基于SSR标记的谷子主要农艺性状关联位点检测及等位变异分析

李剑峰,张博,全建章,王永芳,张小梅,赵渊,袁玺垒,贾小平,董志平

Associated Loci Detection and Elite Allelic Variations Analysis of Main Agronomic Traits in Foxtail Millet (Setaria italica L.) Based on SSR Markers

JianFeng LI,Bo ZHANG,JianZhang QUAN,YongFang WANG,XiaoMei ZHANG,Yuan ZHAO,XiLei YUAN,XiaoPing JIA,ZhiPing DONG

表3 4个地理环境GLM、MLM模型关联分析结果

Table 3 Association analysis results of GLM and MLM models at four geographical environments

性状 Traits 关联标记 Associated markers 染色体 Chromosome 显著性检验值（P） Significance test value (P) 表型贡献率（R2） Phenotypic variation (R2) 环境 Environments 年份 Years 模型 Model GW SW PL b115 2 9.99E-04 0.021 9.99E-04 0.013 0.0317 1.54E-04 0.4355 0.2456 0.4661 0.2521 0.0807 0.2421 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 2015 2016 2015 2016 2015 2016 GLM MLM NL MPGC13 7 9.99E-04 9.99E-04 0.24 0.3156 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 2015 2016 GLM PL PH NL SN p6 8 9.99E-04 0.025 0.0057 0.0118 0.0123 8.46E-04 0.033 0.0171 0.0127 0.015 0.1958 0.1712 0.0718 0.1109 0.0701 0.1591 0.0778 0.0774 0.0943 0.1031 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 洛阳Luoyang 洛阳Luoyang 2015 2016 2015 2016 2015 2016 2015 2016 2015 2016 GLM MLM PL sigms9034 6 9.99E-04 0.009 0.2361 0.1898 洛阳Luoyang 洛阳Luoyang 2015 2016 GLM PL SN b125 5 0.026 0.014 0.0094 0.0073 0.2717 0.2409 0.1405 0.1645 洛阳Luoyang 洛阳Luoyang 洛阳Luoyang 洛阳Luoyang 2015 2016 2015 2016 GLM MLM HS b227 1 9.99E-04 9.99E-04 0.0372 0.0308 0.2460 0.3075 0.0999 0.0811 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 2015 2016 2015 2016 GLM MLM HS b194 9 0.01 0.032 0.1537 0.0874 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 2015 2016 MLM HS p56 2 0.0215 0.0204 0.1202 0.0936 吉林Jilin 公主岭Gongzhuling 2015 2016 MLM SW P18 5 0.0117 0.0039 0.0861 0.1044 乐东Ledong 乐东Ledong 2015 2016 MLM SW p59 未知 Unknown 0.0452 0.016 0.0894 0.1171 乐东Ledong 乐东Ledong 2015 2016 MLM