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基于蔗糖代谢基因多态性的甘蔗基因型遗传多样性
- 许莉萍,阙友雄,苏亚春
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中国农业科学. 2011, 44(9):
1788-1797.
doi:10.3864/j.issn.0578-1752.2011.09.004
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多维度评价
【目的】探讨利用基于蔗糖代谢酶基因多态性的目标区域扩增多态性(target region amplification polymorphism, TRAP)标记进行甘蔗遗传多样性、遗传距离及遗传距离与糖分表型值关联性分析的可行性。【方法】利用4个根据参与蔗糖代谢酶基因SuSy、SPS、SAI 和PPDK设计的锚定引物和9个随机引物, 筛选具有多态性的17对引物组合, 对28个糖分性状表型不同的甘蔗基因型进行TRAP标记, 通过分子标记数据,估算不同基因型蔗糖代谢基因的遗传变异和遗传距离, 并进行聚类分析。【结果】共扩增出170个条带, 其中109个为多态性条带, 多态性比率为64.1 %, 平均每个引物组合产生10个条带, 6.4个多态性条带。在所测试的28个甘蔗基因型中, 基于蔗糖代谢酶基因多态性所估计的遗传相异系数(genetic dissimilarity, GD)为0.12—0.80。基于GD的UPGMA聚类结果显示, 在GD=0.49处,供试基因型可被划分为4类,但就所采集的特定时期的锤度数据而言,类间和类内的锤度表型值没有明显的规律。【结论】甘蔗不同基因型间4个蔗糖代谢酶基因遗传变异较高, 多态性丰富, 暗示TRAP技术在评价甘蔗蔗糖分性状方面具有应用潜力, 但与锤度表型值数据的关联性还有待进一步研究。