK2-2 韩国South Korea 2017-06-27 MG001345 HBLF 中国China 2014-08-03 KP217199 BS-4 韩国South Korea 2017-06-27 MG001346 HBSJZ 中国China 2014-08-03 KP217200 N-2 韩国South Korea 2017-06-17 MG001347 HNAYHX 中国China 2014-08-04 KP264983 JN2 韩国South Korea 2013 MG813910 HNZZZM1 中国China 2014-08-04 KP264984 NS 韩国South Korea 2013 MG813911 HNZZZM2 中国China 2014-08-04 KP264985 IS17 韩国South Korea 2013 KP114525 JLCC 中国China 2015-08-15 KU306111 YG 韩国South Korea 2013 KP114528 LNDL 中国China 2015-08-15 KU204707 IS29 韩国South Korea 2013 KP114529 LNLZ 中国China 2016-10-18 MF278016 JJ3 韩国South Korea 2013 KP114533 NMHHHT 中国China 2015-07-15 KU204709 JJ5 韩国South Korea 2013 KP114534 ToCV-YL1 中国China 2016-11-20 MF346383 JN1 韩国South Korea 2013 KP114536 SDTAFC-Bemisia tabaci 中国China 2012-10-20 KC812621 HP 韩国South Korea 2013 KP114537 Shandong 12-1 中国China 2015-11-01 KY679886 HS 韩国South Korea 2013 KP137099 Shandong 28-2 中国China 2015-11-01 KY679887 JJ 韩国South Korea 2013 KP137101 Shandong 18-3 中国China 2015-11-01 KY679888 2.5 西班牙Spain 2010 KJ200305 SDTADP 中国China 2012-10-20 KC812619 MM8 西班牙Spain 2005 KJ200307 SDTAFC 中国China 2012-10-20 KC812620 Pl-1-2 西班牙Spain 1997 KJ200309 SDLC 中国China 2012-10-20 KC812622 AT80/99-IC 西班牙Spain 2014 KJ740257 JD 中国China 2016-03-30 KX900412 AT80/99 西班牙Spain 2006 DQ136146 JD-H 中国China 2014-03-30 KX987242 XS 中国China 2011-11-19 KY618797 FQ-J 中国China 2014-03-30 KY471019 TN11 中国China 1998 MF795557 SDTAMZ 中国China 2012-10-20 KC812623 Merkez 土耳其Turkey 2015-02-03 KY419527 PD-KJ1 中国China 2015-12-15 KY206012 Kas 土耳其Turkey 2015-02-03 KY419528 PD-KJ2 中国China 2015-12-15 KY206014 AKSU8 土耳其Turkey 2012 MF576337 SDQD 中国China 2015-08-16 KT809400 ALANYA42 土耳其Turkey 2012 MF576338 SDZB 中国China 2014-08-22 KR072213 ANTALYA6 土耳其Turkey 2012 MF576339 SXJZ 中国China 2016-08-20 KX853540 ANTALYA22 土耳其Turkey 2012 MF576340 ToCV-TJ6 中国China 2014-08-07 KP219722 FETHIYE72 土耳其Turkey 2012 MF576341 ToCV-YN 中国China 2016-10-20 KY471138 FINIKE1 土耳其Turkey 2012 MF576342 BB6* 中国China 2019-03-21 MN939023 GAZIPASA4 土耳其Turkey 2012 MF576343 EB1* 中国China 2017-04-06 MN939024 KEMER20 土耳其Turkey 2012 MF576344 EB2* 中国China 2019-03-14 MN939025 KUMLUCA32 土耳其Turkey 2012 MF576345 EB6* 中国China 2019-03-14 MN939026 KUMLUCA39 土耳其Turkey 2012 MF576346 XMF3* 中国China 2017-04-12 MN939027 MANAVGAT6 土耳其Turkey 2012 MF576347 XMF4* 中国China 2017-03-30 MN939028 SERIK48 土耳其Turkey 2012 MF576348 XMF5* 中国China 2017-03-30 MN939029 TRAntToCV 土耳其Turkey 2018-03 MK248741 XMF7* 中国China 2017-04-17 MN939030 Florida 美国United States 2005 AY903448 XMF8* 中国China 2017-04-17 MN939031 Amelia 美国United States 2010-11-03 HQ879840 XS3* 中国China 2019-03-14 MN939032 FL47 美国United States 2010-11-03 HQ879841 XS5* 中国China 2019-03-14 MN939033 Tygress 美国United States 2010-11-03 HQ879842 YRDR03* 中国China 2017-04-27 MN939034 Shanty 美国United States 2010-11-03 HQ879843 YRDR12* 中国China 2017-04-27 MN939035