黄瓜ERF基因家族鉴定及其在雌花芽分化中的表达分析

潘健,温海帆,何欢乐,连红莉,王刚,潘俊松,蔡润

Genome-Wide Identification of Cucumber ERF Gene Family and Expression Analysis in Female Bud Differentiation

Jian PAN,HaiFan WEN,HuanLe HE,HongLi LIAN,Gang WANG,JunSong PAN,Run CAI

表1 CsERF基因家族相关信息

Table 1 Information of CsERF gene family members

名称 Name 黄瓜基因组基因编号 ID in cucumber (9930_V2) 注释到拟南芥成员 Annotated to Arabidopsis 成员名称 Name in Arabidopsis 所属亚族 Class 氨基酸个数 Number of amino acids CsERF1* Csa1G000550 AT5G61890 ERF114 2 216 CsERF2 Csa1G042290 AT1G68550 ERF118 2 336 CsERF3 Csa1G075030 AT1G28360 ERF12 4 164 CsERF4 Csa1G075060 AT5G44210 ERF9 4 211 CsERF5 Csa1G269870 AT1G50680 - 5 339 CsERF6 Csa1G275920 AT1G16060 ADAP 6 363 CsERF7 Csa1G340430 AT1G15360 WIN1 7 223 CsERF8 Csa1G364460 AT5G11590 DREB3 9 250 CsERF9 Csa2G177210 AT3G23240 ERF1B 1 228 CsERF10 Csa1G597730 AT1G19210 ERF017 9 203 CsERF11* Csa1G605670 AT2G05990 MOD1 5 745 CsERF12* Csa2G001000 AT5G11590 DREB3 9 252 CsERF13 Csa2G006270 AT1G15360 WIN1 7 246 CsERF14* Csa2G092800 AT5G17430 BBM 6 650 CsERF15 Csa2G138780 AT4G13620 ERF062 10 400 CsERF16 Csa1G423190 AT5G57390 AIL5 6 466 CsERF17 Csa2G177220 AT3G23230 ERF098 1 126 CsERF18 Csa2G279250 AT4G36920 AP2 6 483 CsERF19* Csa2G279260 AT2G23340 ERF008 9 159 CsERF20* Csa2G297760 AT2G33710 ERF112 2 285 CsERF21* Csa2G307850 AT1G78080 RAP2-4 10 362 CsERF22 Csa2G349090 AT1G12980 ESR1 4 358 CsERF23* Csa2G354000 AT4G37750 ANT 6 696 CsERF24 Csa2G356600 AT1G46768 RAP2-1 9 142 CsERF25* Csa2G363010 AT1G75490 DREB2D 8 212 CsERF26 Csa2G374590 AT5G11590 DREB3 9 231 CsERF27 Csa2G382540 AT5G25190 ERF003 7 175 CsERF28* Csa2G382550 AT5G25190 ERF003 7 164 CsERF29* Csa2G401240 AT1G22810 ERF019 9 148 CsERF30* Csa3G017320 AT4G17500 ERF1A 1 279 CsERF31 Csa3G135120 AT3G23240 ERF1B 1 228 CsERF32 Csa3G018320 AT4G17490 ERF6 1 344 CsERF33 Csa3G019400 AT2G44940 ERF034 9 214 CsERF34 Csa3G042390 AT5G52020 ERF025 9 170 CsERF35 Csa3G073900 AT3G20310 ERF7 4 214 CsERF36* Csa3G114470 AT5G65510 AIL7 6 283 CsERF37 Csa3G116720 AT2G44840 ERF13 1 144 CsERF38 Csa3G116730 AT2G44840 ERF13 1 157 CsERF39 Csa3G389850 AT3G23240 ERF1B 1 224 CsERF40* Csa3G120390 AT4G27950 CRF4 3 283 CsERF41 Csa3G124760 AT5G19790 RAP2-11 3 243 CsERF42 Csa3G133130 AT1G68550 ERF118 2 213 CsERF43 Csa3G135620 AT3G23230 ERF098 1 158 CsERF44 Csa3G135630 AT3G23230 ERF098 1 133 CsERF45 Csa3G152130 AT5G18560 ERF086 4 326 CsERF46* Csa3G164580 AT3G16770 RAP2-3 2 225 CsERF47 Csa3G180260 AT4G25470 DREB1C 9 213 CsERF48* Csa3G207390 AT4G34410 ERF109 2 274 CsERF49 Csa3G357110 AT4G27950 CRF4 3 326 CsERF50* Csa3G118010 AT2G44940 ERF034 9 230 CsERF51 Csa3G630280 AT4G13040 - 10 234 CsERF52 Csa3G646560 AT3G14230 RAP2-2 2 370 CsERF53* Csa3G652380 AT1G72570 AIL1 6 490 CsERF54 Csa3G736760 AT2G28550 RAP2-7 6 527 CsERF55*# Csa3G751430 AT2G36450 ERF024 9 183 CsERF56* Csa3G751440 AT4G25490 DREB1B 9 204 CsERF57 Csa3G812170 AT3G57600 DREB2F 8 333 CsERF58* Csa3G822440 AT2G41710 - 6 432 CsERF59 Csa3G827310 AT3G54320 WRI1 6 337 CsERF60 Csa3G865380 AT1G75490 DREB2D 8 184 CsERF61 Csa3G878210 AT5G25390 SHN3 7 194 CsERF62 Csa3G895680 AT4G32800 ERF043 9 227 CsERF63 Csa4G001970 AT3G16770 RAP2-3 2 272 CsERF64 Csa4G004960 AT1G15360 WIN1 7 190 CsERF65 Csa4G006210 