奶牛育种中的长寿性状

张海亮,刘澳星,米思远,李想,罗汉鹏,鄢新义,王雅春

A Review on Longevity Trait in Dairy Cattle Breeding

ZHANG HaiLiang,LIU AoXing,MI SiYuan,LI Xiang,LUO HanPeng,YAN XinYi,WANG YaChun

表1 长寿性状全基因组关联分析研究

Table 1 Genome-wide association analysis on longevity traits

作者 Author 品种 Breed 性状定义 Trait definition 关联分析表型 Phenotype 分析方法 Analysis method 显著SNP所在染色体 Chromosome of significant SNP 候选基因 Candidate gene STERI [61] 荷斯坦牛 Holstein 生产寿命 Productive life 表型离差 Trait deviations 简单回归 Simple regression 16、30 UBIAD1、MTOR、ANGPTL7、EXOSC10、SRM、MASP2、TARDBP、CASZ1、GPC3、PHF6 在群寿命 Herd life — 产犊次数 The number of calving 16、30 NAYERI [60] 荷斯坦牛 Holstein 在群寿命 Herd life 逆回归育种值 Deregressed proof 单标记回归 Single SNP regression 5、6、7、14、18、 20、21 CTU1、NPFFR2 间接长寿性 Indirect longevity 5、6、18 NPFFR2 存活率 Survival 6、7、14、18、20、 21 — HAY [62] 合成品种 Composite breed 生产寿命 Productive life 校正表型 Corrected phenotypes 单标记回归 Single SNP regression 1、2、3、8、9、 11、19、25 GBE1、GTDC1、ZEB2、CTNNA2、REG3A、REG3G、BTBD17、CD300A、CD300LB、CDR2L、FADS6、FDXR、GPRC5C、GRIN2C、HID1 贝叶斯 Bayesian 1、2、3、9、11、15、19、20、25、29 SAOWAPHAK[63] 杂交荷斯坦牛 Cross Holstein 生产寿命 Productive life 性状表型值 Phenotype 一步法 Single step GWAS 5、X SYT1、DOCK11、KLHL13、IL13RA1 ZHANG[64] 荷斯坦牛 Holstein 多胎次生产寿命 Partial productive life 逆回归育种值 Deregressed proof 线性混合模型 Linear mixed model 5、6、9、10、18、 23 NPFFR2、vitamin D-buinding protein、PPP1R14C、GCH1、ZNF613 ZNF617 北欧红牛 Nordic Red dairy cattle 6、21、23、25 CCDC149、LGI2、KCNK16 娟姗牛 Jersey — — MéSZáROS [65] 西门塔尔牛 Simmental 生产寿命 Productive life 逆回归育种值 Deregressed proof 单标记回归 Single SNP regression 6、13、14、19、21 DERL1、SNTG1、LOC614437、ALB、AFP、LOC100140503、ADAMTS3、E2F1、RALY、SYT10、NTRK2 COLE[59] 荷斯坦牛 Holstein 生产寿命 Productive life 估计传递力 Predicted transmitting ability 单标记回归 Single SNP regression 7、X INSR、LOC520057