流感病毒是一种分节段的、有囊膜包裹的负链RNA病毒，属于正黏病毒科。根据其内部NP和M的不同，分为A、B、C三型
[1]。到目前为止，禽流感（avian influenza，AI）只由A型流感病毒引起，B、C型流感病毒尚未在禽类体内发现。自然界中，A型流感病毒的宿主范围相当广泛，猪、马、虎、水貂、狐狸、猫、鲸、禽类以及人体内都分离到A型流感病毒，是人畜共患的重要呼吸道疾病病原，具有特殊的重要性。
A型流感病毒基因组由8个片段组成，从大到小依次为PB2、PB1、PA、HA、NP、NA、M、NS，共编码11种病毒蛋白[2]。HA、NA与NP、M1、M2、PB1、PB2、PA共同构成病毒的组成成分，根据HA的不同将A型流感病毒进一步分为18个亚型。其中，H1—H16都能在禽类中发现，而H17—H18目前只在蝙蝠体内发现[3]。不同宿主中亚型分布存在差异，H1、H3在人群中广泛传播，H5、H7、H9在家禽体内流行广泛，野生水禽则是AIV的主要自然宿主，可以分离到H1—H16亚型的病毒，病毒在水禽体内长期存在而不表现明显临床症状。NS1蛋白能够直接调控病毒的复制过程，NS2介导病毒核糖核蛋白复合物的转运过程。后发现的PB1-F2蛋白与流感病毒介导的细胞凋亡有关[4]。
众所周知，1918年的西班牙H1N1流感，造成了美国50万人死亡，全球至少5 000万人死亡。近来利用反向遗传技术救获的来源于 1918 年流感基因的病毒相关研究表明，在动物模型中，1918年流感病毒 HA 基因对小鼠模型毒性增强起到了重要作用[5]。另外，1957 年亚洲H2N2流感造成 100 万人死亡，1968 年香港H3N2流感估计造成200万人死亡。2009 年暴发的 H1N1 大流感，到 2010年4月23日共引起超过17 853人死亡，该毒株致死率不高，但新病毒以前所未有的速度传播，在大约8周内传播到120个国家和地区，几乎所有国家都有报道。流感病毒对人类健康、社会发展和经济增长具有巨大影响及冲击。
禽流感是A型流感病毒感染各种禽类的总称，对家禽养殖业危害非常严重。根据致病性不同，禽流感又划分为高致病性禽流感（high pathogenic avian influenza，HPAI）和低致病性禽流感（low pathogenic avian influenza，LPAI）。影响最大的是H5亚型HPAI，已在60多个国家的家禽和野鸟中检测出该亚型病毒，而且，在一些国家，主要是中国、印度、印度尼西亚、孟加拉国、埃及和越南，H5N1亚型禽流感已经发展成为危害养禽业健康发展的头号重要病原。不仅仅是H5N1，与H5亚型组合的还有2008年台湾爆发的H5N2亚型AI疫情[6]，2014年初在日本和韩国爆发的H5N8亚型AI[7]，今年美国也受到H5N8的严重影响，给养禽业造成重大损失。除H5亚型外，H7亚型HPAI也对家禽造成严重危害，2003年，荷兰、比利时以及德国等国家出现H7N7亚型HPAI[8]，短短几周，荷兰共有约900个农场内的1 400万只家禽被隔离，1 800多万只病鸡被宰杀，引发H7N7禽流感蔓延欧洲。LPAI病毒通常不引起明显临床症状，但可引起鸡群生产性能下降，伴有其他疾病混合感染，环境影响时可造成严重后果，目前家禽体内流行广泛的LPAI以H9亚型为主。该亚型1966 年被报道引起威斯康星州火鸡发病以来，已在多个国家被分离和报道，可以感染多种禽类，如鸡、鸭、鹌鹑、野鸡、鹧鸪、鸽、丝羽乌骨鸡、欧石鸡等。中国1994年首次分离到了H9N2亚型病毒，临床表现为禽产蛋量下降，死亡率不高。
禽流感除直接影响养禽业的发展外，还出现了直接感染人，引起严重的公共卫生的问题。1997年香港首次爆发了H5N1亚型HPAI跨越宿主屏障直接感染人并致死亡的事件[9]，截止到2015年5月，全球共报告了人感染高致病性H5N1禽流感840例，其中死亡447例。病例分布于16个国家，其中，中国发现52例，死亡31例[10]。感染H5N1禽流感的多为年轻人和儿童。从1996—2012 年间，在荷兰、意大利、加拿大、美国、墨西哥和英国有报告人感染H7N2、H7N3 和 H7N7亚型流感病毒的事件，除荷兰有1人死亡以外，其他感染者大多仅有结膜炎和轻微的上呼吸道症状。在2013年3月，中国首次出现了人感染H7N9亚型流感病例，患者临床表现均类似于流感症状，早期主要为呼吸道症状，体温升高、咳嗽等症状，很快变成严重肺炎并出现呼吸困难。这是第一次报告人感染该亚型病毒，对人类健康造成了严重危害，引起广泛关注的事例。此外，还陆续发现了H9N2和H10N8等亚型AI感染人事件，控制其在家禽中流行以降低传播给人类的潜在风险是十分必要的。
禽流感病毒不仅可以跨越种间障碍直接感染人，还为人的新型流感病毒提供供体基因。有证据表明 1918 年西班牙大流感是由 H1N1 禽流感传染给人类而引起的；1957 年亚洲大流感是由 人H1N1流感重组了禽H2N2流感PB1、HA 和 NA三个基因片段而引起的；1968 年，人H3N2亚型流感是由禽源 H3病毒提供 PB1和HA基因，由1957年大流感提供其他内部基因而形成的重组毒株，重组后成为一个新的大流行毒株；2009年H1N1大流感是来源于北美猪群中流行的三源重组毒[11]，其PB2和PA来源于禽类；2013年人感染的H7N9流感病毒，其内部基因来自于H9N2禽流感病毒[12]。人类历史上出现的这几次大流行的流感病毒都与禽流感密切相关。
本专题围绕目前中国兽医行业内流感研究工作新进展，集中报道了来自禽或猪体内流感病毒的生物信息学、致病机理和诊断技术等方面的研究成果。通过学术交流和讨论，加大对流感的宣传，促进公众对流感的认知，有助于提高人类对流感的防范意识，尽可能降低流感对社会秩序、食品安全和人类自身健康造成的冲击和负面影响。
