干酪乳杆菌CRISPR基因座分析

杨兰,杨洋,李伟勋,ObaroakpoJOY,逄晓阳,吕加平

CRISPR Locus Analysis of Lactobacillus casei

YANG Lan,YANG Yang,LI WeiXun,OBAROAKPO JOY,PANG XiaoYang,LÜ JiaPing

表1 6株干酪乳杆菌CRISPR序列情况

Table 1 Six strains of L. casei CRISPR sequence

菌株 Strain CRISPR长度 Length of CRISPR Spacer数量 Number of spacer DR序列长度 Length of DR sequence DR序列 DR sequence Cas L. casei ZHANG 1092 16 36 GTCTCAGGTAGATGTCGAATCAATCAGTTCAAGAGC Cas9, Cas1, Cas2, Csn2 L. casei ZHANG 145 1 46 GGGGTCCTTATGAGCAGGTTTCTGCGCCTGTTTGCGCGTTTCGAAA 无 No L. casei ZHANG 109 1 27 GGTCCTTACACGTAGGTTTCTGGTCTG 无 No L. casei ZHANG 116 1 31 CTTTGGTCGTTTAGGTTCGAGGTCCTTATGC 无 No L. casei ZHANG 121 1 33 CGGTTTCTAAACGCGTTCGCCACCCCAGAAACC 无 No L. casei ZHANG 107 1 29 GGTCCTTATGTGTAGGTTTCTGGGCCAGC 无 No L. casei ZHANG 质粒 plca36 78 1 24 AAAGTCCGCATGACTTCGTTGAAA 无 No L. casei BD-Ⅱ 1422 21 36 GTCTCAGGTAGATGTCGAATCAATCAGTTCAAGAGC Cas9, Cas1, Cas2, Csn2 L. casei BL23 1422 21 36 GTCTCAGGTAGATGTCGAATCAATCAGTTCAAGAGC Cas9, Cas1, Cas2, Csn2 L. casei LC2W 1422 21 36 GTCTCAGGTAGATGTCGAATCAATCAGTTCAAGAGC Cas9, Cas1, Cas2, Csn2 L. casei W56 1424 21 36 GTCTCAGGTAGATGTCGAATCAATCAGTTCAAGAGC Cas9, Cas1, Cas2, Csn2 L. casei LOCK919 762 11 36 GTCTCAGGTAGATGTCGAATCAATCAGTTCAAGAGC Cas9, Cas1, Cas2, Csn2 L. casei LOCK919 质粒 pLOCK919 146 2 26 CGGGAAACCGAAAATCGGTCGCCCGC 无 No