AT5G25190 ERF003 7 180 CsERF66 Csa4G007070 AT1G28160 ERF087 4 227 CsERF67 Csa4G007650 AT1G71450 ERF021 9 179 CsERF68 Csa4G023020 AT5G61600 ERF104 1 194 CsERF69 Csa4G051360 AT4G23750 CRF2 3 319 CsERF70 Csa4G192030 AT5G19790 RAP2-11 3 225 CsERF71 Csa4G268100 AT5G19790 RAP2-11 3 211 CsERF72* Csa4G290800 AT1G51190 PLT2 6 615 CsERF73 Csa4G292470 AT2G28550 RAP2-7 6 456 CsERF74 Csa4G314390 AT2G40340 DREB2C 8 372 CsERF75 Csa4G370550 AT1G21910 ERF012 9 232 CsERF76 Csa4G630010 AT3G15210 ERF4 4 193 CsERF77 Csa4G641590 AT3G50260 ERF011 9 149 CsERF78* Csa4G644740 AT4G37750 ANT 6 573 CsERF79 Csa4G649620 AT1G74930 ERF018 9 186 CsERF80 Csa4G652640 AT5G25190 ERF003 7 203 CsERF81 Csa5G139630 AT4G27950 CRF4 3 268 CsERF82 Csa5G146300 AT5G19790 RAP2-11 3 210 CsERF83 Csa5G150420 AT1G64380 ERF061 10 304 CsERF84 Csa5G151530 AT4G23750 CRF2 3 318 CsERF85 Csa5G155560 AT5G52020 ERF025 9 252 CsERF86* Csa5G155570 AT4G25470 DREB1C 9 225 CsERF87 Csa5G165850 AT4G17500 ERF1A 1 250 CsERF88 Csa5G167110 AT5G07580 ERF106 1 160 CsERF89* Csa5G167120 AT5G51190 ERF105 1 235 CsERF90 Csa5G174570 AT5G51990 DREB1D 9 200 CsERF91 Csa5G175970 AT2G28550 RAP2-7 6 441 CsERF92 Csa5G598600 AT1G24590 ESR2 4 341 CsERF93 Csa5G608380 AT1G68840 RAV2 5 344 CsERF94 Csa5G609620 AT1G68550 ERF118 2 309 CsERF95* Csa5G612310 AT3G54320 WRI1 6 439 CsERF96* Csa5G637750 AT5G19790 RAP2-11 3 395 CsERF97 Csa5G647260 AT5G25810 TINY 9 163 CsERF98 Csa5G649870 AT1G33760 ERF022 9 163 CsERF99 Csa5G649890 AT1G71450 ERF021 9 192 CsERF100* Csa6G011730 AT2G40220 ABI4 8 305 CsERF101 Csa6G012810 AT2G40340 DREB2C 8 410 CsERF102 Csa6G167230 AT1G50640 ERF3 4 219 CsERF103* Csa6G040610 AT1G21910 ERF012 9 201 CsERF104 Csa6G042450 AT2G46310 CRF5 3 243 CsERF105* Csa6G055940 AT5G61890 ERF114 2 404 CsERF106 Csa6G091830 AT5G13330 ERF113 2 191 CsERF107 Csa6G104640 AT4G32800 ERF043 9 213 CsERF108* Csa6G124180 AT2G40340 DREB2C 8 179 CsERF109 Csa6G133770 AT4G27950 CRF4 3 281 CsERF110* Csa6G017030 AT5G61890 ERF114 2 310 CsERF111* Csa6G296960 AT2G28550 RAP2-7 6 497 CsERF112 Csa6G318160 AT3G16770 RAP2-3 2 231 CsERF113 Csa6G361330 AT1G19210 ERF017 9 213 CsERF114 Csa6G404260 AT3G54320 WRI1 6 366 CsERF115 Csa6G421660 AT1G50640 ERF3 4 214 CsERF116#* Csa6G450420 AT2G36450 ERF024 9 224 CsERF117* Csa6G486790 AT5G61890 ERF114 2 338 CsERF118 Csa6G490860 AT4G34410 ERF109 2 193 CsERF119 Csa6G491020 AT4G36920 AP2 6 537 CsERF120* Csa6G491030 AT5G67190 ERF010 9 173 CsERF121* Csa6G496390 AT4G37750 ANT 6 629 CsERF122 Csa6G500550 AT1G78080 RAP2-4 10 271 CsERF123 Csa6G518040 AT3G15210 ERF4 4 246 CsERF124 Csa6G518290 AT5G47220 ERF2 1 177 CsERF125 Csa6G518300 AT4G18450 ERF091 1 277 CsERF126 Csa7G047400 AT2G20880 ERF053 10 397 CsERF127 Csa7G049230 AT5G44210 ERF9 4 209 CsERF128* Csa7G073700 AT4G34410 ERF109 2 256 CsERF129 Csa7G352440 AT4G13040 - 10 231 CsERF130 Csa7G375820 AT3G23240 ERF1B 1 231 CsERF131 Csa7G375830 AT3G23230 ERF098 1 148 CsERF132* Csa7G431330 AT1G16060 ADAP 6 367 CsERF133 Csa7G432080 AT5G25190 ERF003 7 196 CsERF134 Csa7G432130 AT1G80580 ERF084 3 183 CsERF135 Csa7G447150 AT5G11590 DREB3 9 201 CsERF136* Csa7G448110 AT1G53910 RAP2-12 2 389 CsERF137 CsaUNG003730 AT5G13910 LEP 4 228 CsERF138* CsaUNG031640 AT1G13260 RAV1 5 317