甘薯羽状斑驳病毒O株系和RC株系中国分离物全基因组 序列分析及其遗传特征

秦艳红,王永江,王爽,乔奇,田雨婷,张德胜,张振臣

Complete Nucleotide Sequence Analysis and Genetic Characterization of the Sweet potato feathery mottle virus O and RC Strains Isolated from China

QIN YanHong,WANG YongJiang,WANG Shuang,QIAO Qi,TIAN YuTing,ZHANG DeSheng,ZHANG ZhenChen

表1 本研究所用分离物的名称、株系、来源和登录号信息

Table 1 Name, strain, origin and accession number of all isolates used in this study

序号Number 分离物名称Isolate name 株系Strain 地理来源Geographic origin 登录号Accession number 1 RC-Ch1 RC 中国China KY296451 2 O-Ch1 O 中国China KY296450 3 CW137 RC 韩国South Korea KP115608 4 IS90 RC 韩国South Korea KP115610 5 GJ122 O 韩国South Korea KP115609 6 S RC 日本Japan D86371 7 10-O O 日本Japan AB439206 8 Ordinary O 日本Japan AB465608 9 17-O O 日本Japan AB509454 10 11-8 RC 美国USA MH782223 11 95-204R RC 美国USA MH782224 12 11-1 RC 美国USA MH778648 13 TFSW-1J RC 美国USA MH782227 14 95-2T O 美国USA MH782225 15 Aus7D RC 澳大利亚Australia MF572046 16 Aus12D RC 澳大利亚Australia MF572049 17 Aus8-8CA RC 澳大利亚Australia MG656422 18 Aus11D RC 澳大利亚Australia MF572048 19 Aus15-21CA RC 澳大利亚Australia MG656429 20 Aus11-13CA RC 澳大利亚Australia MG656425 21 Aus6-3B RC 澳大利亚Australia MG656420 22 Aus9-9B-2 RC 澳大利亚Australia MG656423 23 Aus10-10D RC 澳大利亚Australia MG656424 24 Aus13-18B-1 RC 澳大利亚Australia MG656427 25 Aus4D RC 澳大利亚Australia MF572047 26 Aus3D RC 澳大利亚Australia MF572052 27 Aus7-7B RC 澳大利亚Australia MG656421 28 Aus2D RC 澳大利亚Australia MF572051 29 Aus4-3A RC 澳大利亚Australia MG656418 30 Aus9D RC 澳大利亚Australia MF572054 31 Aus14-20CA RC 澳大利亚Australia MG656428 32 Aus12-16B RC 澳大利亚Australia MG656426 33 Aus16-24A RC 澳大利亚Australia MG656430 34 Aus3-2BC RC 澳大利亚Australia MG656417 35 Aus17-11D O 澳大利亚Australia MG656431 36 Aus5-3B O 澳大利亚Australia MG656419 37 Aus13B O 澳大利亚Australia MF572050 38 Aus1-2B O 澳大利亚Australia MG656415 39 Aus2-2BC O 澳大利亚Australia MG656416 40 UNB-01 RC 巴西Brazil MF185715 41 TM33C O 东帝汶East Timor MF572055 42 TM64B O 东帝汶East Timor MF572053 43 TM66B O 东帝汶East Timor MF572056 44 Ruk73 O 乌干达Uganda KP729265 45 RC-Arg RC 阿根廷Argentina KF386014 46 O-Arg O 阿根廷Argentina KF386013 47 SRF109a O 肯尼亚Kenya MH264535 48 ZA-O O 南非South Africa KT069222 49 Piu3 EA 秘鲁Peru FJ155666 50 AM-MB2 西班牙Spain KU511268