约束标准化线性回归法估计合成品种动物基因组品种构成

何俊,李智,吴晓林

Using Restricted Standardized Linear Regression Model to Estimate Genomic Breed Composition in Composite Breed Animals

Jun HE,Zhi LI,XiaoLin WU

表3 两种回归分析方法和7个SNP集分别估计的肉牛王牛祖先品种的GBC

Table 3 Estimated GBC for Beefmaster cattle two linear regression methods and seven SNP panels, respectively

方法 Method SNP子集 SNP panel 婆罗门牛 Brahman 海福特牛 Hereford 短角牛 Shorthorn 平均数 Mean 标准差 SD 中位数 Median 变异系数CV(%) 平均数 Mean 标准差 SD 中位数 Median 变异系数CV(%) 平均数 Mean 标准差 SD 中位数 Median 变异系数CV(%) LR 1000 0.462 0.060 0.465 12.99 0.326 0.054 0.327 16.56 0.212 0.073 0.206 34.43 5000 0.462 0.050 0.465 10.82 0.322 0.037 0.323 11.49 0.216 0.055 0.210 25.46 10000 0.463 0.049 0.466 10.58 0.322 0.034 0.322 10.56 0.215 0.053 0.206 24.65 20000 0.459 0.048 0.463 10.46 0.328 0.032 0.328 9.76 0.213 0.051 0.206 23.94 30000 0.457 0.048 0.461 10.50 0.330 0.032 0.331 9.70 0.213 0.052 0.204 24.41 40000 0.459 0.048 0.463 10.46 0.333 0.032 0.333 9.61 0.208 0.051 0.200 24.52 47900 0.459 0.048 0.464 10.46 0.333 0.032 0.333 9.61 0.208 0.052 0.199 25.00 RSLR 1000 0.497 0.029 0.498 5.84 0.274 0.036 0.275 13.14 0.229 0.038 0.227 16.59 5000 0.501 0.023 0.501 4.59 0.267 0.025 0.267 9.36 0.231 0.027 0.229 11.69 10000 0.503 0.022 0.504 4.37 0.262 0.023 0.261 8.78 0.235 0.025 0.233 10.64 20000 0.502 0.021 0.502 4.18 0.264 0.022 0.265 8.33 0.234 0.025 0.231 10.68 30000 0.500 0.021 0.501 4.20 0.266 0.022 0.267 8.27 0.234 0.024 0.231 10.26 40000 0.501 0.021 0.501 4.19 0.266 0.022 0.267 8.27 0.233 0.024 0.230 10.30 47900 0.501 0.021 0.501 4.19 0.266 0.021 0.266 7.89 0.234 0.024 0.231 10.26