中国农业科学 ›› 2008, Vol. ›› Issue (12): 3983-3990 .doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.12.006

• 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学 • 上一篇    下一篇

小麦抗旱相关基因TaCRT-D单核苷酸多态性分析

王计平,毛新国,景蕊莲,李润植,昌小平

  

  1. 山西农业大学农学院
  • 收稿日期:2008-01-16 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-12-20 发布日期:2008-12-20
  • 通讯作者: 景蕊莲

  1. 山西农业大学农学院
  • Received:2008-01-16 Revised:1900-01-01 Online:2008-12-20 Published:2008-12-20

摘要:

【目的】钙网蛋白(CRT)是细胞内质网膜上的钙结合蛋白,参与多种细胞功能的调节。研究小麦钙网蛋白基因TaCRT-D单核苷酸多态性,并分析其与抗旱性的关系。【方法】以苗期抗旱性不同的37份六倍体普通小麦和3份普通小麦D基因组供体种粗山羊草为材料,通过直接测序分析TaCRT-D基因的单核苷酸多态性(SNP)及其与抗旱性的关系。【结果】TaCRT-D基因DNA长度为4 001 bp,在长达160 040 bp的核苷酸序列中共检测到105个单核苷酸变异位点,包括84个SNP和21个InDel,二者出现的频率分别为1/1 905和1/7 621,编码区的核苷酸多样性值(π)小于非编码区,说明编码区所承受的选择压力较大,遗传变异小于非编码区。单倍型分析表明,40份供试材料分为8种单倍型,其中单倍型H1中11份材料包括4份中等抗旱材料和7份干旱敏感材料;单倍型H3、H4和H7既有抗旱性强的材料也有干旱敏感材料;单倍型H5只包括3份小麦D基因组供体种材料。【结论】普通小麦TaCRT-D基因中SNP频率较低,TaCRT-D基因单核苷酸多态性与小麦苗期抗旱性之间没有明显的对应关系。

关键词: 小麦, TaCRT-D基因, 单核苷酸多态性, 单倍型, 抗旱性