%A 马亚茹,冯建灿,刘崇怀,樊秀彩,孙海生,姜建福,张颖 %T 葡萄无核性状的SSR新分子标记开发及应用 %0 Journal Article %D 2018 %J 中国农业科学 %R 10.3864/j.issn.0578-1752.2018.13.017 %P 2622-2630 %V 51 %N 13 %U {https://www.chinaagrisci.com/CN/abstract/article_20196.shtml} %8 2018-07-01 %X 目的发葡萄无核性状的SSR新分子标记,对葡萄杂种后代进行早期无核性状鉴定,为分子标记辅助育种奠定基础。方法对母本‘红地球’与父本‘森田尼无核’及F1代杂交群体的133份葡萄材料进行RAD-seq,将测序结果比对到参考基因组上;运用SAMtools软件生成CaSFS软件所需的pileupglf文件过滤获得亲本之间的有效SNP采用窗口滑动的方法,确定每个窗口的基因型,选择以每15SNP为一个窗口,每次滑动一个SNP,得到每个个体的基因型并生成bin对生成的bin采用拟测交的方式利Joinmap软件进行连锁分析,构建‘红地球’与‘森田尼无核’遗传连锁图谱;用WindowQTLCartographer2.0软件进行QTL定位,在定位区间通过Perl程序语言找到符合SSR特征序列的35个SSR分子标记,用Primer premier5.0软件设计35个SSR分子标记引物对,通过HRM技术筛选亲本之间在无核性状上存在差异的SSR分子标记,并在131株F1代杂交群体及65个葡萄品种的自然群体中检测无核分型正确率、无核检测率、无核保持率。结果在‘红地球’与‘森田尼无核’构建的遗传连锁图谱上,将葡萄无核性状定位在chr18号染色体上,定位区间26 835 84626 960 426,对无核的贡献率为77.9%LOD阈值为26.3。亲本之间在无核性状上存在差异的SSR分子标记为VvSD10,其在111 bp等位点能对葡萄无核性状进行鉴定,利用分子标记VvSD10上的111 bp等位点通过HRM技术在葡萄F1代杂交群体及自然群体中进行葡萄无核性状的鉴定。结果表明,分子标记VvSD10F1代杂交群体及自然群体中的无核分型正确率分别为97%94%其无核检测率均为56%,无核保持率分别为77%、85%结论分子标记VvSD10在遗传群体及自然群体中的无核分型均能提供较高的准确信息,为无核葡萄的分子标记辅助育种奠定了基础。