人溶菌酶密码子优化及其在牛乳腺细胞中高效表达

田媛,王力,龙凤,昝林森,成功

Codon Optimization of Human Lysozyme and High-Efficiency Expression in Bovine Mammary Cells

TIAN Yuan,WANG Li,LONG Feng,ZAN LinSen,CHENG Gong

表4 牛乳蛋白基因密码子使用偏好性分析

Table 4 Codon preference analysis of bovine milk protein genes

密码子 Codon 氨基酸 Amino acid 频率/1000 Frequency/1000 个数 Number 同义密码子 相对使用度RSCU 密码子 Codon 氨基酸 Amino acid 频率/1000 Frequency/1000 个数 Number 同义密码子 相对使用度RSCU GCA A 13.793 26 0.73 AAT N 19.629 37 0.96 GCC A 32.891 62 1.73 CCA P 17.507 33 1.06 GCG A 8.488 16 0.45 CCC P 19.629 37 1.19 GCT A 20.69 39 1.09 CCG P 4.244 8 0.26 TGC C 14.854 28 0.98 CCT P 24.403 46 1.48 TGT C 15.385 29 1.02 CAA Q 16.976 32 0.57 GAC D 22.281 42 1.09 CAG Q 42.44 80 1.43 GAT D 18.568 35 0.91 AGA R 5.836 11 1.06 GAA E 33.952 64 0.90 AGG R 12.732 24 2.32 GAG E 41.91 79 1.10 CGA R 2.122 4 0.39 TTC F 21.22 40 1.13 CGC R 3.183 6 0.58 TTT F 16.446 31 0.87 CGG R 6.897 13 1.26 GGA G 11.671 22 1.07 CGT R 2.122 4 0.39 GGC G 15.385 29 1.41 AGC S 14.324 27 1.30 GGG G 9.019 17 0.83 AGT S 13.263 25 1.20 GGT G 7.427 14 0.68 TCA S 7.427 14 0.67 CAC H 11.141 21 1.35 TCC S 14.854 28 1.34 CAT H 5.305 10 0.65 TCG S 2.122 4 0.19 ATA I 2.653 5 0.18 TCT S 14.324 27 1.30 ATC I 24.403 46 1.64 ACA T 11.141 21 0.84 ATT I 17.507 33 1.18 ACC T 18.037 34 1.36 AAA K 33.952 64 0.88 ACG T 6.366 12 0.48 AAG K 42.971 81 1.12 ACT T 17.507 33 1.32 CTA L 4.244 8 0.25 GTA V 6.897 13 0.41 CTC L 19.629 37 1.14 GTC V 15.915 30 0.95 CTG L 46.684 88 2.71 GTG V 28.117 53 1.68 CTT L 18.037 34 1.05 GTT V 15.915 30 0.95 TTA L 2.122 4 0.12 TAC Y 15.385 29 0.91 TTG L 12.732 24 0.74 TAT Y 18.568 35 1.09 AAC N 21.22 40 1.04