绵羊SMAD1基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析

田志龙,汤继顺,孙庆,王玉琴,张效生,张金龙,储明星

Tissue Expression and Polymorphism of Sheep SMAD1 Gene and Their Association with Litter Size

TIAN ZhiLong,TANG JiShun,SUN Qing,WANG YuQin,ZHANG XiaoSheng,ZHANG JinLong,CHU MingXing

表3 SMAD1基因不同位点在不同绵羊品种中的群体遗传学分析

Table 3 Population genetic analysis of different loci at SMAD1 gene

位点 Locus 品种 Breed 基因型频率 Genotype frequency 基因频率 Allele frequency 多态信息含量（PIC） Polymorphism information content 杂合度 （HE） Heterozygosity (HE) 有效等位 基因数 Effective number of allele (NE) 卡方值（P） χ2 test (P value) g.12485895A>G AA AG GG A G 小尾寒羊 Small Tail Han sheep 0.33 0.44 0.23 0.55 0.45 0.37 0.49 1.98 0.02 湖羊 Hu sheep 0.35 0.54 0.11 0.62 0.38 0.36 0.47 1.89 0.12 草原型藏羊 Prairie Tibetan sheep 0.58 0.32 0.10 0.73 0.27 0.31 0.39 1.64 0.02 策勒黑羊 Cele black sheep 0.06 0.50 0.44 0.31 0.69 0.34 0.43 1.74 0.21 苏尼特羊 Sunite sheep 0.29 0.48 0.23 0.52 0.48 0.37 0.50 2.00 0.83 滩羊 Tan sheep 0.27 0.41 0.32 0.48 0.52 0.37 0.50 2.00 0.40 g.12487558G>A AA GA GG A G 小尾寒羊 Small Tail Han sheep 0.25 0.43 0.32 0.47 0.53 0.37 0.50 1.99 0.01 湖羊 Hu sheep 0.18 0.34 0.48 0.36 0.64 0.35 0.46 1.85 0.00 草原型藏羊 Prairie Tibetan sheep 0.10 0.40 0.50 0.30 0.70 0.33 0.42 1.73 0.60 策勒黑羊 Cele black sheep 0.35 0.52 0.13 0.61 0.39 0.36 0.48 1.91 0.53 位点 Locus 品种 Breed 基因型频率 Genotype frequency 基因频率 Allele frequency 多态信息含量（PIC） Polymorphism information content 杂合度 （HE） Heterozygosity (HE) 有效等位 基因数 Effective number of allele (NE) 卡方值（P） χ2 test (P value) 苏尼特羊 Sunite sheep 0.33 0.29 0.38 0.48 0.52 0.37 0.50 2.00 0.05 滩羊 Tan sheep 0.41 0.45 0.14 0.64 0.36 0.36 0.46 1.86 0.93 g.12508874T>C CC CT TT C T 小尾寒羊 Small Tail Han sheep 0.61 0.34 0.05 0.78 0.22 0.29 0.35 1.53 0.64 湖羊 Hu sheep 0.34 0.50 0.16 0.59 0.41 0.37 0.48 1.94 0.67 草原型藏羊 Prairie Tibetan sheep 0.56 0.38 0.06 0.75 0.25 0.31 0.38 1.60 0.94 策勒黑羊 Cele black sheep 0.58 0.38 0.04 0.77 0.23 0.29 0.36 1.55 0.55 苏尼特羊 Sunite sheep 0.57 0.38 0.05 0.76 0.24 0.30 0.36 1.57 0.82 滩羊 Tan sheep 0.73 0.27 0.00 0.86 0.14 0.21 0.24 1.31 0.46 g.12487467A>G AA GA GG A G 小尾寒羊 Small Tail Han sheep 0.54 0.30 0.16 0.69 0.31 0.34 0.43 1.75 0.00 湖羊 Hu sheep 0.62 0.33 0.05 0.78 0.22 0.28 0.34 1.52 0.84 草原型藏羊 Prairie Tibetan sheep 0.65 0.25 0.10 0.78 0.22 0.28 0.34 1.52 0.00 策勒黑羊 Cele black sheep 0.22 0.55 0.23 0.49 0.51 0.37 0.50 2.00 0.46 苏尼特羊Sunite sheep 0.43 0.38 0.19 0.62 0.38 0.36 0.47 1.88 0.42 滩羊 Tan sheep 0.29 0.38 0.33 0.48 0.52 0.37 0.50 2.00 0.28 g.12487190G>T GG GT TT G T 小尾寒羊 Small Tail Han sheep 0.45 0.41 0.14 0.65 0.35 0.35 0.45 1.83 0.08 湖羊 Hu sheep 0.61 0.34 0.05 0.78 0.22 0.28 0.34 1.52 0.90 草原型藏羊 Prairie Tibetan sheep 0.62 0.29 0.09 0.77 0.23 0.29 0.35 1.55 0.00 策勒黑羊 Cele black sheep 0.19 0.58 0.23 0.48 0.52 0.37 0.50 2.00 0.26 苏尼特羊 Sunite sheep 0.38 0.48 0.14 0.62 0.38 0.36 0.47 1.89 0.96 滩羊 Tan sheep 0.27 0.41 0.32 0.48 0.52 0.37 0.50 2.00 0.40